The Cancer LncRNome Atlas



Skin Cutaneous Melanoma (SKCM)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in SKCM

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000267213chr193288095632896445-
ENSG00000267475chr193317799533182656-
ENSG00000266930chr193336683133369327-
ENSG00000267580chr193379084033792074+
ENSG00000267296chr193379376333795960+
ENSG00000267219chr193483926134850317-
ENSG00000267024chr193491701734919178-
ENSG00000268751chr193506763835068606-
ENSG00000267767chr193528272435323773-
ENSG00000261754chr193530249335305249-
ENSG00000269086chr193532879335346208+
ENSG00000271109chr193534018235351480-
ENSG00000271032chr193550586535516239-
ENSG00000227392chr193554996335597208-
ENSG00000221857chr193562972835642239+
ENSG00000268947chr193575374935755707+
ENSG00000205786chr193589041335910287+
ENSG00000236144chr193603164036036931-
ENSG00000226510chr193615885036164193-
ENSG00000105663chr193620892136229779+
ENSG00000267439chr193623795836244316-
ENSG00000267328chr193624546736246391+
ENSG00000267049chr193626004636261930-
ENSG00000248101chr193649954036505137-
ENSG00000267698chr193650541036536874+
ENSG00000267053chr193679548236803570+
ENSG00000232677chr193680396936822620-
ENSG00000267309chr193698055136981942+
ENSG00000233527chr193706397237085610+
ENSG00000225975chr193717634237178351-
ENSG00000267254chr193728842037319017+
ENSG00000267345chr193756601537569507-
ENSG00000226686chr193774281437756437+
ENSG00000267605chr193775684137762420-
ENSG00000267682chr193782813837828645+
ENSG00000267381chr193797890137979554+
ENSG00000266916chr193798806337997948-
ENSG00000180458chr193803637238040073-
ENSG00000267470chr193803981638078249+
ENSG00000267152chr193821948738221544-
ENSG00000267640chr193830799938317278+
ENSG00000229481chr193832019138322797+
ENSG00000268913chr193882227438822716+
ENSG00000267473chr193888882138890521+
ENSG00000267892chr193922892439230503+
ENSG00000269688chr193933536939336139-
ENSG00000269486chr193942597639429272-
ENSG00000268262chr193980529139811498-
ENSG00000269246chr193983241339832585-
ENSG00000269410chr193991657539919055+
ENSG00000268166chr194052629240526948+
ENSG00000205041chr194077939640781386-
ENSG00000268366chr194094934340949994+
ENSG00000269843chr194133712641343115-
ENSG00000267107chr194196007442006559-
ENSG00000268355chr194203756642038534+
ENSG00000270164chr194204154542043266+
ENSG00000268027chr194205155442061832+
ENSG00000254887chr194263670742641251+
ENSG00000259436chr194265672142661675+
ENSG00000213904chr194290128043156507+
ENSG00000268601chr194429846144299810-
ENSG00000267058chr194439595644405957-
ENSG00000266921chr194450104844506988-
ENSG00000267163chr194459850344603864-
ENSG00000186019chr194460961644617298-
ENSG00000267242chr194497864544979403-
ENSG00000266903chr194513550045222031-
ENSG00000267282chr194538528445394133-
ENSG00000267348chr194557976845593649-
ENSG00000267176chr194558858745593632-
ENSG00000267045chr194574189045748628-
ENSG00000259605chr194626804346273064+
ENSG00000267395chr194627105446275762+
ENSG00000269148chr194633342246334366+
ENSG00000268621chr194669242346706340-
ENSG00000268460chr194670668346718094+
ENSG00000245598chr194716362147180704+
ENSG00000268061chr194798753948004854+
ENSG00000269656chr194826029348272097-
ENSG00000269420chr194856462848568202+
ENSG00000269534chr194862168948630963+
ENSG00000268583chr194870734048716411+
ENSG00000268001chr194875893248761456+
ENSG00000269423chr194896962348970237+
ENSG00000269751chr194898310448985571+
ENSG00000269814chr194901646449016917-
ENSG00000268093chr194912252949127389-
ENSG00000260366chr194942942849429701+
ENSG00000267898chr194946723249468415+
ENSG00000268655chr194952150449522741-
ENSG00000197813chr194983487449843865-
ENSG00000268686chr194987196249891338-
ENSG00000269194chr195031219050312995+
ENSG00000268006chr195034189650354933-
ENSG00000268047chr195035614450358224-
ENSG00000269352chr195036022750362546-
ENSG00000267896chr195036313950363771-
ENSG00000267890chr195057838050579159+
ENSG00000267815chr195081327950813796-
ENSG00000268518chr195099006750990895-
ENSG00000180279chr195132093751322134+
ENSG00000269072chr195165618051685222-
ENSG00000267984chr195184842351856547+
ENSG00000254760chr195191755251918219+
ENSG00000269235chr195245238752484620+
ENSG00000260160chr195256174352566956-
ENSG00000267827chr195263380152674786-
ENSG00000269834chr195289209552901019-
ENSG00000268970chr195310095253102140-
ENSG00000269825chr195315369053156537-
ENSG00000213793chr195341844953426723-
ENSG00000268613chr195363819053638575-
ENSG00000269051chr195370036453714268+
ENSG00000269758chr195377112353774185-
ENSG00000160336chr195393522753961515+
ENSG00000268816chr195469773154698394+
ENSG00000268164chr195475328954753907-
ENSG00000248166chr195482018254848439-
ENSG00000267577chr195567030755688908+
ENSG00000267649chr195572802855732984+
ENSG00000267093chr195591111355911787-
ENSG00000267730chr195608813656088780-
ENSG00000267523chr195617326756186081-
ENSG00000267096chr195618199856183435+
ENSG00000267018chr195620768156208795+
ENSG00000267776chr195688807356888653-
ENSG00000267454chr195690502556910541+
ENSG00000166770chr195698861957012035+
ENSG00000267421chr195704752557049944-
ENSG00000269696chr195705693557078780-
ENSG00000268568chr195718394257185269-
ENSG00000269793chr195720205457311014+
ENSG00000268713chr195777272257774106+
ENSG00000267871chr195777858857791702-
ENSG00000268205chr195781567357819930+
ENSG00000268678chr195786221657863380-
ENSG00000268266chr195798901757994364+
ENSG00000269867chr195837840658379540-
ENSG00000268516chr195876863958790174-
ENSG00000268201chr195877800158779051+
ENSG00000142396chr195881671558827023+
ENSG00000268230chr195885822058874117-
ENSG00000268895chr195885911758866549+
ENSG00000268049chr195886936558870969+
ENSG00000269054chr195887395158877958+
ENSG00000232098chr195891560558919851-
ENSG00000268543chr195892992758930677+
ENSG00000268912chr195893999958942515-
ENSG00000269473chr195895181558957216+
ENSG00000267858chr195907049659086164+
ENSG00000224885chr233021123305236-
ENSG00000225234chr234850133486180-
ENSG00000271868chr235007273501199+
ENSG00000235078chr235230463526968+
ENSG00000242282chr235794033584463-
ENSG00000234171chr236060823609324+
ENSG00000231532chr246758124703805-
ENSG00000225964chr269686456980595-
ENSG00000271947chr270458557046432-
ENSG00000228203chr270524087058813-
ENSG00000272002chr274010027401635+
ENSG00000229727chr275613927590385+
ENSG00000235576chr278659327870836+
ENSG00000235092chr288067668821993-
ENSG00000260837chr288612648862816-
ENSG00000271855chr296960289696904+
ENSG00000240687chr297789019789568+
ENSG00000269973chr21007648910079719+
ENSG00000260077chr21017921910180790-
ENSG00000271787chr21019454810194993-
ENSG00000272524chr21026086110261192+
ENSG00000257135chr21058882010591453+
ENSG00000243819chr21083047010832225+
ENSG00000272275chr21090800110910184-
ENSG00000145063chr21123997711272947-
ENSG00000224184chr21198874812718474+
ENSG00000261117chr21285554112856353+
ENSG00000225649chr21310691013147138-
ENSG00000223850chr21606052116076139+
ENSG00000233718chr21606115916082371-
ENSG00000260331chr21872865218729470-
ENSG00000236204chr21916772919546509-
ENSG00000228784chr22006862120084808+
ENSG00000271991chr22010178620102330+
ENSG00000227210chr22018997820203971+
ENSG00000269976chr22078600820786446-
ENSG00000231948chr22079053520792308-
ENSG00000260396chr22087756920879005+
ENSG00000270100chr22087801420878692-
ENSG00000271936chr22504847925049586+
ENSG00000224165chr22519425925262563+
ENSG00000261452chr22538006325382006+
ENSG00000272048chr22545072425451090-
ENSG00000272056chr22727648627277144-
ENSG00000272148chr22728529627285775-
ENSG00000234945chr22755840927565466+
ENSG00000234072chr22757911327590489+
ENSG00000270210chr22864881228649586+
ENSG00000226833chr22893181928959071-
ENSG00000271228chr23223813032238437+
ENSG00000237133chr23378011433788614-
ENSG00000203386chr23393195334522820+
ENSG00000228262chr23490264634963298+
ENSG00000260025chr23658189236582257-
ENSG00000272054chr23743601837439820+
ENSG00000232973chr23830279138408997+
ENSG00000231367chr23863386138742882-
ENSG00000229692chr23921942039220998-
ENSG00000231312chr23966377839892483+
ENSG00000234362chr24215873942160863-
ENSG00000224875chr24237037842397441-
ENSG00000231826chr24325499243266686-
ENSG00000230587chr24332488443329829-
ENSG00000234936chr24345671243460533+
ENSG00000228925chr24712641447135817+
ENSG00000225187chr24729496147298343+
ENSG00000236824chr24755819947571656+
ENSG00000233230chr24813281748134949+
ENSG00000228033chr25294981553137158-
ENSG00000272156chr25430969154312203+
ENSG00000238018chr25488814854889929-
ENSG00000240401chr25553562855573185+
ENSG00000271894chr25637476556613306+
ENSG00000233251chr25640066956412905-
ENSG00000233723chr25865493459290901+
ENSG00000267520chr26115304461155287+
ENSG00000212978chr26136873261372104-
ENSG00000270820chr26169832361711265+
ENSG00000236498chr26209556762113217+
ENSG00000231609chr26327105763275775-
ENSG00000225889chr26437037364479993+
ENSG00000223935chr26462235464680932-
ENSG00000260101chr26474932164751227-
ENSG00000226756chr26487174664873832+
ENSG00000232613chr26525786165280151-
ENSG00000204929chr26566384566311773+
ENSG00000235725chr26581670065867311-
ENSG00000232164chr26661043866619582+
ENSG00000237013chr26802318668052694-
ENSG00000271954chr26968512969687230-
ENSG00000188971chr26968641469693664-
ENSG00000179818chr27018939570315978-
ENSG00000226505chr27032102670330352-
ENSG00000231327chr27035116870352449-
ENSG00000270348chr27088391670885457-
ENSG00000237751chr27111500171117089+
ENSG00000239322chr27116894771175740-
ENSG00000230002chr27368389173686611+
ENSG00000237883chr27417476974208568-
ENSG00000235499chr27421225974213470+
ENSG00000225439chr27437513674377188+
ENSG00000258821chr27472581574726494-
ENSG00000272183chr27472884474729492+
ENSG00000257702chr27472972274731805+
ENSG00000204792chr27514527575165545+
ENSG00000236209chr27514668275151973-
ENSG00000230836chr27516738575169797+
ENSG00000270696chr27588758875889334+
ENSG00000271452chr27589711575897580+
ENSG00000270996chr27594624675947144+
ENSG00000232504chr28611640386118103+
ENSG00000228363chr28678919386845889+
ENSG00000222041chr28775488787906324+
ENSG00000234028chr28892705788931339+
ENSG00000240040chr28910998489161075-
ENSG00000231486chr28913070089165653-
ENSG00000261600chr29176839391768920+
ENSG00000233757chr29587328395881351+
ENSG00000232931chr29647286696481963-
ENSG00000204685chr29687415496908359+
ENSG00000230747chr29697300196987469-
ENSG00000235480chr29719367797198043-
ENSG00000230606chr29808108398095220-
ENSG00000241481chr29808667898100408+
ENSG00000228486chr29828068098319527+
ENSG00000226791chr29937840199388543-
ENSG00000230393chr2100721381100723966+
ENSG00000223947chr2101610138101618706-
ENSG00000235597chr2105049725105137290+
ENSG00000233639chr2105424030105469641-
ENSG00000269707chr2105469743105542510+
ENSG00000231851chr2105713510105719402-
ENSG00000226508chr2105760571105761882+
ENSG00000235319chr2105940667105946986+
ENSG00000235522chr2106462990106473633-
ENSG00000214184chr2109123971109150652-
ENSG00000259863chr2109743783109745386-
ENSG00000186148chr2110690738110742667+
ENSG00000204588chr2110744640110753717+
ENSG00000175701chr2110969106111002997-
ENSG00000261760chr2110988683111043433+
ENSG00000175772chr2111132715111142019-
ENSG00000184115chr2111143988111192743-
ENSG00000230499chr2111953540111964071+
ENSG00000172965chr2111965353112252677-
ENSG00000271590chr2111968572111970053-
ENSG00000240350chr2112248850112268567+
ENSG00000224959chr2112249520112252388-
ENSG00000243389chr2113346617113372008+
ENSG00000228251chr2113348373113349516+
ENSG00000237753chr2113399409113403267-
ENSG00000189223chr2113969099114024587+
ENSG00000227359chr2114435279114461655-
ENSG00000228857chr2114588626114600933-
ENSG00000236255chr2118591513118599234+
ENSG00000226856chr2118889704118943962-
ENSG00000258910chr2119591276119592686-
ENSG00000265451chr2122287998122290281+
ENSG00000236859chr2122407226122485784+
ENSG00000236682chr2128146706128158156+
ENSG00000270081chr2128601127128603261-
ENSG00000233221chr2131588551131594567-
ENSG00000235615chr2132722304132737446-
ENSG00000224043chr2135493034135676280-
ENSG00000226806chr2136577761136580657+
ENSG00000231890chr2136742746136779888+
ENSG00000228043chr2139175854139259268-
ENSG00000231758chr2144398325144413748-
ENSG00000238057chr2145275664145279058+
ENSG00000226674chr2145425534145940216+
ENSG00000231969chr2150443710150704747+
ENSG00000226383chr2156868129156881125-
ENSG00000234584chr2158582220158592517-
ENSG00000270557chr2158734195158735077+
ENSG00000271320chr2158774224158774883+
ENSG00000204380chr2159514849159591514-
ENSG00000224152chr2160471807160473593+
ENSG00000226266chr2160527219160568946-
ENSG00000227403chr2162101250162105561+
ENSG00000236841chr2163018280163029426+
ENSG00000235192chr2166651361166666520+
ENSG00000229195chr2166651367166702601-
ENSG00000232411chr2166689558166695608-
ENSG00000227617chr2169628463169642939-
ENSG00000239467chr2171627623171634658+
ENSG00000228389chr2172629992172632354+
ENSG00000232788chr2173328990173330750-
ENSG00000225205chr2173345568173421324-
ENSG00000271151chr2174833079174834146+
ENSG00000226853chr2175352117175353114+
ENSG00000236449chr2175411869175639555+
ENSG00000229750chr2176032632176033250+
ENSG00000237380chr2176986339177001826-
ENSG00000224189chr2177037923177053686-
ENSG00000226363chr2177042445177043736+
ENSG00000163364chr2177494317177502659-
ENSG00000224577chr2177502438177520686+
ENSG00000213963chr2178148236178257419-
ENSG00000223960chr2179278666179304970+
ENSG00000237298chr2179385910179639402+
ENSG00000270956chr2179405852179406526+
ENSG00000270277chr2179413611179415408+
ENSG00000271011chr2179441830179442349+
ENSG00000270574chr2179443517179445633+
ENSG00000271141chr2179481308179481850+
ENSG00000234663chr2181966659182264286+
ENSG00000260742chr2182752578182756390-
ENSG00000231646chr2186648418186664878-
ENSG00000237877chr2186897618186947960-
ENSG00000224063chr2187867947188419390+
ENSG00000253559chr2190627430190630282+
ENSG00000233654chr2191399581191432828+
ENSG00000228509chr2191541670191573442-
ENSG00000235852chr2191745523191746785-
ENSG00000227542chr2192093891192110898-
ENSG00000229056chr2197124748197128928+
ENSG00000231621chr2198062715198063997+
ENSG00000225953chr2200322423200341658+
ENSG00000260006chr2201689396201692061+
ENSG00000183308chr2201827986201873825+
ENSG00000234431chr2202031688202032269+
ENSG00000231903chr2203043383203044114-
ENSG00000227946chr2206949329206951288+
ENSG00000231955chr2206980271206987047+
ENSG00000237892chr2207985608207986768-
ENSG00000234902chr2208051441208100790-
ENSG00000229647chr2208104374208110611+
ENSG00000224137chr2208527099208531748+
ENSG00000244567chr2208686014208687493-
ENSG00000231908chr2209119971209120905+
ENSG00000229127chr2210895457210929080+
ENSG00000270659chr2214017694214018383+
ENSG00000229267chr2215674953215827998+
ENSG00000235770chr2216476286216708445-
ENSG00000230838chr2216582766216584147+
ENSG00000226276chr2216804031216806442-
ENSG00000260804chr2217081768217084915+
ENSG00000232485chr2217343753217363484-
ENSG00000241520chr2217347755217351919-
ENSG00000261338chr2219120042219122087+
ENSG00000225062chr2219231388219232558-
ENSG00000229525chr2220253218220268355+
ENSG00000268603chr2220362333220362968-
ENSG00000268896chr2220411933220412380-
ENSG00000269068chr2220423805220424348+
ENSG00000267034chr2223181961223183372-
ENSG00000261428chr2223431624223434438-
ENSG00000234193chr2223782105223784081-
ENSG00000236432chr2228085768228189917-
ENSG00000225963chr2231036815231038939+
ENSG00000230385chr2231773567231774817+
ENSG00000261829chr2231916755231917352+
ENSG00000224376chr2232253687232259702+
ENSG00000181798chr2232373137232379050-
ENSG00000237126chr2233445658233476681-
ENSG00000243637chr2234263220234301045+
ENSG00000235726chr2235742959235822028-
ENSG00000235529chr2236414395236416210+
ENSG00000227252chr2237968077237994460-
ENSG00000222032chr2238337563238343465-
ENSG00000227107chr2238521620238535168+
ENSG00000260942chr2241522117241526116-
ENSG00000223374chr2242290755242292519-
ENSG00000228989chr2242629829242633704+
ENSG00000235351chr2242664030242665108-
ENSG00000224272chr2242749407242753111-
ENSG00000235151chr2242786532242787188+
ENSG00000233806chr2242823514243020873+
ENSG00000237940chr2242912834242919427+
ENSG00000261186chr2243029505243030608-
ENSG00000225377chr20300957328868-
ENSG00000251390chr20825767838106+
ENSG00000234684chr2013060651358827+
ENSG00000229728chr2013422661343229+
ENSG00000226644chr2021878632193797+
ENSG00000229539chr2038688863869515-
ENSG00000230563chr2054518535455828+
ENSG00000205181chr2054767135485259-
ENSG00000261062chr201038165710384178-
ENSG00000270408chr201062584710627014-
ENSG00000224961chr201073373810734614+
ENSG00000236526chr201189005211899325-
ENSG00000232388chr201854806418550207+
ENSG00000179935chr201876829518774979-
ENSG00000233895chr201973835219790319+
ENSG00000225127chr202106824521086999-
ENSG00000088970chr202110662421227260+
ENSG00000232645chr202333723123338753-
ENSG00000270001chr202361246323612953-
ENSG00000213742chr202560468125658710+
ENSG00000226465chr202573185425733397+
ENSG00000125804chr202603529126073683+
ENSG00000227195chr202616755626232162-
ENSG00000205611chr202951358229521213-
ENSG00000225490chr202952163729522987-
ENSG00000235313chr203015096930151879+
ENSG00000236772chr203103755831041410+
ENSG00000260257chr203144484831446557+
ENSG00000228265chr203257085832582163-
ENSG00000250917chr203282264632868979-
ENSG00000269202chr203378955033791091-
ENSG00000126005chr203380463433865934-
ENSG00000230155chr203406402834078808-
ENSG00000268340chr203410668234107108+
ENSG00000260032chr203463354434638882-
ENSG00000232907chr203513656335201794-
ENSG00000259729chr203514101235154533-
ENSG00000259716chr203517753035232932-
ENSG00000235167chr203612087436137633-
ENSG00000224635chr203703465837045444-
ENSG00000196756chr203704923537063996-
ENSG00000174365chr203707522137079564+
ENSG00000226648chr203972696939766643-
ENSG00000223891chr204283960042854667+
ENSG00000226812chr204297619242983825-
ENSG00000132832chr204328509243324737-
ENSG00000244558chr204332353343374662-
ENSG00000227477chr204359243543595043-
ENSG00000234011chr204407604244076982+
ENSG00000271984chr204452133344522058-
ENSG00000204044chr204464214144650712-
ENSG00000240742chr204465041544656438+
ENSG00000271784chr204531829845318928+
ENSG00000231119chr204598130545983377+
ENSG00000235621chr204698869346999372+
ENSG00000177410chr204789471547905797+
ENSG00000237595chr204878000148782639-
ENSG00000224397chr204888402348896332+
ENSG00000203999chr204890925748931459+
ENSG00000233077chr204892724848937879-
ENSG00000259456chr204954752149561671+
ENSG00000248832chr204962019449624577-
ENSG00000197670chr205216930952191847+
ENSG00000236352chr205255669952559047+
ENSG00000218018chr205595921655968118-
ENSG00000227297chr205617475156176256-
ENSG00000231290chr205709043557194944+
ENSG00000254419chr205728585157286689+
ENSG00000268649chr205739218757392780-
ENSG00000235590chr205739397457425958-
ENSG00000268333chr205740886457411584-
ENSG00000225806chr205743858357463864-
ENSG00000228340chr205866289559102516+
ENSG00000225106chr206031327560330112-
ENSG00000226332chr206088048860881381-
ENSG00000232803chr206129437161298076-
ENSG00000228705chr206140548061406764-
ENSG00000229873chr206143197961436939-
ENSG00000231133chr206172715061733631-


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.