The Cancer LncRNome Atlas



Skin Cutaneous Melanoma (SKCM)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in SKCM

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000225978chr206173348361735738+
ENSG00000241624chr206219879462199958-
ENSG00000232442chr206225858062260177+
ENSG00000196421chr206266569762671315+
ENSG00000149656chr206292173862944485+
ENSG00000271308chr211116972011184046+
ENSG00000224905chr211539974215516789+
ENSG00000226751chr211613403116135411+
ENSG00000235609chr211619352916254296-
ENSG00000229047chr211633363016336554+
ENSG00000215386chr211744284217999716+
ENSG00000224141chr211993358320132321-
ENSG00000237484chr212580105425920256+
ENSG00000185433chr212675813326804013-
ENSG00000234883chr212693422126947480+
ENSG00000260583chr212695508226955638-
ENSG00000232692chr212775087127844017+
ENSG00000232079chr212942073329509930+
ENSG00000236532chr212948841329600986-
ENSG00000231125chr213043039430432416-
ENSG00000215533chr213056580130660526+
ENSG00000248476chr213072395530734215+
ENSG00000174680chr213112049431136321+
ENSG00000237594chr213293153732932800+
ENSG00000227256chr213365017433653299+
ENSG00000186842chr213394454833948191-
ENSG00000238197chr213410042634115433+
ENSG00000227757chr213428595734443410-
ENSG00000226527chr213448400534496009-
ENSG00000223799chr213463617834638565-
ENSG00000237945chr213528783835349992+
ENSG00000214955chr213544589235732332+
ENSG00000227456chr213555297835562220+
ENSG00000225555chr213574310135747647-
ENSG00000234380chr213611805436157183+
ENSG00000231106chr213737763637379899+
ENSG00000236830chr213750406537528605-
ENSG00000228107chr213773292837734338+
ENSG00000230479chr213780265837853368+
ENSG00000233818chr213781802937904706+
ENSG00000224790chr213833881238344128+
ENSG00000270116chr213847311438473643+
ENSG00000230366chr213858080438594037+
ENSG00000242553chr213859372038610045+
ENSG00000255568chr214068588740686886-
ENSG00000226496chr214251342742520060-
ENSG00000228318chr214281332142814669-
ENSG00000236384chr214313168043135935-
ENSG00000237232chr214342930343445060+
ENSG00000235772chr214398048443982044-
ENSG00000236663chr214456063344561202-
ENSG00000237989chr214477802744782229-
ENSG00000185186chr214488197444899414-
ENSG00000215458chr214522563945232448-
ENSG00000225331chr214557862345579959-
ENSG00000237604chr214559537245596336+
ENSG00000232124chr214562117345622579+
ENSG00000232698chr214562640845627282-
ENSG00000241728chr214574882745750104-
ENSG00000184441chr214575111745755734+
ENSG00000230061chr214583447345845155-
ENSG00000228709chr214590546045910171+
ENSG00000235890chr214592669045935738+
ENSG00000236519chr214622249246224632+
ENSG00000227039chr214634096646349593+
ENSG00000215447chr214670796746711653+
ENSG00000223768chr214671320046717269+
ENSG00000233922chr214701356847017005+
ENSG00000224413chr214745696647459721+
ENSG00000215424chr214764913147679304+
ENSG00000228137chr214766680447667596+
ENSG00000239415chr214767146347674047-
ENSG00000206195chr221614797916193004-
ENSG00000271127chr221617961716181004-
ENSG00000100181chr221708277717179521+
ENSG00000237438chr221751746017539682+
ENSG00000185837chr221764027417646335+
ENSG00000093100chr221827041818294263-
ENSG00000225335chr221855929318560563-
ENSG00000237517chr221895802719018755+
ENSG00000223461chr221910904219112016+
ENSG00000260924chr221915890819160345+
ENSG00000185065chr221943541619437628+
ENSG00000236540chr222005050320058045-
ENSG00000235578chr222033072620331888-
ENSG00000206176chr222037881420380440+
ENSG00000226287chr222105522021058894+
ENSG00000237476chr222131138021318967+
ENSG00000230513chr222135617521364631+
ENSG00000215498chr222152204721546445+
ENSG00000234503chr222153218121534164-
ENSG00000206142chr222165527921679331-
ENSG00000206140chr222182071221825558+
ENSG00000224086chr222229260922297799+
ENSG00000272216chr222263831222641586-
ENSG00000234630chr222264809822649159+
ENSG00000270041chr222408086524081476-
ENSG00000232545chr222449765224499317+
ENSG00000261188chr222690850326910534+
ENSG00000260065chr222691794926921002-
ENSG00000225783chr222704239227072438+
ENSG00000206028chr222706365627068617-
ENSG00000244625chr222706873027176170+
ENSG00000233521chr222761731027620688-
ENSG00000235954chr222831536428404569+
ENSG00000226471chr222919667129244547+
ENSG00000237015chr222965687829658026+
ENSG00000225465chr222983281829874115-
ENSG00000241528chr223077093030773862-
ENSG00000235989chr223131829531328436+
ENSG00000253352chr223136666331375381+
ENSG00000248603chr223149786231500743+
ENSG00000228839chr223168848531734007+
ENSG00000240529chr223183296331835893-
ENSG00000240591chr223185023731860190+
ENSG00000242082chr223260110232665653+
ENSG00000224050chr223266940732673173+
ENSG00000230736chr223277265132780330+
ENSG00000236054chr223297928632980190+
ENSG00000235237chr223756279737578890+
ENSG00000222044chr223842817238430235-
ENSG00000233739chr223845318738469947-
ENSG00000251267chr223861698238618939-
ENSG00000228274chr223906359039077825-
ENSG00000244491chr223913073039134770+
ENSG00000230149chr223913073539134995+
ENSG00000233899chr223953270439537189-
ENSG00000225528chr224035640140360687+
ENSG00000261202chr224043907240440534-
ENSG00000231993chr224157059541593460-
ENSG00000235513chr224160512641613631-
ENSG00000184068chr224222721942230669-
ENSG00000260655chr224231802742319104-
ENSG00000270083chr224248563442486032-
ENSG00000237037chr224248693742533614+
ENSG00000182057chr224266575942671202+
ENSG00000233903chr224267236142673057+
ENSG00000229891chr224276040642765242-
ENSG00000172250chr224289658542908566+
ENSG00000230319chr224343459143448372+
ENSG00000261251chr224420833644213274+
ENSG00000226328chr224552971045559662-
ENSG00000231711chr224643614646440733-
ENSG00000241990chr224644958546453090+
ENSG00000231010chr224645162046454040-
ENSG00000235159chr224646323646465771-
ENSG00000234869chr224693739246944093+
ENSG00000260708chr224715779147158460-
ENSG00000205634chr224801679248027318-
ENSG00000224271chr224802742348251349+
ENSG00000213279chr224996591249969074-
ENSG00000205559chr225102145551022306+
ENSG00000224318chr3237441239024-
ENSG00000234661chr3405053427478-
ENSG00000224957chr3577914887698+
ENSG00000224239chr3898807899774+
ENSG00000271870chr331946263195119+
ENSG00000231249chr345325754534847-
ENSG00000235831chr349384935021646-
ENSG00000233912chr351985905229014-
ENSG00000270207chr376485777649584-
ENSG00000227110chr379944928653610-
ENSG00000237697chr386134688615561+
ENSG00000254485chr393342729404987-
ENSG00000206573chr393913739440263-
ENSG00000269886chr398544469854781-
ENSG00000269894chr399773909977942+
ENSG00000230082chr399890889996471+
ENSG00000269982chr31000040110004223+
ENSG00000206567chr31004810210052893-
ENSG00000231177chr31032610310327430+
ENSG00000240288chr31032743810335133+
ENSG00000157152chr31204587612232900+
ENSG00000272263chr31287371812874227-
ENSG00000244502chr31351848213521553-
ENSG00000228242chr31418622314189784+
ENSG00000144596chr31453061914583588-
ENSG00000225733chr31496185414989931-
ENSG00000224660chr31529569115306000+
ENSG00000249786chr31547767815485576-
ENSG00000271964chr31635594616356494+
ENSG00000272498chr31638081516381378+
ENSG00000272529chr31638663316387947+
ENSG00000228956chr31848651618959184+
ENSG00000237485chr32021573620227919+
ENSG00000272511chr32145371421455436-
ENSG00000228791chr32453557824541833+
ENSG00000271943chr32767980627680267+
ENSG00000272282chr32775440127755496+
ENSG00000228214chr32861628228799831+
ENSG00000235904chr32930568529332217-
ENSG00000261468chr33073915330741068+
ENSG00000261572chr33227818032280070-
ENSG00000271051chr33293857632939318+
ENSG00000271324chr33383513633835637-
ENSG00000271643chr33383718033838442-
ENSG00000271020chr33383864133839173-
ENSG00000271835chr33702653437026975-
ENSG00000272258chr33722057937220861+
ENSG00000271993chr33722359837224225+
ENSG00000270194chr33728328037285668-
ENSG00000235257chr33778692337903271-
ENSG00000229589chr33849251838496311-
ENSG00000270674chr33853221538534633+
ENSG00000223797chr34035529340494820-
ENSG00000272452chr34050795740510078+
ENSG00000230084chr34264345542695880-
ENSG00000230970chr34274414542748154+
ENSG00000173811chr34277406742788260+
ENSG00000271941chr34338841543389135-
ENSG00000234617chr34339113643393454-
ENSG00000271192chr34403838844038935+
ENSG00000272121chr34403957344040641-
ENSG00000261786chr34415879144163857+
ENSG00000271937chr34437943344380044-
ENSG00000236869chr34459884944727145-
ENSG00000233509chr34465862044666289-
ENSG00000272077chr34470890444710856+
ENSG00000230530chr34572053545730626-
ENSG00000223552chr34640644646448550-
ENSG00000227398chr34720598747288091+
ENSG00000260236chr34742057947422489-
ENSG00000244380chr34848176248488060-
ENSG00000271973chr34870988848710166+
ENSG00000224424chr34888500548889414+
ENSG00000223343chr34902248249027421-
ENSG00000272434chr34906674949067139+
ENSG00000235908chr34940257849404439-
ENSG00000235261chr34946037949461864+
ENSG00000259970chr34972191349722416-
ENSG00000235016chr35015345550193518-
ENSG00000188338chr35024267950258411+
ENSG00000230454chr35029773550300790+
ENSG00000232352chr35030407350304803-
ENSG00000012171chr35030499050314977+
ENSG00000271858chr35040276550405628+
ENSG00000243224chr35227327452275113+
ENSG00000271976chr35389302153895603-
ENSG00000272202chr35711297157114129+
ENSG00000272146chr35758344257586654+
ENSG00000244161chr35814827458156363-
ENSG00000272182chr35841398258414542+
ENSG00000272360chr35847655758477018-
ENSG00000241472chr36224654062355005-
ENSG00000244342chr36293610563110738+
ENSG00000239653chr36398969863997824+
ENSG00000271843chr36399375863994368-
ENSG00000272181chr36400518464005601+
ENSG00000241684chr36467058564997143+
ENSG00000241316chr36770512167998137+
ENSG00000244513chr36906309269105773+
ENSG00000240405chr37004872870064469+
ENSG00000241163chr37208445172291716-
ENSG00000242516chr37572154275728454+
ENSG00000239445chr39843317498451495-
ENSG00000240476chr39869990298701940+
ENSG00000261533chr39989841199900574+
ENSG00000214407chr3101659703101716770+
ENSG00000241280chr3101679202101716770+
ENSG00000242759chr3106555658106959488-
ENSG00000243701chr3106959539107045811+
ENSG00000239828chr3106991458107101007-
ENSG00000271856chr3107844668107857457+
ENSG00000261364chr3108895285108896212-
ENSG00000214381chr3108897012108904104+
ENSG00000242242chr3110612555110790400-
ENSG00000261488chr3111852270111854206+
ENSG00000239482chr3112021325112051638+
ENSG00000240057chr3112738379112902148+
ENSG00000243795chr3112861197112886666-
ENSG00000259976chr3114033348114035026-
ENSG00000241560chr3114070658114107825+
ENSG00000241155chr3119033140119041607-
ENSG00000242622chr3119813742119855630+
ENSG00000239523chr3123304389123363415+
ENSG00000260391chr3124442635124445172+
ENSG00000241288chr3125546081125607696-
ENSG00000248787chr3125626848125629115-
ENSG00000250012chr3125803063125814192+
ENSG00000250934chr3125985639126010122+
ENSG00000244300chr3128208055128221191+
ENSG00000261159chr3128578559128579369-
ENSG00000231305chr3128580156128590383-
ENSG00000206417chr3129034235129045068+
ENSG00000271270chr3129612714129637418+
ENSG00000248243chr3129808276129813147-
ENSG00000249846chr3129831393129839422+
ENSG00000261167chr3131173970131177442-
ENSG00000248468chr3131236675131239724+
ENSG00000260633chr3134066130134068075-
ENSG00000240086chr3135074909135158730-
ENSG00000239213chr3136560568136580896-
ENSG00000248932chr3139108657139302161+
ENSG00000244124chr3141637094141637863-
ENSG00000269905chr3141663270141666233-
ENSG00000268129chr3142719749142720309-
ENSG00000241679chr3142842204142850735+
ENSG00000261051chr3145777372145779466-
ENSG00000240032chr3145784131145786972-
ENSG00000240541chr3149095565149104370+
ENSG00000241313chr3149374807149379151+
ENSG00000261050chr3150181245150184218+
ENSG00000240137chr3150421351150437933+
ENSG00000241732chr3152557179152559228+
ENSG00000241220chr3153074896153091975+
ENSG00000238755chr3153102723153697975-
ENSG00000243069chr3153742190153839121-
ENSG00000239508chr3155166973155175542+
ENSG00000243926chr3156389651156392167-
ENSG00000240875chr3156465135156534851-
ENSG00000243629chr3156799456156840793-
ENSG00000241135chr3156807670156818924+
ENSG00000243176chr3156893012157099054+
ENSG00000272087chr3158410909158411557-
ENSG00000272440chr3158413156158413370+
ENSG00000240207chr3158450052158501859+
ENSG00000271778chr3158500336158500913+
ENSG00000272247chr3158519046158519724-
ENSG00000260572chr3160471216160472930-
ENSG00000269888chr3161146900161147401+
ENSG00000270141chr3169482308169482848-
ENSG00000269889chr3169487437169489831+
ENSG00000269984chr3169494980169498122-
ENSG00000270096chr3169512750169514001+
ENSG00000270567chr3169805372169806638-
ENSG00000268220chr3169805598169807378+
ENSG00000236385chr3177339170177346075-
ENSG00000237978chr3178244293178578193-
ENSG00000260743chr3179058110179059675+
ENSG00000269728chr3179113877179115965-
ENSG00000242539chr3179114749179116979+
ENSG00000242808chr3180707558181554668+
ENSG00000243368chr3182734043182735596+
ENSG00000233885chr3183524245183526729-
ENSG00000234197chr3185796959185798736+
ENSG00000263826chr3186499569186501968-
ENSG00000232233chr3186528669186543310-
ENSG00000270959chr3187868994187871845-
ENSG00000234076chr3188659504188665428-
ENSG00000225764chr3189838753189862635+
ENSG00000223812chr3191275113191308145+
ENSG00000214146chr3193675161193721448-
ENSG00000230102chr3193723226193788759-
ENSG00000225742chr3193920805193967942-
ENSG00000214145chr3194014254194030592-
ENSG00000233058chr3194208183194239008+
ENSG00000244675chr3194217046194222232-
ENSG00000231770chr3194304740194310989+
ENSG00000229334chr3194353652194366130+
ENSG00000230266chr3194868600194873519+
ENSG00000229325chr3195001452195003470-
ENSG00000223711chr3195270871195277400+
ENSG00000229178chr3195382436195384798-
ENSG00000242086chr3195384933195460422+
ENSG00000224614chr3195634947195638128+
ENSG00000260261chr3195676059195679566-
ENSG00000235897chr3196045201196052441+
ENSG00000225822chr3196158235196160242+
ENSG00000232065chr3196358369196359458-
ENSG00000230732chr3196639972196641450+
ENSG00000270170chr3196669494196670411+
ENSG00000228109chr3196726331196731615+
ENSG00000236833chr3197387436197392628-
ENSG00000236438chr3197879237197925886+
ENSG00000250312chr4124386157779+
ENSG00000249592chr4756175775637-
ENSG00000196810chr412430881282079+
ENSG00000244459chr415757891581980-
ENSG00000270195chr417145481715349+
ENSG00000249673chr429366262963465+
ENSG00000261643chr435053243506184-
ENSG00000270090chr435462823550523+
ENSG00000250986chr437604753765117-
ENSG00000253917chr439169103957148-
ENSG00000247708chr445438584639631+
ENSG00000251580chr466724526675557-
ENSG00000170846chr466751786677774+
ENSG00000246526chr466891756692246-
ENSG00000245468chr470962987105112-
ENSG00000251615chr483568178359103-
ENSG00000205959chr484839978514337+
ENSG00000261490chr41006971310074643-
ENSG00000246095chr41354769913549425-
ENSG00000248360chr41447571114889793-
ENSG00000263327chr41622828616321763+
ENSG00000261121chr42466147924673191+
ENSG00000240005chr42686142826862221-
ENSG00000248936chr43758970937590497-
ENSG00000231160chr43861432238666504-
ENSG00000249685chr43913553339137228+
ENSG00000249348chr43952963939596327+
ENSG00000238206chr43954945639551432+
ENSG00000255458chr43964076039668264+
ENSG00000260296chr44016829540169451+
ENSG00000251517chr44270812442709352+
ENSG00000251350chr44401887844024080+
ENSG00000259959chr44784213947846356-
ENSG00000248866chr45352557353527835+
ENSG00000226950chr45357859753586518+
ENSG00000249700chr45623013856262009-
ENSG00000269921chr45725379157254319+
ENSG00000270147chr45726247857263037+
ENSG00000270109chr45733032457330745+
ENSG00000269949chr45782709357827539-
ENSG00000245067chr45797592858071676+
ENSG00000250846chr46653567966563747+
ENSG00000249413chr46686456467015730+
ENSG00000248049chr46856699868946670+
ENSG00000250220chr47412492674183670+
ENSG00000251442chr47956705779603853+
ENSG00000249307chr47989290280229952+
ENSG00000251022chr48381416283822113-
ENSG00000250546chr48471758985214565-
ENSG00000180769chr48588753885932430+
ENSG00000248019chr48963094089651254+
ENSG00000271359chr49003265190033519+
ENSG00000270720chr49004043590041022+
ENSG00000251095chr49047250790647654+
ENSG00000247775chr49075755990763129+
ENSG00000271474chr49647028096473608+
ENSG00000254044chr49825578698554974-
ENSG00000214559chr49917283999182781-
ENSG00000246090chr4100010008100222513+
ENSG00000245322chr4100871163101116256+
ENSG00000248161chr4103339759103371167-
ENSG00000260651chr4103421998103422476-
ENSG00000246560chr4103749212103765232+
ENSG00000251259chr4106058437106061776-
ENSG00000245293chr4108784635108899955-
ENSG00000232021chr4109088681109177992+
ENSG00000234492chr4109459346109541616-
ENSG00000247950chr4110268631110354973-
ENSG00000260526chr4113150717113152752-
ENSG00000249532chr4113567632113571207-
ENSG00000269893chr4119199864119200978+
ENSG00000260404chr4119512928119554884+
ENSG00000249356chr4119990479119991452-
ENSG00000260091chr4120330488120331388+
ENSG00000250950chr4120377505120378432+
ENSG00000249464chr4124571422124851561+
ENSG00000261668chr4128761353128765195-
ENSG00000251432chr4129213906129440549+
ENSG00000248187chr4129489127129491686-
ENSG00000196951chr4141204880141294514-
ENSG00000248810chr4142240604142253772-
ENSG00000249806chr4143487172143582103+
ENSG00000250326chr4143854348144106014-
ENSG00000248890chr4145564074145582509-
ENSG00000270681chr4152061143152062255+
ENSG00000245954chr4153021906153025872+
ENSG00000270750chr4153241696153242196-
ENSG00000268471chr4153457416153460415+
ENSG00000260244chr4156655600156658214+
ENSG00000248429chr4159091904159124029+
ENSG00000245213chr4174053079174090803-
ENSG00000237125chr4174448421174512475+
ENSG00000251584chr4175457791175461935+
ENSG00000250131chr4178366133178598280+
ENSG00000177822chr4182795591183066402-
ENSG00000251359chr4184018170184020352-
ENSG00000249096chr4185286341185291024-
ENSG00000270426chr4185393078185393763-
ENSG00000271646chr4185395956185398458+
ENSG00000271538chr4185427614185458708-
ENSG00000251230chr4185765739185776905-
ENSG00000233110chr4186509063186515157+
ENSG00000250658chr4188225237188230836-
ENSG00000249378chr4189321890189602205+
ENSG00000260774chr5214013217394-
ENSG00000248925chr5269973271631-
ENSG00000225138chr5473351480999+
ENSG00000271781chr5675941676731+
ENSG00000215246chr5987295997423-
ENSG00000272347chr510051541006738+
ENSG00000271119chr515947411611582+
ENSG00000249731chr519682081969127+
ENSG00000250579chr551328935140167-
ENSG00000250490chr563105546339997-
ENSG00000272520chr566712196674499+
ENSG00000249159chr583877518457677-
ENSG00000272049chr584450628445648-
ENSG00000247516chr584508568463208+
ENSG00000260981chr587851548785580-
ENSG00000250198chr588398448881637+
ENSG00000250786chr595463129550721+
ENSG00000272417chr51020371210204152-
ENSG00000259802chr51035281310353713-
ENSG00000272016chr51065433210657928+
ENSG00000248131chr51257496912804475+
ENSG00000261360chr51466191714664713-
ENSG00000246214chr51661603516630078+
ENSG00000215196chr51713013717217156-
ENSG00000250337chr52747239927496508+
ENSG00000250764chr53210355132122047-
ENSG00000272086chr53217457732175378+
ENSG00000249572chr53342413133440725-
ENSG00000271874chr53465156234651993-
ENSG00000272323chr53483765434839383-
ENSG00000250155chr53666631636725297-
ENSG00000248587chr53784054037875901+


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.