The Cancer LncRNome Atlas



Bladder Urothelial Carcinoma (BLCA)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in BLCA

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000236841chr2163018280163029426+
ENSG00000233255chr2165697259165705844+
ENSG00000235192chr2166651361166666520+
ENSG00000229195chr2166651367166702601-
ENSG00000236107chr2166813909167158294+
ENSG00000227617chr2169628463169642939-
ENSG00000239467chr2171627623171634658+
ENSG00000228389chr2172629992172632354+
ENSG00000232555chr2173180015173188465+
ENSG00000232788chr2173328990173330750-
ENSG00000225205chr2173345568173421324-
ENSG00000270460chr2174675804174676120+
ENSG00000271151chr2174833079174834146+
ENSG00000231453chr2175190755175195371+
ENSG00000226853chr2175352117175353114+
ENSG00000236449chr2175411869175639555+
ENSG00000237380chr2176986339177001826-
ENSG00000224189chr2177037923177053686-
ENSG00000226363chr2177042445177043736+
ENSG00000163364chr2177494317177502659-
ENSG00000224577chr2177502438177520686+
ENSG00000213963chr2178148236178257419-
ENSG00000223960chr2179278666179304970+
ENSG00000237298chr2179385910179639402+
ENSG00000270956chr2179405852179406526+
ENSG00000270277chr2179413611179415408+
ENSG00000271011chr2179441830179442349+
ENSG00000270574chr2179443517179445633+
ENSG00000271141chr2179481308179481850+
ENSG00000225258chr2181436439181557181-
ENSG00000234663chr2181966659182264286+
ENSG00000260742chr2182752578182756390-
ENSG00000226747chr2186584601186605206-
ENSG00000231646chr2186648418186664878-
ENSG00000237877chr2186897618186947960-
ENSG00000259915chr2187219299187221500-
ENSG00000224063chr2187867947188419390+
ENSG00000253559chr2190627430190630282+
ENSG00000233654chr2191399581191432828+
ENSG00000228509chr2191541670191573442-
ENSG00000227542chr2192093891192110898-
ENSG00000229056chr2197124748197128928+
ENSG00000231621chr2198062715198063997+
ENSG00000232732chr2200732119200775882-
ENSG00000260006chr2201689396201692061+
ENSG00000183308chr2201827986201873825+
ENSG00000226312chr2202005007202022546-
ENSG00000234431chr2202031688202032269+
ENSG00000231903chr2203043383203044114-
ENSG00000227946chr2206949329206951288+
ENSG00000231955chr2206980271206987047+
ENSG00000237892chr2207985608207986768-
ENSG00000234902chr2208051441208100790-
ENSG00000229647chr2208104374208110611+
ENSG00000223725chr2208104588208394519-
ENSG00000224137chr2208527099208531748+
ENSG00000244567chr2208686014208687493-
ENSG00000231908chr2209119971209120905+
ENSG00000229127chr2210895457210929080+
ENSG00000270659chr2214017694214018383+
ENSG00000229267chr2215674953215827998+
ENSG00000235770chr2216476286216708445-
ENSG00000230838chr2216582766216584147+
ENSG00000226276chr2216804031216806442-
ENSG00000260804chr2217081768217084915+
ENSG00000232485chr2217343753217363484-
ENSG00000261338chr2219120042219122087+
ENSG00000225062chr2219231388219232558-
ENSG00000268603chr2220362333220362968-
ENSG00000268896chr2220411933220412380-
ENSG00000269068chr2220423805220424348+
ENSG00000227308chr2220550103220602659+
ENSG00000267034chr2223181961223183372-
ENSG00000261428chr2223431624223434438-
ENSG00000261379chr2227668752227669777+
ENSG00000236432chr2228085768228189917-
ENSG00000225963chr2231036815231038939+
ENSG00000224376chr2232253687232259702+
ENSG00000181798chr2232373137232379050-
ENSG00000237126chr2233445658233476681-
ENSG00000243637chr2234263220234301045+
ENSG00000224814chr2234602080234617345-
ENSG00000235726chr2235742959235822028-
ENSG00000235529chr2236414395236416210+
ENSG00000227252chr2237968077237994460-
ENSG00000260942chr2241522117241526116-
ENSG00000219159chr2241625751241629831+
ENSG00000223374chr2242290755242292519-
ENSG00000228989chr2242629829242633704+
ENSG00000235351chr2242664030242665108-
ENSG00000224272chr2242749407242753111-
ENSG00000235151chr2242786532242787188+
ENSG00000233806chr2242823514243020873+
ENSG00000237940chr2242912834242919427+
ENSG00000261186chr2243029505243030608-
ENSG00000225377chr20300957328868-
ENSG00000251390chr20825767838106+
ENSG00000234684chr2013060651358827+
ENSG00000229728chr2013422661343229+
ENSG00000258950chr2014337651454487-
ENSG00000226644chr2021878632193797+
ENSG00000229539chr2038688863869515-
ENSG00000205181chr2054767135485259-
ENSG00000261062chr201038165710384178-
ENSG00000270408chr201062584710627014-
ENSG00000224961chr201073373810734614+
ENSG00000236526chr201189005211899325-
ENSG00000232388chr201854806418550207+
ENSG00000233895chr201973835219790319+
ENSG00000088970chr202110662421227260+
ENSG00000230387chr202316876523170944+
ENSG00000232645chr202333723123338753-
ENSG00000270001chr202361246323612953-
ENSG00000213742chr202560468125658710+
ENSG00000226465chr202573185425733397+
ENSG00000125804chr202603529126073683+
ENSG00000227195chr202616755626232162-
ENSG00000205611chr202951358229521213-
ENSG00000225490chr202952163729522987-
ENSG00000235313chr203015096930151879+
ENSG00000230613chr203015551030161066-
ENSG00000236772chr203103755831041410+
ENSG00000260257chr203144484831446557+
ENSG00000228265chr203257085832582163-
ENSG00000250917chr203282264632868979-
ENSG00000269202chr203378955033791091-
ENSG00000126005chr203380463433865934-
ENSG00000261582chr203385568833867846-
ENSG00000235214chr203387305433873559+
ENSG00000230155chr203406402834078808-
ENSG00000268340chr203410668234107108+
ENSG00000260032chr203463354434638882-
ENSG00000232406chr203473833534743655-
ENSG00000232907chr203513656335201794-
ENSG00000259729chr203514101235154533-
ENSG00000259716chr203517753035232932-
ENSG00000235167chr203612087436137633-
ENSG00000224635chr203703465837045444-
ENSG00000196756chr203704923537063996-
ENSG00000174365chr203707522137079564+
ENSG00000261431chr203759056837590754-
ENSG00000226648chr203972696939766643-
ENSG00000223891chr204283960042854667+
ENSG00000132832chr204328509243324737-
ENSG00000244558chr204332353343374662-
ENSG00000227477chr204359243543595043-
ENSG00000234011chr204407604244076982+
ENSG00000271984chr204452133344522058-
ENSG00000204044chr204464214144650712-
ENSG00000240742chr204465041544656438+
ENSG00000271784chr204531829845318928+
ENSG00000231119chr204598130545983377+
ENSG00000235621chr204698869346999372+
ENSG00000177410chr204789471547905797+
ENSG00000237595chr204878000148782639-
ENSG00000231742chr204878908748793096+
ENSG00000224397chr204888402348896332+
ENSG00000203999chr204890925748931459+
ENSG00000233077chr204892724848937879-
ENSG00000259456chr204954752149561671+
ENSG00000248832chr204962019449624577-
ENSG00000271774chr205187251852103813-
ENSG00000231703chr205201419952029448-
ENSG00000259723chr205206959752120853-
ENSG00000197670chr205216930952191847+
ENSG00000226308chr205584185355858054+
ENSG00000218018chr205595921655968118-
ENSG00000231290chr205709043557194944+
ENSG00000254419chr205728585157286689+
ENSG00000268649chr205739218757392780-
ENSG00000235590chr205739397457425958-
ENSG00000225806chr205743858357463864-
ENSG00000270951chr205745164757452036-
ENSG00000228340chr205866289559102516+
ENSG00000226332chr206088048860881381-
ENSG00000232803chr206129437161298076-
ENSG00000229873chr206143197961436939-
ENSG00000231133chr206172715061733631-
ENSG00000225978chr206173348361735738+
ENSG00000241624chr206219879462199958-
ENSG00000232442chr206225858062260177+
ENSG00000196421chr206266569762671315+
ENSG00000149656chr206292173862944485+
ENSG00000224905chr211539974215516789+
ENSG00000226751chr211613403116135411+
ENSG00000235609chr211619352916254296-
ENSG00000235277chr211629085516319417+
ENSG00000229047chr211633363016336554+
ENSG00000215386chr211744284217999716+
ENSG00000244676chr211916580519183162+
ENSG00000224141chr211993358320132321-
ENSG00000234883chr212693422126947480+
ENSG00000260583chr212695508226955638-
ENSG00000232692chr212775087127844017+
ENSG00000232079chr212942073329509930+
ENSG00000232855chr212981687030047170-
ENSG00000231125chr213043039430432416-
ENSG00000215533chr213056580130660526+
ENSG00000248476chr213072395530734215+
ENSG00000174680chr213112049431136321+
ENSG00000237594chr213293153732932800+
ENSG00000227256chr213365017433653299+
ENSG00000238197chr213410042634115433+
ENSG00000223799chr213463617834638565-
ENSG00000240368chr213493184834950669-
ENSG00000237945chr213528783835349992+
ENSG00000214955chr213544589235732332+
ENSG00000227456chr213555297835562220+
ENSG00000225555chr213574310135747647-
ENSG00000234380chr213611805436157183+
ENSG00000231106chr213737763637379899+
ENSG00000236830chr213750406537528605-
ENSG00000228107chr213773292837734338+
ENSG00000230479chr213780265837853368+
ENSG00000233818chr213781802937904706+
ENSG00000231324chr213800497938009331-
ENSG00000224790chr213833881238344128+
ENSG00000270116chr213847311438473643+
ENSG00000230366chr213858080438594037+
ENSG00000242553chr213859372038610045+
ENSG00000234035chr214028509340287072-
ENSG00000235888chr214036063340378079-
ENSG00000237721chr214037857440383255-
ENSG00000255568chr214068588740686886-
ENSG00000231713chr214109968241102607+
ENSG00000226496chr214251342742520060-
ENSG00000228318chr214281332142814669-
ENSG00000236384chr214313168043135935-
ENSG00000236883chr214315953343161468+
ENSG00000237232chr214342930343445060+
ENSG00000239930chr214391611843918313+
ENSG00000235772chr214398048443982044-
ENSG00000225431chr214401939044035168-
ENSG00000235023chr214406838144071354-
ENSG00000233754chr214420118444202343-
ENSG00000233056chr214433691344345756-
ENSG00000236663chr214456063344561202-
ENSG00000237989chr214477802744782229-
ENSG00000188660chr214486648144873773+
ENSG00000185186chr214488197444899414-
ENSG00000215458chr214522563945232448-
ENSG00000225331chr214557862345579959-
ENSG00000237604chr214559537245596336+
ENSG00000232124chr214562117345622579+
ENSG00000232698chr214562640845627282-
ENSG00000241728chr214574882745750104-
ENSG00000184441chr214575111745755734+
ENSG00000230061chr214583447345845155-
ENSG00000229356chr214587086945875167-
ENSG00000228709chr214590546045910171+
ENSG00000235890chr214592669045935738+
ENSG00000236519chr214622249246224632+
ENSG00000227039chr214634096646349593+
ENSG00000234880chr214640977946414001-
ENSG00000261706chr214641427746415100-
ENSG00000224930chr214641912246424642-
ENSG00000215447chr214670796746711653+
ENSG00000223768chr214671320046717269+
ENSG00000233922chr214701356847017005+
ENSG00000215424chr214764913147679304+
ENSG00000228137chr214766680447667596+
ENSG00000239415chr214767146347674047-
ENSG00000206195chr221614797916193004-
ENSG00000271127chr221617961716181004-
ENSG00000225255chr221619966616231333-
ENSG00000100181chr221708277717179521+
ENSG00000237438chr221751746017539682+
ENSG00000185837chr221764027417646335+
ENSG00000093100chr221827041818294263-
ENSG00000225335chr221855929318560563-
ENSG00000161103chr221883763118848562+
ENSG00000237517chr221895802719018755+
ENSG00000223461chr221910904219112016+
ENSG00000260924chr221915890819160345+
ENSG00000185065chr221943541619437628+
ENSG00000236540chr222005050320058045-
ENSG00000235704chr222037766920378803+
ENSG00000206176chr222037881420380440+
ENSG00000226287chr222105522021058894+
ENSG00000234252chr222107733521080208+
ENSG00000237476chr222131138021318967+
ENSG00000230513chr222135617521364631+
ENSG00000206140chr222182071221825558+
ENSG00000224086chr222229260922297799+
ENSG00000272216chr222263831222641586-
ENSG00000234630chr222264809822649159+
ENSG00000211683chr222397407123981128-
ENSG00000270041chr222408086524081476-
ENSG00000203280chr222549840725508659-
ENSG00000261188chr222690850326910534+
ENSG00000260065chr222691794926921002-
ENSG00000225783chr222704239227072438+
ENSG00000244625chr222706873027176170+
ENSG00000235954chr222831536428404569+
ENSG00000226471chr222919667129244547+
ENSG00000237015chr222965687829658026+
ENSG00000241528chr223077093030773862-
ENSG00000235989chr223131829531328436+
ENSG00000253352chr223136666331375381+
ENSG00000248603chr223149786231500743+
ENSG00000228839chr223168848531734007+
ENSG00000240529chr223183296331835893-
ENSG00000240591chr223185023731860190+
ENSG00000230736chr223277265132780330+
ENSG00000240293chr223579613535806001+
ENSG00000235237chr223756279737578890+
ENSG00000233360chr223803783938054384-
ENSG00000251267chr223861698238618939-
ENSG00000228274chr223906359039077825-
ENSG00000244491chr223913073039134770+
ENSG00000230149chr223913073539134995+
ENSG00000225450chr223913500839145046+
ENSG00000233899chr223953270439537189-
ENSG00000261202chr224043907240440534-
ENSG00000231993chr224157059541593460-
ENSG00000235513chr224160512641613631-
ENSG00000184068chr224222721942230669-
ENSG00000260655chr224231802742319104-
ENSG00000270083chr224248563442486032-
ENSG00000237037chr224248693742533614+
ENSG00000182057chr224266575942671202+
ENSG00000233903chr224267236142673057+
ENSG00000229891chr224276040642765242-
ENSG00000172250chr224289658542908566+
ENSG00000270022chr224301125043011913+
ENSG00000261251chr224420833644213274+
ENSG00000226328chr224552971045559662-
ENSG00000238120chr224600031246001501-
ENSG00000235091chr224627187946283628-
ENSG00000231711chr224643614646440733-
ENSG00000241990chr224644958546453090+
ENSG00000235159chr224646323646465771-
ENSG00000234869chr224693739246944093+
ENSG00000260708chr224715779147158460-
ENSG00000224271chr224802742348251349+
ENSG00000212939chr224994232949950121+
ENSG00000205559chr225102145551022306+
ENSG00000224957chr3577914887698+
ENSG00000271870chr331946263195119+
ENSG00000231249chr345325754534847-
ENSG00000235947chr347908764793274-
ENSG00000235831chr349384935021646-
ENSG00000233912chr351985905229014-
ENSG00000229642chr360045296165807+
ENSG00000189229chr365321666777816+
ENSG00000227110chr379944928653610-
ENSG00000237697chr386134688615561+
ENSG00000254485chr393342729404987-
ENSG00000206573chr393913739440263-
ENSG00000269886chr398544469854781-
ENSG00000269894chr399773909977942+
ENSG00000230082chr399890889996471+
ENSG00000269982chr31000040110004223+
ENSG00000206567chr31004810210052893-
ENSG00000231177chr31032610310327430+
ENSG00000240288chr31032743810335133+
ENSG00000157152chr31204587612232900+
ENSG00000272263chr31287371812874227-
ENSG00000244502chr31351848213521553-
ENSG00000228242chr31418622314189784+
ENSG00000144596chr31453061914583588-
ENSG00000225733chr31496185414989931-
ENSG00000224660chr31529569115306000+
ENSG00000249786chr31547767815485576-
ENSG00000271964chr31635594616356494+
ENSG00000272498chr31638081516381378+
ENSG00000272529chr31638663316387947+
ENSG00000228956chr31848651618959184+
ENSG00000272511chr32145371421455436-
ENSG00000224822chr32449662724500925-
ENSG00000228791chr32453557824541833+
ENSG00000271943chr32767980627680267+
ENSG00000272282chr32775440127755496+
ENSG00000225548chr32784425327932792+
ENSG00000235493chr32803870128070095-
ENSG00000235904chr32930568529332217-
ENSG00000261468chr33073915330741068+
ENSG00000261572chr33227818032280070-
ENSG00000271324chr33383513633835637-
ENSG00000271643chr33383718033838442-
ENSG00000271020chr33383864133839173-
ENSG00000272334chr33701460837015163-
ENSG00000271835chr33702653437026975-
ENSG00000272258chr33722057937220861+
ENSG00000271993chr33722359837224225+
ENSG00000270194chr33728328037285668-
ENSG00000235257chr33778692337903271-
ENSG00000229589chr33849251838496311-
ENSG00000270674chr33853221538534633+
ENSG00000223797chr34035529340494820-
ENSG00000272452chr34050795740510078+
ENSG00000230084chr34264345542695880-
ENSG00000173811chr34277406742788260+
ENSG00000225611chr34281210442815127+
ENSG00000271941chr34338841543389135-
ENSG00000234617chr34339113643393454-
ENSG00000272121chr34403957344040641-
ENSG00000261786chr34415879144163857+
ENSG00000271937chr34437943344380044-
ENSG00000225873chr34446261944465499-
ENSG00000236869chr34459884944727145-
ENSG00000233509chr34465862044666289-
ENSG00000272077chr34470890444710856+
ENSG00000230530chr34572053545730626-
ENSG00000223552chr34640644646448550-
ENSG00000227398chr34720598747288091+
ENSG00000260236chr34742057947422489-
ENSG00000244380chr34848176248488060-
ENSG00000271973chr34870988848710166+
ENSG00000224424chr34888500548889414+
ENSG00000235236chr34901735149021418-
ENSG00000223343chr34902248249027421-
ENSG00000272434chr34906674949067139+
ENSG00000235908chr34940257849404439-
ENSG00000235261chr34946037949461864+
ENSG00000259970chr34972191349722416-
ENSG00000235016chr35015345550193518-
ENSG00000188338chr35024267950258411+
ENSG00000230454chr35029773550300790+
ENSG00000232352chr35030407350304803-
ENSG00000012171chr35030499050314977+
ENSG00000271858chr35040276550405628+
ENSG00000243224chr35227327452275113+
ENSG00000271976chr35389302153895603-
ENSG00000265992chr35466614954673884-
ENSG00000244586chr35552172755522336+
ENSG00000272202chr35711297157114129+
ENSG00000272146chr35758344257586654+
ENSG00000244161chr35814827458156363-
ENSG00000272182chr35841398258414542+
ENSG00000272360chr35847655758477018-
ENSG00000244383chr35859280758620167+
ENSG00000241472chr36224654062355005-
ENSG00000239653chr36398969863997824+
ENSG00000271843chr36399375863994368-
ENSG00000272181chr36400518464005601+
ENSG00000241158chr36454701464573878+
ENSG00000241684chr36467058564997143+
ENSG00000270059chr36534494365345392-
ENSG00000241316chr36770512167998137+
ENSG00000244513chr36906309269105773+
ENSG00000270562chr37163409471636560+
ENSG00000241163chr37208445172291716-
ENSG00000242741chr37385775273952017+
ENSG00000242516chr37572154275728454+
ENSG00000261292chr39747836797480374+
ENSG00000239445chr39843317498451495-
ENSG00000261533chr39989841199900574+
ENSG00000241280chr3101679202101716770+
ENSG00000242759chr3106555658106959488-
ENSG00000243701chr3106959539107045811+
ENSG00000271856chr3107844668107857457+
ENSG00000242242chr3110612555110790400-
ENSG00000261488chr3111852270111854206+
ENSG00000240057chr3112738379112902148+
ENSG00000259976chr3114033348114035026-
ENSG00000240922chr3116078871116088937+
ENSG00000241155chr3119033140119041607-
ENSG00000242622chr3119813742119855630+
ENSG00000239523chr3123304389123363415+
ENSG00000260391chr3124442635124445172+
ENSG00000241288chr3125546081125607696-
ENSG00000248787chr3125626848125629115-
ENSG00000250012chr3125803063125814192+
ENSG00000246022chr3125898908125929012+
ENSG00000250934chr3125985639126010122+
ENSG00000244300chr3128208055128221191+
ENSG00000261159chr3128578559128579369-
ENSG00000231305chr3128580156128590383-
ENSG00000206417chr3129034235129045068+
ENSG00000271270chr3129612714129637418+
ENSG00000248243chr3129808276129813147-
ENSG00000249846chr3129831393129839422+
ENSG00000250608chr3131043936131100319-
ENSG00000261167chr3131173970131177442-
ENSG00000248468chr3131236675131239724+
ENSG00000260633chr3134066130134068075-
ENSG00000240086chr3135074909135158730-
ENSG00000239213chr3136560568136580896-
ENSG00000248932chr3139108657139302161+
ENSG00000244124chr3141637094141637863-
ENSG00000269905chr3141663270141666233-
ENSG00000268129chr3142719749142720309-
ENSG00000241679chr3142842204142850735+
ENSG00000261051chr3145777372145779466-
ENSG00000240032chr3145784131145786972-
ENSG00000244468chr3149002569149051440+
ENSG00000240541chr3149095565149104370+
ENSG00000241313chr3149374807149379151+
ENSG00000243321chr3149795281149797904-
ENSG00000244541chr3149956306149957996+
ENSG00000261050chr3150181245150184218+
ENSG00000240137chr3150421351150437933+
ENSG00000241732chr3152557179152559228+
ENSG00000243069chr3153742190153839121-
ENSG00000243926chr3156389651156392167-
ENSG00000240875chr3156465135156534851-
ENSG00000243629chr3156799456156840793-
ENSG00000241135chr3156807670156818924+
ENSG00000243176chr3156893012157099054+


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.