The Cancer LncRNome Atlas



Bladder Urothelial Carcinoma (BLCA)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in BLCA

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000272087chr3158410909158411557-
ENSG00000272440chr3158413156158413370+
ENSG00000240207chr3158450052158501859+
ENSG00000271778chr3158500336158500913+
ENSG00000272247chr3158519046158519724-
ENSG00000260572chr3160471216160472930-
ENSG00000269888chr3161146900161147401+
ENSG00000242795chr3169331298169341739-
ENSG00000270141chr3169482308169482848-
ENSG00000269889chr3169487437169489831+
ENSG00000269984chr3169494980169498122-
ENSG00000270135chr3169511283169511754+
ENSG00000270096chr3169512750169514001+
ENSG00000270567chr3169805372169806638-
ENSG00000268220chr3169805598169807378+
ENSG00000228221chr3177159709177470093+
ENSG00000231574chr3177534653177617012+
ENSG00000237978chr3178244293178578193-
ENSG00000260743chr3179058110179059675+
ENSG00000269728chr3179113877179115965-
ENSG00000242539chr3179114749179116979+
ENSG00000242808chr3180707558181554668+
ENSG00000260377chr3182457457182458636-
ENSG00000243368chr3182734043182735596+
ENSG00000233885chr3183524245183526729-
ENSG00000263826chr3186499569186501968-
ENSG00000232233chr3186528669186543310-
ENSG00000228952chr3187166633187167238+
ENSG00000223401chr3187461474187463208+
ENSG00000270959chr3187868994187871845-
ENSG00000234076chr3188659504188665428-
ENSG00000223812chr3191275113191308145+
ENSG00000229155chr3193560349193561813-
ENSG00000214146chr3193675161193721448-
ENSG00000230102chr3193723226193788759-
ENSG00000232874chr3193848405193848990-
ENSG00000225742chr3193920805193967942-
ENSG00000214145chr3194014254194030592-
ENSG00000233058chr3194208183194239008+
ENSG00000244675chr3194217046194222232-
ENSG00000231770chr3194304740194310989+
ENSG00000229334chr3194353652194366130+
ENSG00000230266chr3194868600194873519+
ENSG00000229325chr3195001452195003470-
ENSG00000223711chr3195270871195277400+
ENSG00000229178chr3195382436195384798-
ENSG00000242086chr3195384933195460422+
ENSG00000223783chr3195563064195587275-
ENSG00000224614chr3195634947195638128+
ENSG00000226155chr3195638920195640857+
ENSG00000260261chr3195676059195679566-
ENSG00000224652chr3195869507195887761+
ENSG00000235897chr3196045201196052441+
ENSG00000232065chr3196358369196359458-
ENSG00000230732chr3196639972196641450+
ENSG00000270170chr3196669494196670411+
ENSG00000228109chr3196726331196731615+
ENSG00000227375chr3197025123197030618+
ENSG00000236833chr3197387436197392628-
ENSG00000236438chr3197879237197925886+
ENSG00000250312chr4124386157779+
ENSG00000249592chr4756175775637-
ENSG00000196810chr412430881282079+
ENSG00000244459chr415757891581980-
ENSG00000270195chr417145481715349+
ENSG00000206113chr424207012452087+
ENSG00000249673chr429366262963465+
ENSG00000261643chr435053243506184-
ENSG00000250986chr437604753765117-
ENSG00000253917chr439169103957148-
ENSG00000247708chr445438584639631+
ENSG00000251580chr466724526675557-
ENSG00000170846chr466751786677774+
ENSG00000246526chr466891756692246-
ENSG00000245468chr470962987105112-
ENSG00000251615chr483568178359103-
ENSG00000205959chr484839978514337+
ENSG00000250413chr41000810610011349+
ENSG00000261490chr41006971310074643-
ENSG00000251152chr41147087411479820+
ENSG00000249631chr41162733811815582+
ENSG00000246095chr41354769913549425-
ENSG00000248360chr41447571114889793-
ENSG00000263327chr41622828616321763+
ENSG00000240005chr42686142826862221-
ENSG00000248936chr43758970937590497-
ENSG00000231160chr43861432238666504-
ENSG00000249685chr43913553339137228+
ENSG00000249348chr43952963939596327+
ENSG00000238206chr43954945639551432+
ENSG00000255458chr43964076039668264+
ENSG00000260296chr44016829540169451+
ENSG00000250893chr44042813640429602+
ENSG00000251350chr44401887844024080+
ENSG00000259959chr44784213947846356-
ENSG00000248866chr45352557353527835+
ENSG00000226950chr45357859753586518+
ENSG00000248494chr45445912354470214+
ENSG00000249700chr45623013856262009-
ENSG00000269921chr45725379157254319+
ENSG00000270147chr45726247857263037+
ENSG00000270109chr45733032457330745+
ENSG00000269949chr45782709357827539-
ENSG00000249413chr46686456467015730+
ENSG00000248049chr46856699868946670+
ENSG00000250220chr47412492674183670+
ENSG00000260265chr47600691276009927-
ENSG00000251185chr47619427876286392-
ENSG00000250735chr47632640576348233+
ENSG00000251442chr47956705779603853+
ENSG00000249307chr47989290280229952+
ENSG00000251022chr48381416283822113-
ENSG00000250546chr48471758985214565-
ENSG00000180769chr48588753885932430+
ENSG00000261496chr48693344986935027-
ENSG00000249001chr48848918788655108-
ENSG00000248019chr48963094089651254+
ENSG00000271359chr49003265190033519+
ENSG00000270720chr49004043590041022+
ENSG00000251095chr49047250790647654+
ENSG00000271474chr49647028096473608+
ENSG00000254044chr49825578698554974-
ENSG00000214559chr49917283999182781-
ENSG00000260641chr49958005599585701+
ENSG00000246090chr4100010008100222513+
ENSG00000248161chr4103339759103371167-
ENSG00000260651chr4103421998103422476-
ENSG00000246560chr4103749212103765232+
ENSG00000248740chr4104177316104374815+
ENSG00000251259chr4106058437106061776-
ENSG00000232021chr4109088681109177992+
ENSG00000247950chr4110268631110354973-
ENSG00000260526chr4113150717113152752-
ENSG00000249532chr4113567632113571207-
ENSG00000269893chr4119199864119200978+
ENSG00000260404chr4119512928119554884+
ENSG00000249356chr4119990479119991452-
ENSG00000260091chr4120330488120331388+
ENSG00000250950chr4120377505120378432+
ENSG00000249464chr4124571422124851561+
ENSG00000261668chr4128761353128765195-
ENSG00000251432chr4129213906129440549+
ENSG00000246876chr4130645326130692636-
ENSG00000250033chr4138978618139099331+
ENSG00000261268chr4140539290140544386-
ENSG00000196951chr4141204880141294514-
ENSG00000248810chr4142240604142253772-
ENSG00000250326chr4143854348144106014-
ENSG00000251600chr4144833484144903607+
ENSG00000248890chr4145564074145582509-
ENSG00000270681chr4152061143152062255+
ENSG00000270265chr4152254927152274376-
ENSG00000251603chr4152588376152591654+
ENSG00000251455chr4152595635152599045+
ENSG00000245954chr4153021906153025872+
ENSG00000270750chr4153241696153242196-
ENSG00000268471chr4153457416153460415+
ENSG00000260244chr4156655600156658214+
ENSG00000248429chr4159091904159124029+
ENSG00000250604chr4159120257159121594-
ENSG00000248771chr4165675216165724947+
ENSG00000248329chr4165798156165820117+
ENSG00000250266chr4171195070171204230+
ENSG00000245213chr4174053079174090803-
ENSG00000237125chr4174448421174512475+
ENSG00000250596chr4175444852175461495-
ENSG00000251584chr4175457791175461935+
ENSG00000250131chr4178366133178598280+
ENSG00000177822chr4182795591183066402-
ENSG00000251359chr4184018170184020352-
ENSG00000248206chr4184908831184909903+
ENSG00000180712chr4185261909185275130-
ENSG00000249096chr4185286341185291024-
ENSG00000270426chr4185393078185393763-
ENSG00000271646chr4185395956185398458+
ENSG00000271538chr4185427614185458708-
ENSG00000251230chr4185765739185776905-
ENSG00000249430chr592266139978+
ENSG00000260774chr5214013217394-
ENSG00000248925chr5269973271631-
ENSG00000225138chr5473351480999+
ENSG00000271781chr5675941676731+
ENSG00000215246chr5987295997423-
ENSG00000272347chr510051541006738+
ENSG00000271119chr515947411611582+
ENSG00000249731chr519682081969127+
ENSG00000250056chr565822496588612+
ENSG00000272520chr566712196674499+
ENSG00000272071chr567795716780111+
ENSG00000272049chr584450628445648-
ENSG00000247516chr584508568463208+
ENSG00000250786chr595463129550721+
ENSG00000272417chr51020371210204152-
ENSG00000271980chr51026470910267258-
ENSG00000259802chr51035281310353713-
ENSG00000272016chr51065433210657928+
ENSG00000261360chr51466191714664713-
ENSG00000272057chr51487244114872822+
ENSG00000250337chr52747239927496508+
ENSG00000250764chr53210355132122047-
ENSG00000272086chr53217457732175378+
ENSG00000249572chr53342413133440725-
ENSG00000271874chr53465156234651993-
ENSG00000272323chr53483765434839383-
ENSG00000245711chr53622115736222004+
ENSG00000250155chr53666631636725297-
ENSG00000248587chr53784054037875901+
ENSG00000244968chr53855688838671318+
ENSG00000249740chr53873615738845931-
ENSG00000271334chr53952053339524810+
ENSG00000248668chr54187013241871059+
ENSG00000271788chr54300683543007645-
ENSG00000177738chr54301451643067521-
ENSG00000272382chr54303381843034737+
ENSG00000215068chr54304167743045492+
ENSG00000272144chr54306149743062543+
ENSG00000261604chr54328770343290941+
ENSG00000249492chr54348406143509458+
ENSG00000248554chr54351116043521913+
ENSG00000248092chr54357169643603332-
ENSG00000251141chr54474500244808879-
ENSG00000272335chr54482617844828694+
ENSG00000271752chr54995869349959100-
ENSG00000259663chr55066857050679166-
ENSG00000272123chr55238484652385298-
ENSG00000247796chr55240567252410956+
ENSG00000272416chr55317612353176881-
ENSG00000240535chr55431712754330098-
ENSG00000251307chr55452976254591029+
ENSG00000271828chr55622370156225400+
ENSG00000152931chr55978354059843484+
ENSG00000272308chr56016228460162762-
ENSG00000272370chr56431586564316378+
ENSG00000272354chr56431644164316816+
ENSG00000269961chr56522045765220963-
ENSG00000229666chr56629721166299781-
ENSG00000270107chr56647544166476415-
ENSG00000249364chr56667520667101066+
ENSG00000249352chr56826626668325992-
ENSG00000250237chr56833434568339648-
ENSG00000269983chr56974546369746180+
ENSG00000254353chr57032899570330227-
ENSG00000272093chr57165651771658805+
ENSG00000272365chr57166344671664222+
ENSG00000261269chr57173573071738214-
ENSG00000271926chr57224946272250101-
ENSG00000272081chr57225103372251526-
ENSG00000247993chr57274218472742811+
ENSG00000272525chr57279337572794118-
ENSG00000271714chr57416171874163679+
ENSG00000250889chr57434354474348668-
ENSG00000271815chr57465958574660067+
ENSG00000272040chr57490464274905808+
ENSG00000266045chr57562766275629781+
ENSG00000250615chr57636970676370345+
ENSG00000250802chr57638256576462734+
ENSG00000245556chr57763818977656331-
ENSG00000249825chr57934819779379477-
ENSG00000251675chr57942418479439706+
ENSG00000249042chr57977811279783882-
ENSG00000247572chr58049990380597379-
ENSG00000248870chr58188259581883230-
ENSG00000271862chr58234519582346783-
ENSG00000250320chr58368024583786583+
ENSG00000250874chr58495905084960502+
ENSG00000272367chr58667207386672997-
ENSG00000247828chr58756471287732502+
ENSG00000248309chr58817914588762215+
ENSG00000260871chr58968428589685180-
ENSG00000234292chr59057591490576959-
ENSG00000248323chr59059884690610219-
ENSG00000237187chr59274506592921354-
ENSG00000251023chr59319637593199531-
ENSG00000250240chr59503695395067999-
ENSG00000249180chr59607678396078402-
ENSG00000248734chr59612048196121703+
ENSG00000272109chr59614005696141808+
ENSG00000246763chr59810532298109173-
ENSG00000250682chr5101944860102007263-
ENSG00000251026chr5103415612103441104+
ENSG00000272523chr5108063526108063961-
ENSG00000271849chr5109023503109024030-
ENSG00000248268chr5110613215110638265-
ENSG00000246859chr5110847924111075423+
ENSG00000224032chr5111496223111499973+
ENSG00000270067chr5112229030112229698+
ENSG00000272389chr5112233720112234068+
ENSG00000232633chr5112658725112772871+
ENSG00000248175chr5114539713114541943-
ENSG00000271797chr5114598202114599145+
ENSG00000249249chr5114937754114956356+
ENSG00000272265chr5115413807115414267-
ENSG00000271918chr5115419504115421113-
ENSG00000248445chr5115783243115843972+
ENSG00000248663chr5116751205116881993+
ENSG00000248927chr5120116913120126473+
ENSG00000249916chr5121705457121719263-
ENSG00000250328chr5121772192121814782-
ENSG00000260686chr5122168051122170228+
ENSG00000249996chr5122371966122390362+
ENSG00000223652chr5122422943122425994-
ENSG00000250602chr5125769197125826063-
ENSG00000230561chr5127039082127277326+
ENSG00000245937chr5127276118127418864-
ENSG00000233006chr5131646978131705608-
ENSG00000234290chr5131804582131808735-
ENSG00000271737chr5133340838133341253+
ENSG00000270177chr5133562101133563518+
ENSG00000248559chr5133735186133737612+
ENSG00000251169chr5133842243133844920+
ENSG00000249082chr5134374528134375737-
ENSG00000270021chr5134734970134736986+
ENSG00000164621chr5135465196135470579-
ENSG00000271824chr5135527156135528822-
ENSG00000270237chr5137081340137081840-
ENSG00000250159chr5137150022137225025-
ENSG00000249971chr5137682716137685330-
ENSG00000253404chr5138080123138088998-
ENSG00000249593chr5138348336138386892+
ENSG00000245146chr5139452442139488215-
ENSG00000254363chr5139536904139552636+
ENSG00000249637chr5139750476139780952-
ENSG00000272154chr5140479829140481794-
ENSG00000272108chr5140498262140500347+
ENSG00000272070chr5140705777140708924+
ENSG00000228737chr5140997981141006048+
ENSG00000271871chr5141331984141332940+
ENSG00000231185chr5141704858142051566+
ENSG00000236714chr5142125165142140563+
ENSG00000250343chr5146559767146614422-
ENSG00000247199chr5147647870147763346-
ENSG00000251330chr5147809722147810370+
ENSG00000250072chr5148442880148489350+
ENSG00000253865chr5148751737148754679+
ENSG00000249669chr5148786252148808241+
ENSG00000269936chr5148809849148812397+
ENSG00000230551chr5148872949148884233-
ENSG00000271795chr5150889014150892330+
ENSG00000260581chr5151031836151035010+
ENSG00000272112chr5151104392151104917-
ENSG00000254226chr5151329132151650009+
ENSG00000245275chr5153708997153825410-
ENSG00000251405chr5156789623156887086-
ENSG00000248544chr5156802749156811958-
ENSG00000245812chr5158527491158544486+
ENSG00000247699chr5159622751159631833-
ENSG00000253522chr5159895275159914433+
ENSG00000253417chr5160358785160365633-
ENSG00000253978chr5167656588167659362-
ENSG00000254192chr5168081518168094766+
ENSG00000204758chr5172381789172386395-
ENSG00000254211chr5173213793173236042-
ENSG00000249306chr5173763298173959460+
ENSG00000250256chr5174045167174052778+
ENSG00000248596chr5175570088175626298-
ENSG00000250909chr5175774944175780587+
ENSG00000251414chr5175781209175783171+
ENSG00000251666chr5176478715176479964+
ENSG00000246334chr5176865504176874700-
ENSG00000248996chr5176921996176930648+
ENSG00000272459chr5176981825176982365+
ENSG00000247679chr5177038254177046755+
ENSG00000249684chr5177377336177390961+
ENSG00000254035chr5178396391178417117+
ENSG00000253163chr5178804532178805762-
ENSG00000250999chr5179084763179091433+
ENSG00000248367chr5179720245179722253+
ENSG00000260841chr5180211782180214869-
ENSG00000245060chr5180257957180262726+
ENSG00000250222chr5180618924180621429+
ENSG00000250900chr5180622496180630103+
ENSG00000233937chr5180673523180699168+
ENSG00000248275chr5180688213180699308+
ENSG00000238035chr5180733503180755068+
ENSG00000250765chr5180756242180769214+
ENSG00000272463chr6708592711405-
ENSG00000261730chr613840251385301-
ENSG00000272279chr615285991529146-
ENSG00000250903chr622459822482256+
ENSG00000272465chr624377832438483+
ENSG00000230438chr628548912876744-
ENSG00000244041chr629882012991407+
ENSG00000224846chr629899602999368-
ENSG00000270346chr630203883022984+
ENSG00000261015chr630250253027659+
ENSG00000272277chr630682793069128-
ENSG00000272320chr633118963313884+
ENSG00000270504chr637513453754105+
ENSG00000260604chr639051443912213-
ENSG00000272248chr640189474019436+
ENSG00000272142chr650302065043683+
ENSG00000271978chr650319905054657-
ENSG00000261211chr666805426683866-
ENSG00000226281chr666929776711235-
ENSG00000261189chr675406847541571-
ENSG00000230939chr687844118785678+
ENSG00000229950chr61040957310416679+
ENSG00000183674chr61042948810435107-
ENSG00000272097chr61074355710747896-
ENSG00000229896chr61200790312009089+
ENSG00000215022chr61326509313295818-
ENSG00000272379chr61329025013290722-
ENSG00000261071chr61361434313615387-
ENSG00000272209chr61382566313826805+
ENSG00000234261chr61497701915090234-
ENSG00000271888chr61524415415245231-
ENSG00000235488chr61524804615248865-
ENSG00000229931chr61676136916762883+
ENSG00000272341chr61676457716767114+
ENSG00000272269chr61770648817707575+
ENSG00000228412chr61980239519804983-
ENSG00000272168chr62166500322214734+
ENSG00000261568chr62222101022222624+
ENSG00000272345chr62470113524702021-
ENSG00000272402chr62470697524707379+
ENSG00000272053chr62501518025042398-
ENSG00000272065chr62599098925991454+
ENSG00000272462chr62599289025998545+
ENSG00000228223chr62652207626526807+
ENSG00000261353chr62652729126527632+
ENSG00000233631chr62663461126637008-
ENSG00000261584chr62668646926688192+
ENSG00000224843chr62692477126991703+
ENSG00000272312chr62696898726969427-
ENSG00000272468chr62709043627091000-
ENSG00000271755chr62737178927374743-
ENSG00000272009chr62804657028048908-
ENSG00000269293chr62808957328105071-
ENSG00000204623chr62996878830029417-
ENSG00000231074chr63025517430294927-
ENSG00000272540chr63069088230691654-
ENSG00000272273chr63071070630711369+
ENSG00000272501chr63116297731165814-
ENSG00000272221chr63136206631363272-
ENSG00000206337chr63136847931445283+
ENSG00000272217chr63321385233214633-
ENSG00000225339chr63424745634254545+
ENSG00000272288chr63466409434665247+
ENSG00000272374chr63518814735192407-
ENSG00000246982chr63611447536164982-
ENSG00000224666chr63635460836359771+
ENSG00000235033chr63984958039867847-
ENSG00000204091chr64030269340347624+
ENSG00000234753chr64146259141516359-
ENSG00000261068chr64205997642061997-
ENSG00000231113chr64290810242916098+
ENSG00000272223chr64300163543002143-
ENSG00000272170chr64304206943042477-
ENSG00000271754chr64348691843487462-
ENSG00000271970chr64352960943530156+
ENSG00000203362chr64355596743559099-
ENSG00000237686chr64396346044042389-
ENSG00000262179chr64418467644185973+
ENSG00000271857chr64538881645389742-
ENSG00000231769chr64606483046097443-
ENSG00000270761chr64744497947445308-
ENSG00000225791chr65244210552448783+
ENSG00000271367chr65321495653215503+
ENSG00000249379chr65336798353371717+
ENSG00000235899chr65349317853496192+
ENSG00000227885chr65360554753611820-
ENSG00000271218chr65378377253785586-
ENSG00000236740chr65379482053862465+
ENSG00000224984chr65470491654705653-
ENSG00000261116chr65480796554809897+
ENSG00000226803chr65697969257039034-
ENSG00000272541chr65818216958182746-
ENSG00000272316chr65823483858240189-
ENSG00000215190chr65827235258287779-
ENSG00000266680chr66428091064282313-
ENSG00000236345chr66451672964532535+
ENSG00000230910chr66933985469344919-
ENSG00000237643chr67110459071109120+
ENSG00000271967chr67130614171306683+
ENSG00000233237chr67205404772130472-
ENSG00000229852chr67397293874011124+
ENSG00000231652chr67440362674405854-
ENSG00000225793chr67599473076006719+
ENSG00000270362chr67994343579946514+
ENSG00000272137chr68027084980271319+
ENSG00000272129chr68106514181066576+
ENSG00000233967chr68115306181175644+
ENSG00000260645chr68117667581178797+
ENSG00000226453chr68255490282643197-
ENSG00000234155chr68609693786099904-
ENSG00000223998chr68627003386270928-
ENSG00000203875chr68637071086388451-
ENSG00000272008chr68786087787865003-
ENSG00000226524chr68808131188102519+
ENSG00000224345chr68841022888411243+
ENSG00000228124chr69038318890385502+
ENSG00000118412chr69053961390584155+
ENSG00000261366chr69602305996025326-
ENSG00000228506chr69987279899879249+
ENSG00000228439chr69996856999979794+
ENSG00000272017chr6100015973100016972+
ENSG00000260000chr6101329347101330863+
ENSG00000203808chr6105584183105617820+
ENSG00000272102chr6105721095105721635-
ENSG00000231628chr6105726891105729630+


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.