The Cancer LncRNome Atlas



Glioblastoma Multiforme (GBM)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in GBM

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000259964chr157143998971481381-
ENSG00000260037chr157211073772115725+
ENSG00000261460chr157257120872644135+
ENSG00000260729chr157257706872668322-
ENSG00000260339chr157266845472671129+
ENSG00000261423chr157270011972767509-
ENSG00000261187chr157275746972758603-
ENSG00000260534chr157288203272884186+
ENSG00000259783chr157290082872929260-
ENSG00000260898chr157307517673090540+
ENSG00000260469chr157406055574061978+
ENSG00000261801chr157420042474220589-
ENSG00000261543chr157444514174471567-
ENSG00000259264chr157449504674513896+
ENSG00000247240chr157475360674773643+
ENSG00000260591chr157564755175648087-
ENSG00000260274chr157566049675661925+
ENSG00000260269chr157581949175893546-
ENSG00000246877chr157602001176030964-
ENSG00000260288chr157603016176055662+
ENSG00000260787chr157733417877335533-
ENSG00000269951chr157735999677360667-
ENSG00000259420chr157786131277901023+
ENSG00000259666chr157793410677943997+
ENSG00000260988chr157843358578435515+
ENSG00000259322chr157858562878588391+
ENSG00000261762chr157888146578883618-
ENSG00000261712chr157970570079706228+
ENSG00000261229chr158013588980136646-
ENSG00000259417chr158048782680544555-
ENSG00000270919chr158087237080872907-
ENSG00000271983chr158098555780986048-
ENSG00000259343chr158161671881654378+
ENSG00000259206chr158271085682726435+
ENSG00000259310chr158308738183102960+
ENSG00000259462chr158331652183361572+
ENSG00000228141chr158337922383382778-
ENSG00000259442chr158341297583419041+
ENSG00000250988chr158341931683425958+
ENSG00000252690chr158342163683425960+
ENSG00000260351chr158369132383759534+
ENSG00000260579chr158378236983783318-
ENSG00000259774chr158497731684980581+
ENSG00000259244chr158505647285070180-
ENSG00000254414chr158517512985177218-
ENSG00000259407chr158628734086293512-
ENSG00000259762chr158629356786296132-
ENSG00000259416chr158629817286299468-
ENSG00000173867chr158900294889055760-
ENSG00000271997chr158904517589049018-
ENSG00000261407chr158963030989631498-
ENSG00000261441chr158987828489879392+
ENSG00000255571chr158990481089939471+
ENSG00000259218chr159004850890067265-
ENSG00000261478chr159005219290053647+
ENSG00000259291chr159061774790625439-
ENSG00000259894chr159078864590789043+
ENSG00000259314chr159114745791157790-
ENSG00000259736chr159116323991260372-
ENSG00000259704chr159138295491384608+
ENSG00000259661chr159146344891464416-
ENSG00000224441chr159147581691478360-
ENSG00000258384chr159149546991498455-
ENSG00000258725chr159150957591531854+
ENSG00000214432chr159156584991579841+
ENSG00000258761chr159270602892715666-
ENSG00000258647chr159311104893115272-
ENSG00000260361chr159332298793324722-
ENSG00000257060chr159385578694112712+
ENSG00000258754chr159426177194614049-
ENSG00000258476chr159440633894421585+
ENSG00000260359chr159502404095027181+
ENSG00000270017chr159539881595400240-
ENSG00000248441chr159581969095870358-
ENSG00000259134chr159597632496051076+
ENSG00000247809chr159667059896870590-
ENSG00000259275chr159689746696946964+
ENSG00000258483chr159856382498565007+
ENSG00000261054chr159966903799672011-
ENSG00000261616chr159967952299685575+
ENSG00000259590chr159993538499936798-
ENSG00000254744chr15100510420100514215+
ENSG00000189419chr15100884662100890438-
ENSG00000270127chr15101087972101090358-
ENSG00000232386chr15101389766101404501+
ENSG00000259604chr15101402048101414195+
ENSG00000259583chr15101433945101459488-
ENSG00000259182chr15101708735101711026+
ENSG00000259172chr15101835624101845942+
ENSG00000259553chr15102500051102501611-
ENSG00000231439chr167291075123+
ENSG00000268836chr16235747236293-
ENSG00000236829chr16432097442960+
ENSG00000228201chr16698473699200-
ENSG00000262528chr16705034706194-
ENSG00000260394chr16728504729777-
ENSG00000261659chr16739001742554+
ENSG00000259840chr16760746761277-
ENSG00000260022chr16933780935090+
ENSG00000260439chr16971033984495+
ENSG00000260807chr1610257611031596-
ENSG00000261505chr1613678921372846-
ENSG00000260132chr1614588351462249+
ENSG00000261641chr1614953441496520+
ENSG00000260051chr1615017611502654+
ENSG00000260646chr1615629801564676+
ENSG00000260954chr1616292431630309-
ENSG00000260989chr1616305281660329+
ENSG00000261399chr1617635281764209-
ENSG00000261207chr1618015601802263-
ENSG00000255198chr1620149602015510+
ENSG00000259933chr1621414372145426+
ENSG00000261123chr1621448312147027-
ENSG00000260260chr1622047982205359-
ENSG00000259780chr1622856902286914-
ENSG00000261663chr1622904882291819+
ENSG00000260778chr1623181562323419+
ENSG00000260095chr1625025822502978-
ENSG00000260874chr1625062532509980-
ENSG00000260293chr1625265592527062+
ENSG00000261613chr1626040612606061-
ENSG00000269937chr1626114722615097-
ENSG00000261140chr1626190442621937-
ENSG00000260176chr1626940852695215-
ENSG00000260565chr1627103502723445-
ENSG00000205913chr1627870772802601-
ENSG00000263280chr1629163492917619-
ENSG00000262482chr1629897153004277-
ENSG00000270168chr1630513013052017+
ENSG00000272079chr1630561213057386+
ENSG00000261971chr1631019923109371-
ENSG00000262370chr1631269123137101-
ENSG00000263011chr1631567653159577+
ENSG00000263214chr1631604613165599-
ENSG00000263072chr1631660433184883-
ENSG00000261889chr1632067373207484-
ENSG00000262621chr1634150993536953+
ENSG00000263235chr1637006373701704-
ENSG00000262185chr1639976104000445-
ENSG00000262468chr1642958264303790-
ENSG00000262686chr1643746684378341-
ENSG00000262712chr1643858714387819-
ENSG00000267077chr1648452664846533-
ENSG00000260411chr1652898036826015+
ENSG00000260350chr1689415078942581-
ENSG00000260276chr1689419628954274+
ENSG00000260979chr1690565639060847+
ENSG00000262944chr1691987059200618+
ENSG00000260349chr1691996919201031-
ENSG00000263244chr1692010989207038+
ENSG00000261617chr1694494459501950+
ENSG00000260432chr1698472729851895-
ENSG00000263013chr161103274311033901-
ENSG00000262222chr161103457611036878+
ENSG00000263033chr161129003411318373+
ENSG00000263080chr161143566611439068-
ENSG00000263307chr161194550611989468+
ENSG00000261560chr161197493211976426-
ENSG00000262801chr161334017313656775+
ENSG00000262097chr161410313714109873-
ENSG00000262454chr161439614514420210+
ENSG00000257264chr161499535614996031+
ENSG00000258354chr161500374415005202-
ENSG00000260872chr161511196315114345-
ENSG00000260735chr161518826815203054+
ENSG00000270580chr161519858015225458-
ENSG00000261422chr161550657715507125+
ENSG00000263335chr161582053115826850+
ENSG00000263065chr161583500815835648+
ENSG00000262848chr161638399216386099-
ENSG00000263198chr161638603516388663-
ENSG00000257381chr161639400716394683+
ENSG00000257527chr161850516618505708-
ENSG00000260017chr161881440518823503+
ENSG00000261465chr161907382119079013-
ENSG00000261357chr161907731319078016+
ENSG00000260430chr161909817819109432+
ENSG00000261759chr161913129819132951-
ENSG00000188477chr161931620319322269+
ENSG00000260592chr161948823819499221-
ENSG00000260934chr161951301119513608+
ENSG00000261312chr161971767319726705+
ENSG00000261195chr161977249419777421-
ENSG00000189149chr162131217021329912+
ENSG00000261596chr162163806321638723+
ENSG00000260306chr162180541621807080-
ENSG00000260277chr162209457722103552-
ENSG00000261113chr162229802922300059-
ENSG00000260905chr162262386422624804-
ENSG00000260566chr162307370623075494-
ENSG00000260136chr162346407923468927+
ENSG00000260751chr162357999423581017+
ENSG00000260482chr162368133223684448+
ENSG00000259806chr162368345323686820+
ENSG00000259888chr162462158724652278+
ENSG00000224310chr162467274324682383-
ENSG00000261669chr162481477224831060-
ENSG00000262155chr162507825825080264+
ENSG00000260448chr162509691325122876-
ENSG00000259940chr162722463127226314-
ENSG00000259954chr162745899027464714-
ENSG00000261329chr162769026127730104-
ENSG00000246465chr162829620628303385-
ENSG00000251417chr162881409728829149+
ENSG00000261766chr162887348728874661-
ENSG00000260442chr162889027828891241-
ENSG00000260853chr162896800828978204-
ENSG00000261067chr162898612529002096+
ENSG00000260367chr162898629428990145-
ENSG00000260517chr162912744829229181+
ENSG00000198106chr162926282929519817+
ENSG00000260280chr162946641229476283+
ENSG00000260043chr162967976329681839+
ENSG00000238045chr162981996629823306-
ENSG00000261690chr162982930129832573-
ENSG00000214725chr162987491429879371+
ENSG00000260114chr162993095729933226-
ENSG00000247735chr162993815729940254+
ENSG00000250616chr163010775130115437+
ENSG00000261416chr163019482630196278-
ENSG00000213599chr163020521330215631+
ENSG00000260219chr163036676230367848+
ENSG00000260487chr163049190930492667-
ENSG00000261332chr163051008730510875-
ENSG00000235560chr163054607330548465+
ENSG00000239791chr163058357130595181+
ENSG00000260167chr163059722830619914+
ENSG00000261840chr163070903030710379-
ENSG00000260899chr163075198830762702+
ENSG00000262026chr163078977030791473+
ENSG00000260083chr163088654330906541+
ENSG00000260852chr163093064030934590-
ENSG00000261487chr163095970730967832+
ENSG00000260911chr163105447131061201+
ENSG00000261124chr163107681631080567+
ENSG00000262766chr163112939931130068+
ENSG00000260304chr163119383231194606-
ENSG00000260060chr163120745231208284+
ENSG00000261474chr163146085631464814-
ENSG00000260267chr163146803231471057-
ENSG00000260740chr163149869131499813-
ENSG00000260625chr163151979231520569+
ENSG00000261731chr163172043431723305-
ENSG00000261512chr164665677346658363-
ENSG00000261788chr164673728146737937-
ENSG00000261173chr164700790047012894+
ENSG00000260281chr164717823447196658+
ENSG00000260450chr164799958348005598+
ENSG00000260086chr164865734748778553+
ENSG00000260052chr164867105448672630+
ENSG00000261685chr165067972050683160+
ENSG00000260249chr165070012250705550+
ENSG00000261644chr165076962450774627-
ENSG00000260929chr165077482150776726-
ENSG00000261241chr165091812050934962+
ENSG00000261238chr165118315051183730+
ENSG00000260850chr165138836751390443-
ENSG00000260057chr165179643051807084+
ENSG00000262557chr165352495253527880-
ENSG00000260936chr165407330554074638+
ENSG00000245694chr165495277554963101-
ENSG00000246379chr165612689956225006-
ENSG00000272372chr165638579856387436-
ENSG00000260621chr165644323256445595+
ENSG00000261302chr165674268456763880-
ENSG00000261270chr165697419056975254+
ENSG00000261114chr165697494056975638+
ENSG00000260038chr165728126257282404+
ENSG00000260927chr165816343358193037+
ENSG00000260186chr165845523058496374+
ENSG00000259846chr166439868464634150+
ENSG00000259859chr166476982864770707+
ENSG00000246898chr166644242766446038+
ENSG00000261656chr166650369966515133-
ENSG00000260465chr166675480066765688+
ENSG00000246777chr166678565566788643+
ENSG00000258122chr166687533666887351-
ENSG00000261705chr166692191866922834+
ENSG00000261088chr166692307266924996+
ENSG00000262691chr166729501167297687+
ENSG00000270049chr166751521767521153+
ENSG00000261386chr166758311767597861-
ENSG00000259804chr166759531467596212-
ENSG00000237718chr166764828467649245-
ENSG00000266937chr166790386367906470+
ENSG00000263126chr166791636467920270+
ENSG00000267660chr166797745067978423-
ENSG00000263276chr166825861668261637+
ENSG00000262160chr166825987268263048-
ENSG00000262820chr166859596468601032+
ENSG00000260084chr166860768568623415-
ENSG00000260577chr166867928368680071-
ENSG00000260999chr166896145068982164-
ENSG00000260772chr166973696869738555+
ENSG00000262136chr166976091669776466+
ENSG00000196696chr167001020070099851-
ENSG00000247228chr167019024370207351-
ENSG00000261777chr167034954370380650-
ENSG00000260023chr167061020470611571+
ENSG00000214353chr167078900170807154+
ENSG00000262890chr167083598670836743-
ENSG00000259798chr167114725571147903+
ENSG00000262086chr167148150071486552-
ENSG00000247324chr167149618171499844+
ENSG00000260886chr167159969271612090+
ENSG00000260593chr167165761171660719-
ENSG00000261337chr167195281571959638-
ENSG00000263320chr167196391471965102+
ENSG00000261008chr167245938472698908-
ENSG00000260664chr167245984772463072+
ENSG00000259768chr167269906972821143+
ENSG00000259901chr167282314272825522+
ENSG00000272250chr167309414473094658+
ENSG00000271009chr167309436973096215+
ENSG00000261227chr167326595473267869+
ENSG00000259972chr167433910074369244-
ENSG00000260884chr167434723574349532+
ENSG00000261079chr167440136074403724+
ENSG00000261170chr167445601874469152+
ENSG00000260539chr167448132574483790-
ENSG00000261783chr167541371675415158-
ENSG00000203472chr167550979475529305+
ENSG00000261063chr167723537177283854-
ENSG00000261707chr167777536577776897-
ENSG00000260816chr167893106278933541+
ENSG00000260876chr167971000579841819+
ENSG00000261390chr167975062279804460-
ENSG00000259867chr168018895080597032-
ENSG00000261128chr168063180380636416-
ENSG00000260896chr168086263280926492-
ENSG00000260213chr168105039781069364-
ENSG00000261061chr168106437581065090+
ENSG00000260643chr168108727081121256-
ENSG00000261141chr168108890681090031+
ENSG00000260495chr168134433681347028-
ENSG00000261609chr168141687481424489+
ENSG00000261218chr168177185381801311+
ENSG00000260788chr168375472483806541-
ENSG00000260228chr168382357283841439-
ENSG00000260300chr168394173883985058+
ENSG00000260018chr168415065684151176+
ENSG00000261286chr168449286584500967-
ENSG00000270124chr168561361585617177-
ENSG00000270184chr168581798885821223+
ENSG00000268388chr168650813586542705-
ENSG00000270020chr168655398986557503-
ENSG00000270006chr168735111587351643+
ENSG00000260750chr168752616187549241+
ENSG00000269935chr168763413287635796-
ENSG00000261193chr168811276788120989-
ENSG00000205037chr168812164788134591-
ENSG00000261327chr168821090488219696-
ENSG00000260420chr168822792088228823+
ENSG00000260630chr168872970688753594+
ENSG00000260121chr168878502388786867+
ENSG00000224888chr168879758888807826+
ENSG00000256982chr168911258089119373-
ENSG00000180422chr168922555489230653+
ENSG00000259877chr168928163889284061-
ENSG00000260279chr168936391689364724+
ENSG00000261253chr168938754189391518+
ENSG00000261118chr168955842589570868-
ENSG00000261373chr168977826489784573+
ENSG00000267048chr168997256589984641+
ENSG00000259006chr168998623589989070-
ENSG00000261317chr169003619990038952+
ENSG00000260528chr169016867990244752+
ENSG00000260923chr169025240590289086+
ENSG00000262061chr17180996183279+
ENSG00000241525chr17254326263814-
ENSG00000262434chr17692984693765-
ENSG00000262777chr1713277671329778+
ENSG00000236618chr1714202251421390+
ENSG00000186594chr1716148051620468-
ENSG00000228133chr1719210101924000+
ENSG00000263050chr1719467691948262-
ENSG00000263345chr1722783552282600-
ENSG00000262456chr1722881412289958+
ENSG00000261903chr1722925602295372-
ENSG00000205821chr1723088562319379-
ENSG00000262050chr1726156032616127+
ENSG00000261916chr1735050553505566-
ENSG00000262903chr1735589153561386-
ENSG00000262692chr1736249223625782+
ENSG00000262194chr1737054593706676-
ENSG00000262758chr1737100423712148-
ENSG00000263165chr1740672044068007+
ENSG00000262823chr1743852614389648-
ENSG00000244184chr1746075254608824+
ENSG00000262165chr1747044544710308-
ENSG00000262429chr1748712904872117+
ENSG00000234203chr1748761464877976+
ENSG00000262678chr1748897614890619+
ENSG00000262227chr1748910014891741+
ENSG00000227495chr1749225094923388-
ENSG00000262693chr1749789734981408-
ENSG00000234327chr1750147635017674+
ENSG00000261879chr1750953795151364+
ENSG00000263164chr1751438035144838-
ENSG00000263220chr1752676105274921-
ENSG00000263272chr1753284595336196-
ENSG00000261996chr1765567836558328-
ENSG00000267047chr1768888136922733-
ENSG00000262089chr1768979616898508-
ENSG00000267532chr1769191376922978-
ENSG00000262880chr1773234227347400+
ENSG00000265500chr1774666047482033+
ENSG00000264772chr1774761447485342+
ENSG00000233223chr1774852827487390-
ENSG00000262251chr1775885787589689-
ENSG00000179859chr1778166427819271-
ENSG00000178977chr1781239608127361-
ENSG00000269928chr1781281398128798-
ENSG00000269947chr1781810818181754+
ENSG00000266279chr1782410158242076+
ENSG00000265749chr1782688818284646+
ENSG00000266389chr1788692138870387+
ENSG00000265975chr1788708408880312+
ENSG00000271851chr1794566409459013-
ENSG00000263400chr171063309410672323+
ENSG00000263523chr171063311310718481+
ENSG00000264016chr171064458410672333-
ENSG00000263429chr171069823010707416-
ENSG00000263508chr171075285810784212+
ENSG00000254652chr171146447311467380+
ENSG00000266368chr171185720611880911-
ENSG00000236088chr171365979513972812-
ENSG00000231595chr171411380514121239+
ENSG00000266709chr171420717114208822+
ENSG00000266378chr171423065214232791+
ENSG00000266261chr171555490415557803+
ENSG00000265519chr171569110115691519-
ENSG00000175061chr171634213616381992+
ENSG00000264673chr171669156216692548-
ENSG00000260328chr171691522816918304-
ENSG00000265511chr171741066517411622+
ENSG00000264666chr171749474217513799+
ENSG00000223979chr171757734017581002-
ENSG00000260647chr171817139418172142+
ENSG00000267350chr171822753618229211+
ENSG00000220161chr171831447318317694+
ENSG00000205266chr171831904218328411+
ENSG00000264885chr171857094218572774-
ENSG00000265478chr171871326918714253-
ENSG00000265185chr171896522518965807+
ENSG00000262074chr171896676218967449-
ENSG00000230197chr171898108818991191+
ENSG00000263394chr171899438218995138-
ENSG00000262202chr171901531319015949-
ENSG00000262319chr171904433019047002-
ENSG00000262292chr171906410219065587+
ENSG00000263934chr171909132919092027+
ENSG00000264940chr171909297819093558-
ENSG00000236022chr171910713819117358+
ENSG00000265263chr171923762119239440-
ENSG00000265126chr171931509919316431-
ENSG00000227078chr171932234819327670+
ENSG00000235979chr171934245619364305-
ENSG00000266079chr171946052419461224+
ENSG00000262681chr171962237219625741+
ENSG00000270091chr171979990319800600-
ENSG00000261033chr171991136419912547-
ENSG00000260907chr172043335520434194-
ENSG00000233098chr172077174620905589+
ENSG00000263986chr172090306020903636+
ENSG00000236819chr172097886920993928+
ENSG00000235530chr172111764421133348+
ENSG00000266050chr172146983321477781-
ENSG00000264469chr172564166925642952+
ENSG00000266313chr172566028225675517+
ENSG00000266872chr172595251025953464-
ENSG00000258924chr172668467026708716+
ENSG00000264098chr172672912826731067+
ENSG00000265254chr172673225826733814+
ENSG00000227543chr172692580826944393+
ENSG00000264608chr172692884526929302-
ENSG00000265287chr172693498126936748+
ENSG00000264044chr172696022426962968+
ENSG00000265205chr172699707226999822-
ENSG00000264577chr172704850527049895-
ENSG00000265474chr172707258727074670-
ENSG00000264304chr172721948727220360+
ENSG00000266642chr172722475627226412+
ENSG00000264808chr172769673527717795-
ENSG00000264290chr172789659827897537+
ENSG00000214719chr172890348228964482+
ENSG00000263603chr172905648729058220+
ENSG00000265791chr172910851129109239-
ENSG00000266490chr172911939029119851+
ENSG00000263531chr172919093929191958-
ENSG00000230113chr172928329829283979-
ENSG00000265743chr172929195329292518-
ENSG00000264456chr172929867029300330+
ENSG00000266340chr172930562829307268-
ENSG00000264107chr172941780529422468-
ENSG00000263990chr173020094530213685+
ENSG00000265139chr173065546030656414+
ENSG00000264083chr173075798630759860+
ENSG00000264458chr173095475731013502+
ENSG00000224113chr173333210733336762+


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.