The Cancer LncRNome Atlas



Bladder Urothelial Carcinoma (BLCA)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in BLCA

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000261447chr97228766572288629+
ENSG00000204706chr97270073272790804-
ENSG00000268364chr97280891372873782-
ENSG00000225434chr97492034674958126+
ENSG00000229587chr97762474477630952-
ENSG00000254473chr98632250986328293+
ENSG00000235298chr98658714886590692+
ENSG00000269994chr98962337089657041-
ENSG00000214888chr99047193090474314-
ENSG00000234460chr99047908190481205+
ENSG00000231632chr99162494991625393-
ENSG00000224945chr99170351991724849-
ENSG00000231107chr99306318493195787-
ENSG00000230537chr99386723993869586-
ENSG00000237422chr99388142093925369-
ENSG00000233081chr99418852094189426+
ENSG00000225511chr99490358094922396+
ENSG00000227603chr99619761496199403-
ENSG00000269929chr99693874096940174+
ENSG00000232063chr99709475897123230+
ENSG00000231806chr99731735197330409+
ENSG00000236095chr99766271197667036+
ENSG00000229065chr99787599097876743+
ENSG00000271384chr99816927298169944-
ENSG00000237857chr99817711698189078-
ENSG00000271314chr99825720698257661+
ENSG00000271155chr99826851798269918+
ENSG00000271659chr99827632798276802+
ENSG00000175611chr99852151398638259-
ENSG00000225194chr99878201498790247-
ENSG00000224848chr99944933899483403+
ENSG00000242375chr99995763399959969-
ENSG00000203279chr999962757100000982-
ENSG00000254876chr9100000731100059596+
ENSG00000255036chr9100000779100139569+
ENSG00000267026chr9101609511101634697-
ENSG00000270412chr9101705619101706057-
ENSG00000255145chr9102648608102668883-
ENSG00000270332chr9106842305106855354-
ENSG00000226334chr9107689834107691173+
ENSG00000234323chr9109040673109367076+
ENSG00000260230chr9111892573111898218-
ENSG00000259953chr9114794835114800010-
ENSG00000226609chr9115511182115512736-
ENSG00000271631chr9115647438115648047+
ENSG00000228623chr9115759495115774507-
ENSG00000225684chr9115865618115873780-
ENSG00000231528chr9115875353115882208+
ENSG00000226752chr9123587106123616651+
ENSG00000235865chr9124043046124047808-
ENSG00000261534chr9124577953124581731-
ENSG00000237548chr9124646915124725998-
ENSG00000269979chr9125086887125087594+
ENSG00000270102chr9125093146125093622+
ENSG00000261094chr9125699902125702612+
ENSG00000236901chr9125871773125877756-
ENSG00000224020chr9127420746127460910+
ENSG00000271341chr9127704887127705774-
ENSG00000271833chr9130129049130129676+
ENSG00000225032chr9130578345130584799+
ENSG00000257524chr9130630143130649066-
ENSG00000227218chr9130696782130703231+
ENSG00000269988chr9130870860130871604-
ENSG00000234771chr9130873450130881013-
ENSG00000225951chr9131231236131235291-
ENSG00000228395chr9131291180131314689-
ENSG00000234705chr9131425413131425857-
ENSG00000223478chr9131486724131495473+
ENSG00000267834chr9131766781131767277-
ENSG00000268707chr9131932713131933219+
ENSG00000204055chr9131939050131972827+
ENSG00000224307chr9132044737132048007+
ENSG00000179082chr9132083295132087184+
ENSG00000233901chr9132094579132121817+
ENSG00000204054chr9132245730132275947+
ENSG00000227619chr9132337688132346835+
ENSG00000270755chr9132806992132807360+
ENSG00000230289chr9134391945134397616-
ENSG00000224992chr9135644840135645599-
ENSG00000175164chr9136125788136150617-
ENSG00000271875chr9136125788136130950-
ENSG00000225756chr9136519708136522435-
ENSG00000235106chr9136890561136899788+
ENSG00000225361chr9138354573138372623-
ENSG00000226706chr9138395119138398293-
ENSG00000260193chr9138999654139001270-
ENSG00000237886chr9139440664139444345+
ENSG00000228401chr9139543062139554873-
ENSG00000233016chr9139615818139622636-
ENSG00000228544chr9139698379139703300-
ENSG00000260190chr9139831621139832440-
ENSG00000235117chr9139931492139932407+
ENSG00000261793chr9140063306140066436-
ENSG00000260996chr9140188320140190173-
ENSG00000233013chr9141106637141143444+
ENSG00000226179chrX281725282586+
ENSG00000236871chrX15153201518295+
ENSG00000236017chrX15206621532921+
ENSG00000223571chrX22523362254451-
ENSG00000248421chrX24050232407012-
ENSG00000234449chrX37710513800358-
ENSG00000205663chrX38094793838787-
ENSG00000205662chrX38479103855896-
ENSG00000236120chrX55714625644346-
ENSG00000234129chrX1098801111129234-
ENSG00000235385chrX1328416713321571-
ENSG00000237836chrX1890841418912615+
ENSG00000233785chrX2379110923801073-
ENSG00000260822chrX2456363324568583+
ENSG00000241886chrX3071632430740049+
ENSG00000243055chrX3071811530742291-
ENSG00000238123chrX3866082138663136-
ENSG00000235304chrX3916421039186616-
ENSG00000234636chrX4059465240597950+
ENSG00000270155chrX4109510941095832+
ENSG00000223714chrX4113499241136031+
ENSG00000231566chrX4570732845710920-
ENSG00000236751chrX4618535946187080-
ENSG00000230844chrX4640492846407671+
ENSG00000267064chrX4751823247519776+
ENSG00000224292chrX4836491148367226-
ENSG00000228343chrX4843816248439545-
ENSG00000270012chrX4912951749132231+
ENSG00000234390chrX4964189249643844-
ENSG00000227486chrX5593455656041606+
ENSG00000230105chrX5664482456650891+
ENSG00000204272chrX5675569256844813+
ENSG00000226310chrX5714809557153676+
ENSG00000231669chrX6480826164820630+
ENSG00000260118chrX6723331267234743-
ENSG00000203588chrX6938369269385056-
ENSG00000231651chrX6967280869675844-
ENSG00000228427chrX7040340970418025-
ENSG00000215115chrX7093422170938135-
ENSG00000215113chrX7098314070987054+
ENSG00000269911chrX7199743271998921+
ENSG00000229807chrX7304048673072588-
ENSG00000225470chrX7316415973290243+
ENSG00000228906chrX7316880873169393+
ENSG00000230590chrX7318379073513409-
ENSG00000270223chrX7322922473231303-
ENSG00000271430chrX7342006473461983-
ENSG00000271533chrX7342981173433495-
ENSG00000259640chrX8375503383757461-
ENSG00000236256chrX9668625796897588-
ENSG00000261295chrX9992832799928978+
ENSG00000228609chrX100258821100262962-
ENSG00000271147chrX101854440101969599+
ENSG00000223546chrX102024089102140334+
ENSG00000239407chrX102139342102161086+
ENSG00000234405chrX102752451102755245+
ENSG00000231154chrX102942212102946700+
ENSG00000231728chrX103172005103174131-
ENSG00000261409chrX107963179107968174-
ENSG00000237863chrX107979770107982133+
ENSG00000260802chrX110754890110765627+
ENSG00000271826chrX114752490114797058-
ENSG00000237903chrX118556880118557510+
ENSG00000224281chrX118599997118603061-
ENSG00000227285chrX119055224119056803-
ENSG00000244439chrX119745184119754929+
ENSG00000229033chrX122867024122868144+
ENSG00000232412chrX123093083123095191-
ENSG00000213468chrX130836678130964671-
ENSG00000232160chrX131351175131566890+
ENSG00000223749chrX133677367133680741-
ENSG00000227060chrX133684003133693953+
ENSG00000196972chrX134229058134232664-
ENSG00000178947chrX134555868134561999+
ENSG00000233093chrX135721702135724588+
ENSG00000232611chrX135923090135929956-
ENSG00000234062chrX135991554136103789+
ENSG00000236337chrX147028461147029103+
ENSG00000241489chrX148564621148614672-
ENSG00000238039chrX148593039148607803-
ENSG00000241769chrX148614831148622358-
ENSG00000225261chrX148629755148631380-
ENSG00000266560chrX151283466151307028-
ENSG00000197463chrX151876743151883038-
ENSG00000184324chrX151922445151928738+
ENSG00000224216chrX154564167154581271-
ENSG00000270726chrX155233883155255299+
ENSG00000185203chrX155244288155246502-
ENSG00000233070chrY28348852870667-
ENSG00000231535chrY28709532970313+
ENSG00000239204chrY1446580414468226+
ENSG00000233864chrY1477426514804162+
ENSG00000230663chrY1966468019691634-
ENSG00000176728chrY2103438721239302-
ENSG00000260197chrY2185382721856492-


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.