TCCCA Copy number

  FCG

  Home

  Gene

  Copy Number

  Mutation

  Transcript Fusion

  Recurrent Alteration

  Cancer Type

  Search

  Download

  Help

  About

Copy Number

The putative cancer-causing CDKs/Cyclins driven by SCNAs in each cancer type were identified by four criteria: 1) located in a peak region of a significantly recurrent focal SNCA locus estimated by the genomic identification of significant targets in cancer (GISTIC2) algorithm, (q≤0.25); 2) altered with high frequency and large amplitude (G-score ≥0.1); 3) mRNA reliably detected in at least 10% of tumor specimens in the given cancer type (90th percentile of FPKM value ≥1); and 4) mRNA significantly and positively correlated with copy numbers (Pearson P-value less than 0.001).

Summary of the G-score of the CDKs/Cyclins in each cancer type

Show entries each page Jump to page Total Page: 3 Total entries: 47
Showing page 3	first page \| previous page \| next page \| last page

HGNC	Ensembl	ACC		BLCA		BRCA		CESC		CHOL		COAD		DLBC		ESCA		GBM		HNSC		KICH		KIRC		KIRP		LAML		LGG		LIHC		LUAD		LUSC		MESO		OV		PAAD		PCPG		PRAD		READ		SARC		SKCM		STAD		TGCT		THCA		THYM		UCEC		UCS		UVM
Symbol	Gene ID	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del	Amp	Del
CCNF	ENSG00000162063	0.17	0.02	0.01	0.15	0.1	0.02	0.1	0.03	0	0.05	0.03	0.03	0.09	0	0.02	0.1	0.04	0.01	0.03	0.03	0	0	0.01	0	0.02	0	0	0	0.03	0	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.08	0.04	0.02	0.09	0.17	0.02	0.02	0	0.01	0.03	0	0.01	0.02	0.1	0.02	0.04	0.01	0.02	0.08	0	0	0	0	0	0	0.05	0.03	0.05	0.05	0	0
CCNG1	ENSG00000113328	0.29	0.04	0.02	0.11	0.06	0.05	0.04	0.03	0.09	0.01	0.01	0.03	0	0	0.05	0.03	0.01	0.06	0.01	0.06	0	0	0.32	0	0.04	0.01	0	0.04	0	0.08	0.11	0.06	0.05	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.17	0.19	0.02	0.01	0	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.1	0.08	0.03	0.12	0.03	0.04	0	0.01	0.01	0	0	0	0.02	0.05	0.15	0.01	0.04	0
CCNG2	ENSG00000138764	0.09	0	0.14	0.02	0.1	0.03	0.06	0.03	0	0.08	0.01	0.02	0	0.05	0.13	0.05	0	0.02	0.05	0.02	0	0	0.01	0	0	0.01	0	0.01	0	0.03	0.03	0.09	0.06	0.03	0.16	0.03	0	0.08	0.11	0.18	0.01	0	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.08	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03	0.02	0	0	0	0	0.04	0.01	0.05	0.05	0	0
CCNI	ENSG00000118816	0.09	0	0.14	0.03	0.11	0.02	0.06	0.03	0	0.08	0.01	0.02	0	0.05	0.13	0.05	0	0.01	0.06	0.02	0	0	0.01	0	0	0.01	0	0.01	0	0.03	0.03	0.09	0.06	0.03	0.17	0.03	0	0.08	0.14	0.16	0.01	0	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.07	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03	0.02	0	0	0	0	0.04	0.01	0.05	0.05	0	0
CCNI2	ENSG00000205089	0.32	0.02	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.09	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.05	0	0	0.28	0.01	0.03	0.01	0	0.1	0.01	0.04	0.09	0.04	0	0.08	0	0.06	0	0.05	0.11	0.19	0.01	0.04	0	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.04	0.05	0.01	0.09	0.02	0.09	0.01	0	0.01	0	0	0	0.01	0.02	0.15	0.04	0	0.03
CCNJ	ENSG00000107443	0	0	0.02	0.1	0.03	0.08	0	0.07	0.16	0.14	0	0.09	0	0.07	0.04	0.11	0	0.05	0	0.05	0	0	0	0.01	0	0.01	0	0	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.03	0.02	0.07	0	0.16	0.08	0.31	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.12	0	0.07	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.1	0.01	0	0	0.01	0	0.02	0.02	0.1	0.03	0.09	0	0
CCNO	ENSG00000152669	0.07	0.01	0.07	0.12	0.03	0.09	0.03	0.07	0	0.1	0.02	0.04	0	0	0.02	0.14	0	0.01	0.03	0.08	0.03	0	0	0	0.01	0	0	0.02	0	0.01	0.02	0.01	0.06	0.06	0.05	0.1	0.01	0.01	0.04	0.5	0	0.05	0	0.03	0.01	0.18	0.01	0.06	0.07	0.05	0.04	0.02	0.02	0.1	0	0.02	0	0	0	0	0.02	0.12	0.01	0.31	0	0

Showing page 3

first page | previous page | next page | last page

  TCGA

  GDC

  NCI