The Cancer LncRNome Atlas



Ovarian Serous Cystadenocarcinoma (OV)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in OV

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000253307chr8142262385142263391-
ENSG00000261655chr8142363503142365465-
ENSG00000244998chr8142400039142402674-
ENSG00000271959chr8142444645142448054+
ENSG00000261693chr8143485013143488389+
ENSG00000234616chr8143738874143763386-
ENSG00000253741chr8143783670143808391-
ENSG00000253196chr8143844534143847845+
ENSG00000247317chr8144063155144099854-
ENSG00000253716chr8144362331144363860-
ENSG00000272172chr8144372569144372791-
ENSG00000254389chr8144448801144450718-
ENSG00000253931chr8144494919144499224+
ENSG00000254338chr8144499849144501320+
ENSG00000254859chr8144624143144631899-
ENSG00000254741chr8144661806144662840+
ENSG00000271912chr8144683416144685394+
ENSG00000254812chr8144714241144715926-
ENSG00000181097chr8144778324144780583+
ENSG00000254548chr8144800416144801061-
ENSG00000203499chr8144816310144828507+
ENSG00000254973chr8144840323144853992-
ENSG00000214733chr8144871090144872629+
ENSG00000204791chr8145104030145106423+
ENSG00000255224chr8145132905145134168-
ENSG00000254690chr8145538253145538801-
ENSG00000272115chr8145634876145635360+
ENSG00000232600chr8145660602145665354+
ENSG00000255182chr8145721001145730827-
ENSG00000261139chr8145721763145725663-
ENSG00000265393chr8145737950145739056+
ENSG00000254533chr8145923999145924570-
ENSG00000263612chr8145939284145940230+
ENSG00000255559chr8146228197146231432+
ENSG00000227518chr92765730891+
ENSG00000227155chr9454304492112-
ENSG00000228115chr9487774495610+
ENSG00000226403chr9547317549531+
ENSG00000236199chr920419002046023-
ENSG00000236404chr924227022641395-
ENSG00000236511chr931815893198517+
ENSG00000232104chr935267233671646+
ENSG00000235326chr936745463691814+
ENSG00000237009chr938986423901248+
ENSG00000225408chr957190215720244-
ENSG00000236924chr966459566670635+
ENSG00000225489chr967165486727438+
ENSG00000225706chr988581308862255+
ENSG00000234740chr91327450913279186-
ENSG00000270547chr91340637913433052-
ENSG00000226197chr91344649013487510+
ENSG00000225472chr91431708414357907+
ENSG00000234779chr91672681216727522+
ENSG00000260912chr91945320719455171+
ENSG00000171889chr92145564121559668-
ENSG00000265194chr92185890921861925-
ENSG00000240498chr92199477722121096+
ENSG00000234840chr92264619922824212+
ENSG00000234676chr92695577826956293-
ENSG00000235453chr93255114232567003+
ENSG00000233554chr93316697333179981+
ENSG00000233776chr93373297333738414-
ENSG00000235481chr93378594833818793-
ENSG00000228352chr93408433034096223+
ENSG00000261215chr93466190034666026-
ENSG00000230074chr93466566234681295+
ENSG00000234181chr93509637535098138+
ENSG00000227933chr93564626735647096+
ENSG00000269900chr93565774835658015-
ENSG00000227388chr93577216035790429+
ENSG00000235387chr93590948035911683+
ENSG00000260100chr93707881037079773-
ENSG00000233137chr93707989337090398+
ENSG00000234160chr93750914737510296+
ENSG00000204860chr93862047138624987+
ENSG00000204837chr94196161542019580-
ENSG00000223839chr94246631742474239+
ENSG00000233244chr94302774843032877-
ENSG00000237357chr94440176644404440+
ENSG00000235659chr94500190745003117-
ENSG00000232116chr94548457245488153+
ENSG00000204802chr94668542946688137-
ENSG00000226007chr94684363846846025+
ENSG00000238113chr96645728566469310+
ENSG00000234665chr96651348866553911-
ENSG00000170161chr96655327366555928+
ENSG00000225411chr96839787868409893-
ENSG00000224958chr97097010570972768-
ENSG00000234506chr97115845771161505-
ENSG00000243888chr97204316472043637-
ENSG00000229312chr97208738272109429+
ENSG00000261447chr97228766572288629+
ENSG00000204706chr97270073272790804-
ENSG00000268364chr97280891372873782-
ENSG00000225434chr97492034674958126+
ENSG00000229587chr97762474477630952-
ENSG00000233926chr98430462884391815+
ENSG00000229109chr98583424685849157+
ENSG00000254473chr98632250986328293+
ENSG00000226877chr98644457186452776+
ENSG00000231616chr98644650186483335+
ENSG00000235298chr98658714886590692+
ENSG00000230303chr98840063788408395-
ENSG00000226237chr98956361489616948+
ENSG00000269994chr98962337089657041-
ENSG00000228189chr99124210491267075-
ENSG00000224945chr99170351991724849-
ENSG00000237372chr99231656692334585+
ENSG00000231107chr99306318493195787-
ENSG00000230537chr99386723993869586-
ENSG00000229694chr99388134493945044+
ENSG00000237422chr99388142093925369-
ENSG00000235641chr99392205193927858+
ENSG00000233081chr99418852094189426+
ENSG00000225511chr99490358094922396+
ENSG00000227603chr99619761496199403-
ENSG00000269929chr99693874096940174+
ENSG00000232063chr99709475897123230+
ENSG00000231806chr99731735197330409+
ENSG00000236095chr99766271197667036+
ENSG00000229065chr99787599097876743+
ENSG00000271384chr99816927298169944-
ENSG00000237857chr99817711698189078-
ENSG00000271314chr99825720698257661+
ENSG00000271155chr99826851798269918+
ENSG00000271659chr99827632798276802+
ENSG00000175611chr99852151398638259-
ENSG00000225194chr99878201498790247-
ENSG00000224848chr99944933899483403+
ENSG00000242375chr99995763399959969-
ENSG00000203279chr999962757100000982-
ENSG00000254876chr9100000731100059596+
ENSG00000255036chr9100000779100139569+
ENSG00000267026chr9101609511101634697-
ENSG00000270412chr9101705619101706057-
ENSG00000271086chr9102117619102139522-
ENSG00000255145chr9102648608102668883-
ENSG00000270332chr9106842305106855354-
ENSG00000226334chr9107689834107691173+
ENSG00000230013chr9107753077107754062-
ENSG00000260230chr9111892573111898218-
ENSG00000259953chr9114794835114800010-
ENSG00000226609chr9115511182115512736-
ENSG00000271631chr9115647438115648047+
ENSG00000228623chr9115759495115774507-
ENSG00000225684chr9115865618115873780-
ENSG00000231528chr9115875353115882208+
ENSG00000233817chr9116381508116384914+
ENSG00000227482chr9116413236116445135+
ENSG00000226752chr9123587106123616651+
ENSG00000239593chr9124042141124045008-
ENSG00000235865chr9124043046124047808-
ENSG00000261534chr9124577953124581731-
ENSG00000269979chr9125086887125087594+
ENSG00000270102chr9125093146125093622+
ENSG00000269970chr9125134884125135104+
ENSG00000234156chr9125372194125401964+
ENSG00000261094chr9125699902125702612+
ENSG00000236901chr9125871773125877756-
ENSG00000235204chr9127021529127023435-
ENSG00000224020chr9127420746127460910+
ENSG00000236643chr9127532402127535206+
ENSG00000271341chr9127704887127705774-
ENSG00000239705chr9128003942128019297+
ENSG00000269909chr9129462577129463312+
ENSG00000271833chr9130129049130129676+
ENSG00000225032chr9130578345130584799+
ENSG00000257524chr9130630143130649066-
ENSG00000227218chr9130696782130703231+
ENSG00000269988chr9130870860130871604-
ENSG00000234771chr9130873450130881013-
ENSG00000225951chr9131231236131235291-
ENSG00000228395chr9131291180131314689-
ENSG00000234705chr9131425413131425857-
ENSG00000223478chr9131486724131495473+
ENSG00000267834chr9131766781131767277-
ENSG00000268707chr9131932713131933219+
ENSG00000204055chr9131939050131972827+
ENSG00000235007chr9132020633132022125+
ENSG00000224307chr9132044737132048007+
ENSG00000179082chr9132083295132087184+
ENSG00000233901chr9132094579132121817+
ENSG00000230676chr9132192931132213701-
ENSG00000226355chr9132200495132201397+
ENSG00000204054chr9132245730132275947+
ENSG00000239353chr9132264269132275965+
ENSG00000227619chr9132337688132346835+
ENSG00000234789chr9132402755132403561+
ENSG00000270755chr9132806992132807360+
ENSG00000236986chr9134008252134042892-
ENSG00000230289chr9134391945134397616-
ENSG00000224992chr9135644840135645599-
ENSG00000175164chr9136125788136150617-
ENSG00000271875chr9136125788136130950-
ENSG00000225756chr9136519708136522435-
ENSG00000235106chr9136890561136899788+
ENSG00000235138chr9136919412136923927+
ENSG00000233936chr9138137542138144554-
ENSG00000225361chr9138354573138372623-
ENSG00000226706chr9138395119138398293-
ENSG00000237339chr9138466781138478958+
ENSG00000238058chr9138799658138805359+
ENSG00000260193chr9138999654139001270-
ENSG00000264527chr9139141824139143051-
ENSG00000237886chr9139440664139444345+
ENSG00000228401chr9139543062139554873-
ENSG00000233016chr9139615818139622636-
ENSG00000228544chr9139698379139703300-
ENSG00000260190chr9139831621139832440-
ENSG00000235117chr9139931492139932407+
ENSG00000260996chr9140188320140190173-
ENSG00000233013chr9141106637141143444+
ENSG00000226179chrX281725282586+
ENSG00000236871chrX15153201518295+
ENSG00000236017chrX15206621532921+
ENSG00000223511chrX18514771874878+
ENSG00000223571chrX22523362254451-
ENSG00000229851chrX28229452824122+
ENSG00000234449chrX37710513800358-
ENSG00000205663chrX38094793838787-
ENSG00000205662chrX38479103855896-
ENSG00000236120chrX55714625644346-
ENSG00000234129chrX1098801111129234-
ENSG00000233338chrX1292093612926452-
ENSG00000235385chrX1328416713321571-
ENSG00000233535chrX1397351213982023+
ENSG00000225833chrX1562100415639607+
ENSG00000225882chrX1798831718122764-
ENSG00000237836chrX1890841418912615+
ENSG00000233785chrX2379110923801073-
ENSG00000260822chrX2456363324568583+
ENSG00000238123chrX3866082138663136-
ENSG00000223486chrX3986852939871435+
ENSG00000236393chrX4012217040146973+
ENSG00000234636chrX4059465240597950+
ENSG00000269941chrX4109288641093536+
ENSG00000270155chrX4109510941095832+
ENSG00000223714chrX4113499241136031+
ENSG00000270069chrX4560463945629677-
ENSG00000269902chrX4562417545624702-
ENSG00000231566chrX4570732845710920-
ENSG00000236751chrX4618535946187080-
ENSG00000230844chrX4640492846407671+
ENSG00000267064chrX4751823247519776+
ENSG00000224292chrX4836491148367226-
ENSG00000228343chrX4843816248439545-
ENSG00000270012chrX4912951749132231+
ENSG00000234390chrX4964189249643844-
ENSG00000204466chrX5010840850213737-
ENSG00000229151chrX5109979651139314-
ENSG00000226530chrX5113936351208513+
ENSG00000232593chrX5312332753196196+
ENSG00000270189chrX5319827953200096+
ENSG00000227486chrX5593455656041606+
ENSG00000204272chrX5675569256844813+
ENSG00000224799chrX5699994357001229+
ENSG00000226310chrX5714809557153676+
ENSG00000235437chrX6272982262780929-
ENSG00000231669chrX6480826164820630+
ENSG00000260118chrX6723331267234743-
ENSG00000203588chrX6938369269385056-
ENSG00000231651chrX6967280869675844-
ENSG00000228427chrX7040340970418025-
ENSG00000215115chrX7093422170938135-
ENSG00000215113chrX7098314070987054+
ENSG00000269911chrX7199743271998921+
ENSG00000229807chrX7304048673072588-
ENSG00000225470chrX7316415973290243+
ENSG00000228906chrX7316880873169393+
ENSG00000230590chrX7318379073513409-
ENSG00000270223chrX7322922473231303-
ENSG00000271430chrX7342006473461983-
ENSG00000271533chrX7342981173433495-
ENSG00000250534chrX7800322878010503+
ENSG00000259640chrX8375503383757461-
ENSG00000261295chrX9992832799928978+
ENSG00000228609chrX100258821100262962-
ENSG00000228275chrX100877973100879154-
ENSG00000261101chrX100882858100883508+
ENSG00000271147chrX101854440101969599+
ENSG00000223546chrX102024089102140334+
ENSG00000239407chrX102139342102161086+
ENSG00000234405chrX102752451102755245+
ENSG00000231154chrX102942212102946700+
ENSG00000261409chrX107963179107968174-
ENSG00000237863chrX107979770107982133+
ENSG00000271826chrX114752490114797058-
ENSG00000235244chrX115032519115085422-
ENSG00000203650chrX117973519117991849+
ENSG00000237903chrX118556880118557510+
ENSG00000224281chrX118599997118603061-
ENSG00000227285chrX119055224119056803-
ENSG00000234493chrX119144675119149501-
ENSG00000258545chrX119170201119280760+
ENSG00000244439chrX119745184119754929+
ENSG00000229033chrX122867024122868144+
ENSG00000232412chrX123093083123095191-
ENSG00000213468chrX130836678130964671-
ENSG00000232160chrX131351175131566890+
ENSG00000223749chrX133677367133680741-
ENSG00000227060chrX133684003133693953+
ENSG00000196972chrX134229058134232664-
ENSG00000178947chrX134555868134561999+
ENSG00000225235chrX134654008134654599-
ENSG00000233093chrX135721702135724588+
ENSG00000232611chrX135923090135929956-
ENSG00000234062chrX135991554136103789+
ENSG00000226031chrX137793614137798779+
ENSG00000227083chrX146981696146982977-
ENSG00000236337chrX147028461147029103+
ENSG00000241489chrX148564621148614672-
ENSG00000238039chrX148593039148607803-
ENSG00000241769chrX148614831148622358-
ENSG00000224871chrX149097880149098916+
ENSG00000235703chrX149106846149392815+
ENSG00000229967chrX151072903151082440-
ENSG00000197463chrX151876743151883038-
ENSG00000184324chrX151922445151928738+
ENSG00000243768chrX152617487152625568+
ENSG00000259886chrX152689210152691934+
ENSG00000260081chrX152864795152869808+
ENSG00000232725chrX153001080153031933-
ENSG00000231830chrX153562310153563387-
ENSG00000261773chrX153746164153746955-
ENSG00000224216chrX154564167154581271-
ENSG00000224533chrX154695631154841277+
ENSG00000225393chrX154697947154716707+
ENSG00000270726chrX155233883155255299+
ENSG00000185203chrX155244288155246502-


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.