The Cancer LncRNome Atlas



Glioblastoma Multiforme (GBM)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in GBM

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000267457chr173340085033401393-
ENSG00000266947chr173355846933569982-
ENSG00000267364chr173364052133651919+
ENSG00000267547chr173373085633731392-
ENSG00000267745chr173373370333736787-
ENSG00000267321chr173389513933901811+
ENSG00000266911chr173408421834085344-
ENSG00000267025chr173414372134157297-
ENSG00000266999chr173422071134238027-
ENSG00000267067chr173499052734991156+
ENSG00000255509chr173521893535293960-
ENSG00000267542chr173596978735973886+
ENSG00000260833chr173660663836608688-
ENSG00000261005chr173685870536861000+
ENSG00000266040chr173685973336862514-
ENSG00000263874chr173708142137084310+
ENSG00000266588chr173715950137169285-
ENSG00000266753chr173740889737410550-
ENSG00000266469chr173755804637562486+
ENSG00000214546chr173777586637778766+
ENSG00000264198chr173791397437920089-
ENSG00000264968chr173808399538095854+
ENSG00000270145chr173845945738460909+
ENSG00000265666chr173849711938499388-
ENSG00000259623chr174000477040007699-
ENSG00000204815chr174008688840117648+
ENSG00000267548chr174012718240129749+
ENSG00000270010chr174019025040190752-
ENSG00000267221chr174019273140195135-
ENSG00000236194chr174042253540424701-
ENSG00000267222chr174064788540648568+
ENSG00000267632chr174066180240663537+
ENSG00000266962chr174070445640706766-
ENSG00000267765chr174083520540851484-
ENSG00000197291chr174090593240913275-
ENSG00000267267chr174118127441184051+
ENSG00000267002chr174131620041322420-
ENSG00000236383chr174136896041383338-
ENSG00000188825chr174144721341466567-
ENSG00000267080chr174225334142264085-
ENSG00000260793chr174229876942301078+
ENSG00000267750chr174237694242392683-
ENSG00000267160chr174275105742753625-
ENSG00000267505chr174287056742871842+
ENSG00000267405chr174287211542875151-
ENSG00000224911chr174298052942981914-
ENSG00000267334chr174302528043026307+
ENSG00000267288chr174324617243248951-
ENSG00000267121chr174326829843299589-
ENSG00000233175chr174331539543319101-
ENSG00000233483chr174332255343326203-
ENSG00000267278chr174332529243345997+
ENSG00000006062chr174334048843394414-
ENSG00000267344chr174347429843474843+
ENSG00000131484chr174358062643612076+
ENSG00000266918chr174360894343611204+
ENSG00000267198chr174362317043640596+
ENSG00000264589chr174392101743972966-
ENSG00000262372chr174411267944113136+
ENSG00000214401chr174427094244274089+
ENSG00000232300chr174463619644640161-
ENSG00000262879chr174506141145177689-
ENSG00000263293chr174538083245400979-
ENSG00000263766chr174568122645726786-
ENSG00000264920chr174596862145973178-
ENSG00000234494chr174597469646018776-
ENSG00000266601chr174600704846010472-
ENSG00000263412chr174612250346125435-
ENSG00000230148chr174662091346628610+
ENSG00000233101chr174662699246683776+
ENSG00000239552chr174663462446637695+
ENSG00000244649chr174678256546784708+
ENSG00000229637chr174680053046802819+
ENSG00000248714chr174743852747447360+
ENSG00000250310chr174762220947655324-
ENSG00000262837chr174791160147913816+
ENSG00000204584chr174792327247926199+
ENSG00000246640chr174812771348133103-
ENSG00000253730chr174823569448238637-
ENSG00000261959chr174824088448242677-
ENSG00000251179chr174835893848365216-
ENSG00000250286chr174861465548616115-
ENSG00000250107chr174863356848639469-
ENSG00000262967chr174877080948772810+
ENSG00000229980chr174894404048987098+
ENSG00000267452chr174951278849523163+
ENSG00000261589chr175324618453250993+
ENSG00000262951chr175494630854946925+
ENSG00000263004chr175515565955162385-
ENSG00000265542chr175584930755912110-
ENSG00000264112chr175606640056072211-
ENSG00000264364chr175616890956172897+
ENSG00000265148chr175640281156493127+
ENSG00000265206chr175640824556409869-
ENSG00000264672chr175659719856634338+
ENSG00000224738chr175718395957195628+
ENSG00000265415chr175728003857281190-
ENSG00000267302chr175804219358074333+
ENSG00000267416chr175815667058166056+
ENSG00000261040chr175816092758169246-
ENSG00000267248chr175820389658213005-
ENSG00000267095chr175821312358217442-
ENSG00000259349chr175860365458628159+
ENSG00000267449chr175914721759147717-
ENSG00000267131chr175943902959477604-
ENSG00000267280chr175947081759488916-
ENSG00000265702chr176077660560815283+
ENSG00000263899chr176211651062119203-
ENSG00000266402chr176222333062223836+
ENSG00000215769chr176274578162778117-
ENSG00000265218chr176288884762906298+
ENSG00000266644chr176289588462896834+
ENSG00000263470chr176309693063107176+
ENSG00000266473chr176524095365241922+
ENSG00000266176chr176598999665992547-
ENSG00000265055chr176609218766097615-
ENSG00000267731chr176618602566188943+
ENSG00000265100chr176624277066244079-
ENSG00000267009chr176640978366489811+
ENSG00000267653chr176747328067497896-
ENSG00000267194chr176754749967550002+
ENSG00000237560chr176795784867979679+
ENSG00000267365chr176816310268165543-
ENSG00000271239chr176877474568775371-
ENSG00000228639chr177001799270030233-
ENSG00000256124chr177002643270034889+
ENSG00000234899chr177003345570217977-
ENSG00000226101chr177006847470089622+
ENSG00000227036chr177031926470636611-
ENSG00000264026chr177033908170351277+
ENSG00000263680chr177042208070424796+
ENSG00000260248chr177117162271172772+
ENSG00000246731chr177220611972209481-
ENSG00000264272chr177225303572258159-
ENSG00000261222chr177259597972603368+
ENSG00000266036chr177274345872745051-
ENSG00000263586chr177296679972971823+
ENSG00000265800chr177313451173137445-
ENSG00000263786chr177314135673142641-
ENSG00000265242chr177316168173163344-
ENSG00000263843chr177326745073269976+
ENSG00000265342chr177339020473391044+
ENSG00000266980chr177381489673816136-
ENSG00000267801chr177387245373875627+
ENSG00000267342chr177389314173896229+
ENSG00000261408chr177397531274002080+
ENSG00000267128chr177413663774150731+
ENSG00000267546chr177454175074553765-
ENSG00000267543chr177454603374546908+
ENSG00000272386chr177454743474547832+
ENSG00000163597chr177455384874561430+
ENSG00000261335chr177466802474669740+
ENSG00000267568chr177494639974965238-
ENSG00000267521chr177495310574954304-
ENSG00000234912chr177508279875091068+
ENSG00000266998chr177536990075373318-
ENSG00000267665chr177552308075532674+
ENSG00000267506chr177554302275559325+
ENSG00000267466chr177555945075564777-
ENSG00000204282chr177610347976107880-
ENSG00000204277chr177625743076274573-
ENSG00000267737chr177631181076343879+
ENSG00000266970chr177635653476369992+
ENSG00000267432chr177648096476495428+
ENSG00000267123chr177661347176628139-
ENSG00000262772chr177779725177801503+
ENSG00000262188chr177789315677899261+
ENSG00000262580chr177817447278179748-
ENSG00000263069chr177832562878388968-
ENSG00000260369chr177842753578428529-
ENSG00000261924chr177894003978945013-
ENSG00000262873chr177899176978993811-
ENSG00000226137chr177900293379008501-
ENSG00000260005chr177920250779207783+
ENSG00000262223chr177934980179359160-
ENSG00000262877chr177936193079364056-
ENSG00000229848chr177948107379494802+
ENSG00000262049chr177966835479670330-
ENSG00000263731chr177983630179838982-
ENSG00000263859chr177983654379837433+
ENSG00000264769chr177988077579882387+
ENSG00000265688chr177988570579888629+
ENSG00000264569chr177999578179997256+
ENSG00000265678chr178011130680112691+
ENSG00000264548chr178017210380175228+
ENSG00000265692chr178024792280250690-
ENSG00000260563chr178025159280252786+
ENSG00000260011chr178033898680340566-
ENSG00000264812chr178035857980359258-
ENSG00000265458chr178041214980416397-
ENSG00000266236chr178043997480441264+
ENSG00000262652chr178053589980536492+
ENSG00000262147chr178054518980546287-
ENSG00000263063chr178067178480674131-
ENSG00000263321chr178068704080692019-
ENSG00000262410chr178070294480703585+
ENSG00000262663chr178087615880876661+
ENSG00000261888chr178106120581063860+
ENSG00000262094chr178116829681175490-
ENSG00000263305chr181419516898-
ENSG00000263884chr18268148270278+
ENSG00000264514chr18316737319165+
ENSG00000264433chr18316740317366-
ENSG00000266456chr18650229652843+
ENSG00000265179chr18903145906668-
ENSG00000266783chr1825611712562219-
ENSG00000265399chr1831903953247275+
ENSG00000264235chr1832554343261848-
ENSG00000266578chr1832841433327290+
ENSG00000266835chr1834662483478976+
ENSG00000177337chr1835937303598350+
ENSG00000262001chr1836029983608334+
ENSG00000263878chr1839623534013943+
ENSG00000261520chr1842646024295405+
ENSG00000263753chr1852328755246507+
ENSG00000264575chr1852367235238597-
ENSG00000264449chr1858874865909121+
ENSG00000264707chr1862567466260933+
ENSG00000266441chr1867288206729861-
ENSG00000263970chr1884067598406951-
ENSG00000266708chr1886351778636345-
ENSG00000265962chr1886958548707619-
ENSG00000263847chr1891124029115875-
ENSG00000266053chr1891212639136643-
ENSG00000264964chr1893151929334439-
ENSG00000263627chr1896152629619361+
ENSG00000267143chr181162071611621157-
ENSG00000267165chr181185141311852750-
ENSG00000267079chr181191063311914343-
ENSG00000267480chr181203117712032180-
ENSG00000267247chr181223041012231572-
ENSG00000267199chr181243888912448204+
ENSG00000267411chr181265870912725739+
ENSG00000267249chr181267042512671144-
ENSG00000267690chr181341942013427479-
ENSG00000267702chr181348646113490675+
ENSG00000267366chr181350064013501288-
ENSG00000266954chr181364481413645684-
ENSG00000267150chr181408993414091018+
ENSG00000267356chr181410454114105225+
ENSG00000265787chr181433742214342524+
ENSG00000260263chr181852686718528428-
ENSG00000263350chr181921009919213485+
ENSG00000265943chr182027944420513727-
ENSG00000266850chr182030345420487684-
ENSG00000266495chr182083712820840318-
ENSG00000265752chr182153806021562520-
ENSG00000264745chr182157417721595303-
ENSG00000264924chr182169360121700967-
ENSG00000265750chr182173947321742175-
ENSG00000265485chr182220814622242162+
ENSG00000266573chr182230574522509040+
ENSG00000264345chr182251345122567646-
ENSG00000260372chr182423570624770662+
ENSG00000265369chr182426758524283602-
ENSG00000263677chr182426807524269632+
ENSG00000264151chr182491634325175128-
ENSG00000227279chr182553448325543651+
ENSG00000261521chr182863880628639359-
ENSG00000265888chr182868155128742752+
ENSG00000263698chr182871141928712457+
ENSG00000259985chr182926561829266786+
ENSG00000263823chr182952253829524119+
ENSG00000263393chr182970236329704441-
ENSG00000262477chr182999214529993199+
ENSG00000267746chr183180292931804725+
ENSG00000268573chr183286083132870165-
ENSG00000267583chr183302383333047052-
ENSG00000267397chr183329633433297942+
ENSG00000267627chr183353176633546081-
ENSG00000260552chr183375995933767411-
ENSG00000267651chr183481408234816205-
ENSG00000267707chr183482373934827179+
ENSG00000267374chr183678688837380282-
ENSG00000267586chr183973924740271387+
ENSG00000267414chr184225689242259682-
ENSG00000266968chr184322611843227895+
ENSG00000270112chr184433645044340307+
ENSG00000267167chr184438318744383857-
ENSG00000267724chr184463231744634433+
ENSG00000263916chr184701090647012519-
ENSG00000265496chr184701370947018248+
ENSG00000267322chr184734039347377429+
ENSG00000227115chr184887261949088939+
ENSG00000267013chr185277313552791537-
ENSG00000267325chr185344395853448952-
ENSG00000267327chr185356026953690753+
ENSG00000206129chr185367084453858493-
ENSG00000267225chr185469506354706076+
ENSG00000267040chr185529753455405276+
ENSG00000267787chr185530668755405276+
ENSG00000267226chr185633771256339109-
ENSG00000267010chr185641938056421709+
ENSG00000267705chr185641941156421130-
ENSG00000267279chr185925297959274149-
ENSG00000267390chr186103456161048862+
ENSG00000260578chr186514902865152203-
ENSG00000263424chr186517382665181267+
ENSG00000266304chr186800316568004546-
ENSG00000265579chr187041099170413196-
ENSG00000263958chr187053562370548634+
ENSG00000264247chr187225901072265744-
ENSG00000265778chr187420360874205487+
ENSG00000266256chr187432716974337897+
ENSG00000266844chr187468664674696118+
ENSG00000263146chr187673655576739074-
ENSG00000267655chr187687720776877920+
ENSG00000267628chr187701357777014856-
ENSG00000267287chr187733646077349010+
ENSG00000261126chr187779738777853362+
ENSG00000267251chr187794156377960875+
ENSG00000266933chr19490046507813-
ENSG00000267751chr19567212572215-
ENSG00000272448chr19623519623982+
ENSG00000261204chr19637105637537-
ENSG00000267020chr1910387261039063-
ENSG00000267778chr1912381781239521+
ENSG00000267493chr1912681651270240-
ENSG00000267372chr1913212241322863+
ENSG00000248015chr1913921691396466-
ENSG00000267317chr1914576641462764-
ENSG00000267715chr1914845351485273+
ENSG00000267092chr1915083811508962+
ENSG00000267161chr1915735951575474-
ENSG00000266926chr1915817891582322-
ENSG00000267007chr1918152481815872+
ENSG00000267244chr1918220881824544+
ENSG00000267125chr1918523981853621+
ENSG00000261526chr1918748811876168-
ENSG00000267283chr1919894001990369+
ENSG00000270079chr1922871632287942-
ENSG00000005206chr1923286172355099+
ENSG00000267331chr1923291112355778-
ENSG00000267201chr1924589332462183-
ENSG00000261342chr1927277412729325-
ENSG00000253392chr1929151442926805-
ENSG00000267448chr1932967633303001-
ENSG00000267436chr1935441973557567+
ENSG00000226800chr1936072453613928+
ENSG00000268670chr1940616134062747-
ENSG00000269425chr1943395744343488+
ENSG00000269318chr1943566344358445-
ENSG00000267980chr1943637864364637+
ENSG00000267769chr1944540114455283+
ENSG00000267011chr1944579594471490-
ENSG00000268565chr1946549764655536-
ENSG00000205790chr1946792944685960+
ENSG00000176840chr1947691174772545+
ENSG00000268536chr1947851324791219-
ENSG00000269604chr1947917574795571-
ENSG00000267484chr1948383444838919+
ENSG00000034063chr1949030924962165+
ENSG00000223573chr1955581785568045-
ENSG00000267571chr1959115895913910-
ENSG00000266983chr1959784146020374+
ENSG00000267299chr1961093336125808+
ENSG00000267427chr1962103906212492-
ENSG00000269680chr1967483046751478-
ENSG00000269163chr1970870637087979+
ENSG00000267852chr1974554087459925-
ENSG00000268204chr1976986527701876-
ENSG00000260500chr1979835377984042-
ENSG00000269139chr1979908867991648+
ENSG00000267939chr1980736138080909+
ENSG00000269386chr1984392578455569-
ENSG00000267986chr1986460448647599+
ENSG00000269300chr1989321778934786+
ENSG00000267510chr1994021919405158+
ENSG00000266912chr1994554609456574+
ENSG00000267273chr1996093549620755+
ENSG00000267612chr1998415299842619+
ENSG00000267289chr1999447559945689-
ENSG00000267650chr191010667310107839+
ENSG00000267387chr191019970810201053-
ENSG00000175898chr191033211110333870-
ENSG00000267105chr191036978510370721-
ENSG00000267607chr191039647710399695-
ENSG00000267197chr191060101510601676-
ENSG00000267100chr191076253810764520-
ENSG00000266936chr191112159311126687-
ENSG00000267082chr191131430411326844+
ENSG00000267174chr191141145311435117-
ENSG00000267576chr191143283211434871+
ENSG00000267277chr191147879911485611-
ENSG00000197332chr191175059111797382+
ENSG00000267274chr191205077412064196+
ENSG00000219665chr191209843212157090+
ENSG00000234773chr191230583012348582+
ENSG00000261280chr191245676312458752-
ENSG00000269560chr191264058212643787-
ENSG00000230310chr191266341112664458+
ENSG00000268945chr191279350712798093-
ENSG00000267735chr191299178312994902+
ENSG00000267417chr191312447613125325-
ENSG00000267512chr191325043113251961-
ENSG00000267633chr191388293213884932-
ENSG00000267519chr191394533013947173-
ENSG00000267783chr191422991814230349+
ENSG00000267169chr191424799114282079+
ENSG00000267723chr191436500114404017-
ENSG00000266913chr191441627014481008-
ENSG00000267147chr191444455514454725+
ENSG00000267474chr191456921314570178+
ENSG00000270143chr191534633015346819-
ENSG00000268189chr191548988715492004+
ENSG00000269589chr191550950715511167+
ENSG00000269243chr191623447116250702-
ENSG00000269399chr191665343416655625-
ENSG00000269578chr191669771616698796-
ENSG00000268087chr191672122216747342+
ENSG00000269427chr191674155416754753+
ENSG00000269044chr191674461416746080-
ENSG00000267904chr191675077816751479-
ENSG00000268743chr191695483616957284+
ENSG00000269815chr191740700517407504-
ENSG00000269720chr191750223817503093-
ENSG00000269640chr191751650317529713+
ENSG00000269481chr191752506617533133-
ENSG00000269439chr191759979917622698-
ENSG00000269145chr191825533218262498-
ENSG00000268650chr191831554018331346+
ENSG00000267959chr191839265918393560+
ENSG00000268199chr191855192018555242+
ENSG00000268938chr191864222818643440+
ENSG00000269191chr191864371818646998+
ENSG00000268030chr191866858518672370-
ENSG00000269694chr191899248918994185+
ENSG00000269019chr191905113119057640+
ENSG00000269131chr191910170219104419+
ENSG00000267629chr191936645119384178-
ENSG00000266904chr191986817519887232-
ENSG00000267581chr191987184719932525-
ENSG00000267419chr191988741119945736+
ENSG00000267481chr191989956419901340-
ENSG00000267565chr192000324220006656-
ENSG00000267268chr192001177720074273+
ENSG00000267383chr192023618620432114-
ENSG00000268119chr192162704321646710-
ENSG00000268658chr192166617621686040+
ENSG00000268081chr192173744221752039-
ENSG00000268555chr192175362421770124-
ENSG00000268038chr192279835922806773-
ENSG00000180081chr192293498522937677-
ENSG00000267886chr192325800323283163+
ENSG00000213971chr192344270823457053-
ENSG00000267934chr192350677023511903+
ENSG00000269416chr192358203523598877-
ENSG00000269397chr192411059024112089+
ENSG00000268362chr192421624724249711+
ENSG00000261824chr192817548828284848-
ENSG00000261770chr192824809228251757-
ENSG00000267575chr192828437128475892+
ENSG00000266928chr192878500028804407-
ENSG00000267528chr192937433729444152+
ENSG00000267683chr192938383829386856+
ENSG00000267339chr192945603829461781+
ENSG00000267014chr192949346229504862+
ENSG00000267498chr192970414229706722+
ENSG00000264515chr192977791830016659-
ENSG00000267553chr193191083531912101+
ENSG00000267213chr193288095632896445-
ENSG00000267475chr193317799533182656-
ENSG00000266930chr193336683133369327-
ENSG00000267714chr193370872333712076+
ENSG00000267580chr193379084033792074+
ENSG00000267296chr193379376333795960+
ENSG00000267219chr193483926134850317-
ENSG00000267024chr193491701734919178-
ENSG00000268751chr193506763835068606-
ENSG00000267767chr193528272435323773-
ENSG00000261754chr193530249335305249-
ENSG00000271109chr193534018235351480-
ENSG00000270876chr193541420335417716-
ENSG00000271032chr193550586535516239-
ENSG00000227392chr193554996335597208-
ENSG00000221857chr193562972835642239+
ENSG00000268947chr193575374935755707+
ENSG00000236144chr193603164036036931-
ENSG00000105663chr193620892136229779+
ENSG00000267439chr193623795836244316-
ENSG00000267328chr193624546736246391+
ENSG00000267049chr193626004636261930-
ENSG00000225872chr193627977836288787-
ENSG00000267388chr193645141436454965+
ENSG00000248101chr193649954036505137-
ENSG00000267698chr193650541036536874+
ENSG00000270760chr193663498336639250-
ENSG00000267053chr193679548236803570+
ENSG00000232677chr193680396936822620-
ENSG00000267309chr193698055136981942+
ENSG00000233527chr193706397237085610+
ENSG00000266935chr193711969537121092+
ENSG00000225975chr193717634237178351-
ENSG00000267353chr193726461437266810-
ENSG00000267254chr193728842037319017+
ENSG00000267345chr193756601537569507-
ENSG00000226686chr193774281437756437+
ENSG00000267605chr193775684137762420-
ENSG00000267682chr193782813837828645+
ENSG00000267381chr193797890137979554+


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.