The Cancer LncRNome Atlas



Bladder Urothelial Carcinoma (BLCA)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in BLCA

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000269919chr6106548015106548468+
ENSG00000235142chr6107165327107235416-
ENSG00000272476chr6108278617108281190+
ENSG00000271734chr6108351453108351922-
ENSG00000271730chr6109319685109320328+
ENSG00000260273chr6109703998109704869+
ENSG00000230177chr6111599135111599945+
ENSG00000271789chr6111618329111619713+
ENSG00000272356chr6111630406111634720+
ENSG00000231889chr6111804714111919505+
ENSG00000255389chr6111921078111923498+
ENSG00000232316chr6113749742113754623-
ENSG00000236347chr6113852320113864995+
ENSG00000230943chr6113944737113971276-
ENSG00000227502chr6114189178114194516-
ENSG00000228624chr6114290865114792869+
ENSG00000272403chr6116765323116766023+
ENSG00000227678chr6130454555130463972-
ENSG00000228495chr6132453055132490514+
ENSG00000227954chr6133823390134213074-
ENSG00000231971chr6134749378134841723-
ENSG00000236700chr6134758854134825719+
ENSG00000232310chr6134846452134980974-
ENSG00000231028chr6135818489136037193+
ENSG00000260418chr6136656852136657225-
ENSG00000272189chr6136871799136873692+
ENSG00000237499chr6138144810138189370-
ENSG00000225177chr6139013685139018425+
ENSG00000231329chr6139465341139560442-
ENSG00000234147chr6141167095141174061-
ENSG00000236366chr6142847592142959026-
ENSG00000229017chr6143287558143359214-
ENSG00000227192chr6143360562143363461-
ENSG00000229036chr6143806116143828464+
ENSG00000270638chr6146056706146058354+
ENSG00000235652chr6146136048146207721+
ENSG00000233452chr6147163037147525750-
ENSG00000225135chr6147708800147711601+
ENSG00000233330chr6149912891149913799-
ENSG00000231760chr6150117711150119308-
ENSG00000268592chr6150183733150240643+
ENSG00000223701chr6150205567150240644+
ENSG00000235381chr6155574273155577858-
ENSG00000271265chr6157095351157095796-
ENSG00000271551chr6157097494157098211-
ENSG00000271040chr6157744996157745509+
ENSG00000236537chr6158703295158733390+
ENSG00000271913chr6159409210159485957+
ENSG00000270949chr6160529406160532536+
ENSG00000270419chr6163834097163834992-
ENSG00000223414chr6166322290166401536-
ENSG00000198221chr6168224556168227389-
ENSG00000223485chr6169558187169563019-
ENSG00000261039chr6169575401169582835-
ENSG00000226445chr6169613349169639660+
ENSG00000226194chr6169770093169788480-
ENSG00000232640chr6170125187170125950-
ENSG00000266896chr6170170509170172138+
ENSG00000229214chr6170188886170198921-
ENSG00000230423chr6171044839171045633+
ENSG00000225532chr6171045261171046865-
ENSG00000242611chr77703880418+
ENSG00000242474chr7135853149466-
ENSG00000240859chr7149597155465+
ENSG00000223855chr7560028564869+
ENSG00000237181chr7642822648119+
ENSG00000257607chr710949961098897-
ENSG00000229043chr712000101204903+
ENSG00000230487chr716097091629262+
ENSG00000236081chr717782661781927-
ENSG00000175873chr724773982487485+
ENSG00000236708chr733036643342084-
ENSG00000241269chr754594585460398+
ENSG00000188365chr754594775462753+
ENSG00000230733chr755154355519442+
ENSG00000260054chr766944956696063+
ENSG00000228010chr767036056748532+
ENSG00000230825chr772947857317410+
ENSG00000234141chr779894847990340-
ENSG00000227719chr781536558156191+
ENSG00000244239chr783018638302451+
ENSG00000229970chr783018948384146+
ENSG00000272328chr783433718380973+
ENSG00000230333chr71122135911559802+
ENSG00000225606chr71260975112611017-
ENSG00000229618chr71314101613743774+
ENSG00000272361chr71663325316633849-
ENSG00000235837chr71673549616759523-
ENSG00000237773chr71731945817338981-
ENSG00000236318chr71741449117506288+
ENSG00000236039chr71747410117500296-
ENSG00000226598chr71750306917598533-
ENSG00000260214chr71903746619042039+
ENSG00000243004chr71995860420180076-
ENSG00000233834chr72025720020261323+
ENSG00000271133chr72036792220371370-
ENSG00000232759chr72260295622613615+
ENSG00000225541chr72261122622701411-
ENSG00000179428chr72276501422767239-
ENSG00000228649chr72289387522901021+
ENSG00000230658chr72314084723145322-
ENSG00000226816chr72324563223247664+
ENSG00000223561chr72563297125790614-
ENSG00000270933chr72598827725989023-
ENSG00000225792chr72641176426416321-
ENSG00000214870chr72643821326538594+
ENSG00000233760chr72659144126596819+
ENSG00000233429chr72713526627139884+
ENSG00000253552chr72714739627173921+
ENSG00000254369chr72716959627195542+
ENSG00000270182chr72719796327198595+
ENSG00000253187chr72720823827211534+
ENSG00000240990chr72722413727228912+
ENSG00000253508chr72722619227233067-
ENSG00000243766chr72723819427246878+
ENSG00000253308chr72727886227280847-
ENSG00000253405chr72728104827286848-
ENSG00000176734chr72899297428997934-
ENSG00000223813chr72955438529603286-
ENSG00000225264chr72963841129724871-
ENSG00000196295chr73055592530634425-
ENSG00000236455chr73061712830625588-
ENSG00000236212chr73424913834295955+
ENSG00000271122chr73573482435739023+
ENSG00000227544chr73575605535774497+
ENSG00000228878chr73579457435840226-
ENSG00000260070chr73635938436360088+
ENSG00000233854chr73902384339053151-
ENSG00000228554chr73973994039742895-
ENSG00000188185chr73977323139832691+
ENSG00000259826chr73998712139989354-
ENSG00000203446chr74057772640586527-
ENSG00000261019chr74294087142942238-
ENSG00000232006chr74299373443087661-
ENSG00000231638chr74354832743562141-
ENSG00000228434chr74404364544047465-
ENSG00000235314chr74407877044081905+
ENSG00000239775chr74410450744105678+
ENSG00000260997chr74499859845000508-
ENSG00000232956chr74502262245026560-
ENSG00000146666chr74780107447806370+
ENSG00000224057chr75524744355256627-
ENSG00000244117chr76353916763545179+
ENSG00000189316chr76434890564350478-
ENSG00000179406chr76584103165866325-
ENSG00000223473chr76595608365958553-
ENSG00000237310chr76595869365960461+
ENSG00000229180chr76599291866007536-
ENSG00000226824chr76611952566134842+
ENSG00000235475chr76680096366805011+
ENSG00000225969chr77314936873150384+
ENSG00000232415chr77347390673476614-
ENSG00000232729chr77410327374143339-
ENSG00000265479chr77661026676673092+
ENSG00000214293chr77728697777325582-
ENSG00000232756chr77761970177624488+
ENSG00000234456chr77908219879100524+
ENSG00000232019chr78456866584569561-
ENSG00000233073chr78641354286415986-
ENSG00000224046chr78678073986781736-
ENSG00000182165chr78695454186974831-
ENSG00000264868chr78790020787903065-
ENSG00000227646chr78951166789840949-
ENSG00000223969chr79021993390226667-
ENSG00000243107chr79182932891836171-
ENSG00000244055chr79208687892120924+
ENSG00000237819chr79246579792546501+
ENSG00000234695chr79352022593522913+
ENSG00000231170chr79522599495243031+
ENSG00000272377chr79625131896293650-
ENSG00000231764chr79659483996643377-
ENSG00000242687chr79861078898645863+
ENSG00000244219chr79919568999208436+
ENSG00000242798chr79971283799724762-
ENSG00000241357chr7100032880100034133+
ENSG00000236305chr7100434936100450238-
ENSG00000227053chr7100657601100660889-
ENSG00000260336chr7100737328100741248+
ENSG00000232445chr7100951627100954266+
ENSG00000272544chr7101676303101677447+
ENSG00000230257chr7102613969102629303+
ENSG00000237513chr7104581510104602781+
ENSG00000228393chr7104590762104653491-
ENSG00000239569chr7104653872104654768-
ENSG00000242154chr7104944724104947089+
ENSG00000228742chr7106415457106436010+
ENSG00000272072chr7106833004106833745-
ENSG00000241764chr7107383262107385026-
ENSG00000225535chr7114719012114766368+
ENSG00000237813chr7115878314116139519-
ENSG00000227199chr7116592500116594388-
ENSG00000230316chr7121943712121950131+
ENSG00000224897chr7124569927124819369+
ENSG00000224899chr7124791380124793665-
ENSG00000224138chr7126990182126991577+
ENSG00000271553chr7128307097128308210+
ENSG00000270810chr7128327342128327926+
ENSG00000271344chr7128330505128331771+
ENSG00000135253chr7128502505128550773-
ENSG00000239815chr7128506633128508898+
ENSG00000240685chr7128808053128809538+
ENSG00000243230chr7128849616128853386-
ENSG00000229196chr7129781571129782455+
ENSG00000270953chr7130147501130148123+
ENSG00000236753chr7130994503131012981-
ENSG00000234352chr7136370306136866854-
ENSG00000260231chr7139877061139879440+
ENSG00000240889chr7140395136140396877-
ENSG00000244701chr7141352181141356610-
ENSG00000270157chr7141362722141363646-
ENSG00000228775chr7141404138141438146-
ENSG00000232533chr7143076785143077588-
ENSG00000229153chr7143104906143220542+
ENSG00000244198chr7143891951143977640+
ENSG00000244479chr7143948357144053274-
ENSG00000197558chr7149473131149531068+
ENSG00000204934chr7149564786149577699-
ENSG00000261305chr7150038860150039696+
ENSG00000240449chr7150060866150069679-
ENSG00000242258chr7150130742150145228+
ENSG00000244151chr7150771829150773617-
ENSG00000243836chr7151106247151110440+
ENSG00000239911chr7151574127151576299+
ENSG00000229591chr7151817086151818802-
ENSG00000261455chr7152160871152162634+
ENSG00000234722chr7153097005153111048-
ENSG00000182648chr7156264890156433286-
ENSG00000241558chr7156376854156398461-
ENSG00000224903chr7156446879156450387-
ENSG00000225666chr7156461646156469257-
ENSG00000235029chr7156799001156799826+
ENSG00000243479chr7156803499156809120+
ENSG00000229660chr7157074230157075380-
ENSG00000233038chr7157647221157658784+
ENSG00000231419chr7158799213158822886+
ENSG00000272240chr8184347184887-
ENSG00000249868chr8255306281026-
ENSG00000182366chr8325931333174-
ENSG00000272293chr8400714401343-
ENSG00000272005chr8424455427966+
ENSG00000253982chr817101561712668-
ENSG00000246089chr862610726264663-
ENSG00000249898chr864759966565730-
ENSG00000271927chr865035766506025+
ENSG00000245857chr866930766742798+
ENSG00000215374chr871591337212876-
ENSG00000253893chr880253418084136-
ENSG00000254153chr883144198318847-
ENSG00000254340chr889989349002945+
ENSG00000248538chr890465219060364+
ENSG00000272267chr894126569414030-
ENSG00000253641chr81033207510339484+
ENSG00000253649chr81034038810405095-
ENSG00000272505chr81034431710347176+
ENSG00000248896chr81058682410628902+
ENSG00000269918chr81096220110964214-
ENSG00000255310chr81096529810967236-
ENSG00000270076chr81106047411061180+
ENSG00000255020chr81120325711205011-
ENSG00000269899chr81170366311703900-
ENSG00000255052chr81197329112008698+
ENSG00000255495chr81205197612053789+
ENSG00000227888chr81221952712268510+
ENSG00000270074chr81227033612271882+
ENSG00000270154chr81233397112334631+
ENSG00000271948chr81708247317082978-
ENSG00000253671chr81766645017678377+
ENSG00000245281chr81794237717953903+
ENSG00000254064chr82211208922132675-
ENSG00000251034chr82239835822402918-
ENSG00000253200chr82247142122474170-
ENSG00000261026chr82253652622541522-
ENSG00000253125chr82254766322656129+
ENSG00000245025chr82284210922876848-
ENSG00000253616chr82292889022932001-
ENSG00000253930chr82304679223048188+
ENSG00000246582chr82308198423088439+
ENSG00000253837chr82319368423223638+
ENSG00000272163chr82476967824772230-
ENSG00000104725chr82480846824814624-
ENSG00000253476chr82528303725284096-
ENSG00000246339chr82855371828558981-
ENSG00000259366chr82891345228914202+
ENSG00000259607chr82892479628925971+
ENSG00000260253chr82920993729210687-
ENSG00000251191chr82953143829605625-
ENSG00000253490chr82960582529656008+
ENSG00000271869chr83001334630013748-
ENSG00000272375chr83005492030055564+
ENSG00000254109chr83023963530242917-
ENSG00000104691chr83058976430624522+
ENSG00000272327chr83262364332625477+
ENSG00000247134chr83285369632902373+
ENSG00000272338chr83321836133218933-
ENSG00000253123chr83718819037189502-
ENSG00000253746chr83726295737264242-
ENSG00000253161chr83727885937411701-
ENSG00000253414chr83737392837374539-
ENSG00000254290chr83745499837457376-
ENSG00000260949chr83792039937921309+
ENSG00000272128chr83795698937957449+
ENSG00000272092chr83823988238240979+
ENSG00000272159chr83826556638266260-
ENSG00000255201chr83827940738283614+
ENSG00000253829chr83870238438703957-
ENSG00000253133chr84139167441435887-
ENSG00000253174chr84139790041402563-
ENSG00000264578chr84146721141479021-
ENSG00000260588chr84168568341687452-
ENSG00000253408chr84209119342128715-
ENSG00000254165chr84239267242393447-
ENSG00000255366chr84810239548104885+
ENSG00000269924chr84843995948440710+
ENSG00000228801chr85281188552859733+
ENSG00000272024chr85286284452863250+
ENSG00000253844chr85287401852935534+
ENSG00000254204chr85442773054428465+
ENSG00000237807chr85442773154436491-
ENSG00000260955chr85495554954958189-
ENSG00000271722chr85692604656926727+
ENSG00000272343chr85713524757135732+
ENSG00000246430chr85740880557472382-
ENSG00000167912chr86003159960033905+
ENSG00000251396chr86129714761429354-
ENSG00000254802chr86187836161880334-
ENSG00000270673chr86408028464081001-
ENSG00000261542chr86412853964130592+
ENSG00000272010chr86650408566504707-
ENSG00000272155chr86662656966627013-
ENSG00000272192chr86675498766755566+
ENSG00000253138chr86710432867109550+
ENSG00000245910chr86783391967838633-
ENSG00000271966chr86825621068257322+
ENSG00000261658chr87057928470582549-
ENSG00000246528chr87074634670767206+
ENSG00000253143chr87138334771392858-
ENSG00000253636chr87396441373975296+
ENSG00000250295chr87420994674268696-
ENSG00000253302chr87433223974353761+
ENSG00000254288chr87496457575012088+
ENSG00000253706chr87571101975779174-
ENSG00000253712chr87607993976088891-
ENSG00000249395chr87613563976236976-
ENSG00000253661chr87740343577595513-
ENSG00000254266chr87933833879470738-
ENSG00000260398chr87951818779521940+
ENSG00000261618chr87974976479752757+
ENSG00000272138chr88068037780715077+
ENSG00000272518chr88086870080869616-
ENSG00000272264chr88094495980945535-
ENSG00000251867chr88139679681397854-
ENSG00000260317chr88145353581455339+
ENSG00000253214chr88206651482076834+
ENSG00000272425chr88218763482189805-
ENSG00000254027chr88219210682193681-
ENSG00000253898chr88431599384321135+
ENSG00000260493chr88608431286089297-
ENSG00000253549chr88635408086377144-
ENSG00000254231chr88734550387355543-
ENSG00000251136chr89062163890769955-
ENSG00000246792chr89165866991668826+
ENSG00000253738chr89207213792082417-
ENSG00000271971chr89472760694728341-
ENSG00000253854chr89473180294733395+
ENSG00000253722chr89474544494746250+
ENSG00000264448chr89492796294928910-
ENSG00000253704chr89556595095581973+
ENSG00000261437chr89564951395651695-
ENSG00000272509chr89589683795897298+
ENSG00000253878chr89596226595963624+
ENSG00000245080chr89607903696085410-
ENSG00000253773chr89621668496822364+
ENSG00000245970chr89905395499056349+
ENSG00000271930chr89995582399956326+
ENSG00000253948chr8100008991100025272-
ENSG00000253217chr8101349823101362935+
ENSG00000253666chr8101487903101513376+
ENSG00000260368chr8101925475101926616-
ENSG00000248599chr8102064282102088479+
ENSG00000261087chr8102179033102181857-
ENSG00000271882chr8102220376102220786+
ENSG00000254024chr8102473405102504727-
ENSG00000246263chr8103251622103265561+
ENSG00000272037chr8103268620103270049+
ENSG00000253669chr8103817745103822199+
ENSG00000247081chr8104169218104311000-
ENSG00000266289chr8104395306104396082-
ENSG00000271830chr8104493494104493847-
ENSG00000253477chr8104495626104513904-
ENSG00000251003chr8106792474107072752-
ENSG00000254615chr8107282372107285127+
ENSG00000253327chr8117886663117889107+
ENSG00000253972chr8120227351120259088-
ENSG00000254343chr8121064419121068440+
ENSG00000272502chr8121824459121825599+
ENSG00000248690chr8122651533122656933+
ENSG00000255364chr8123426571123440790-
ENSG00000255325chr8123497754123502054-
ENSG00000272384chr8123792210123793069-
ENSG00000272043chr8123792999123793310+
ENSG00000253258chr8124193878124195028-
ENSG00000204949chr8124213412124214983-
ENSG00000271975chr8125318430125320617-
ENSG00000245149chr8125474726125486817-
ENSG00000253106chr8125500751125503884+
ENSG00000272486chr8125591872125592889+
ENSG00000255080chr8125847126125869758-
ENSG00000249816chr8125860979125966570+
ENSG00000253167chr8126052926126057231+
ENSG00000245164chr8126934552126963493-
ENSG00000244791chr8127337740127341780+
ENSG00000254286chr8127570120127725660+
ENSG00000253438chr8127859300128033259+
ENSG00000247844chr8128220111128231333-
ENSG00000246228chr8128302062128494384-
ENSG00000249375chr8128698588128746213-
ENSG00000249859chr8128806779129113499+
ENSG00000254317chr8130844547130856750+
ENSG00000270137chr8133838424133839148+
ENSG00000261220chr8134585426134586104+
ENSG00000253593chr8134898739134914650+
ENSG00000259820chr8135804263135810515-
ENSG00000254258chr8140472305140475259-
ENSG00000259891chr8141515912141518142-
ENSG00000259758chr8141530255141539600-
ENSG00000253266chr8142065389142070695+
ENSG00000253210chr8142136143142140060-
ENSG00000253307chr8142262385142263391-
ENSG00000261655chr8142363503142365465-
ENSG00000271959chr8142444645142448054+
ENSG00000234616chr8143738874143763386-
ENSG00000247317chr8144063155144099854-
ENSG00000253716chr8144362331144363860-
ENSG00000272172chr8144372569144372791-
ENSG00000254389chr8144448801144450718-
ENSG00000254859chr8144624143144631899-
ENSG00000254741chr8144661806144662840+
ENSG00000271912chr8144683416144685394+
ENSG00000254812chr8144714241144715926-
ENSG00000181097chr8144778324144780583+
ENSG00000254548chr8144800416144801061-
ENSG00000203499chr8144816310144828507+
ENSG00000254973chr8144840323144853992-
ENSG00000214733chr8144871090144872629+
ENSG00000204791chr8145104030145106423+
ENSG00000255224chr8145132905145134168-
ENSG00000232600chr8145660602145665354+
ENSG00000255182chr8145721001145730827-
ENSG00000261139chr8145721763145725663-
ENSG00000265393chr8145737950145739056+
ENSG00000255559chr8146228197146231432+
ENSG00000227518chr92765730891+
ENSG00000225655chr97270188826+
ENSG00000227155chr9454304492112-
ENSG00000226403chr9547317549531+
ENSG00000236199chr920419002046023-
ENSG00000236404chr924227022641395-
ENSG00000232104chr935267233671646+
ENSG00000235326chr936745463691814+
ENSG00000225408chr957190215720244-
ENSG00000236924chr966459566670635+
ENSG00000225489chr967165486727438+
ENSG00000225706chr988581308862255+
ENSG00000270547chr91340637913433052-
ENSG00000226197chr91344649013487510+
ENSG00000260912chr91945320719455171+
ENSG00000171889chr92145564121559668-
ENSG00000265194chr92185890921861925-
ENSG00000240498chr92199477722121096+
ENSG00000234840chr92264619922824212+
ENSG00000235453chr93255114232567003+
ENSG00000233554chr93316697333179981+
ENSG00000226562chr93358069333605289+
ENSG00000260947chr93369745733700984+
ENSG00000261215chr93466190034666026-
ENSG00000230074chr93466566234681295+
ENSG00000269900chr93565774835658015-
ENSG00000227388chr93577216035790429+
ENSG00000235387chr93590948035911683+
ENSG00000233137chr93707989337090398+
ENSG00000234160chr93750914737510296+
ENSG00000204860chr93862047138624987+
ENSG00000204837chr94196161542019580-
ENSG00000223839chr94246631742474239+
ENSG00000237357chr94440176644404440+
ENSG00000235659chr94500190745003117-
ENSG00000232116chr94548457245488153+
ENSG00000231212chr94666124246662837-
ENSG00000204802chr94668542946688137-
ENSG00000226007chr94684363846846025+
ENSG00000238113chr96645728566469310+
ENSG00000234665chr96651348866553911-
ENSG00000170161chr96655327366555928+
ENSG00000182021chr96701740067032072-
ENSG00000225411chr96839787868409893-
ENSG00000231242chr96908253669108793-
ENSG00000237543chr96914693969149621+
ENSG00000226904chr97084356770844228+
ENSG00000224958chr97097010570972768-
ENSG00000233178chr97101060971021416-


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.