The Cancer LncRNome Atlas



Bladder Urothelial Carcinoma (BLCA)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in BLCA

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000267374chr183678688837380282-
ENSG00000267313chr183904739539212149-
ENSG00000267414chr184225689242259682-
ENSG00000267193chr184324933243327180-
ENSG00000267167chr184438318744383857-
ENSG00000267724chr184463231744634433+
ENSG00000264269chr184655007346574844+
ENSG00000267322chr184734039347377429+
ENSG00000267013chr185277313552791537-
ENSG00000267284chr185338829453455992+
ENSG00000267325chr185344395853448952-
ENSG00000267327chr185356026953690753+
ENSG00000206129chr185367084453858493-
ENSG00000267040chr185529753455405276+
ENSG00000267787chr185530668755405276+
ENSG00000267504chr185603879856039898+
ENSG00000267226chr185633771256339109-
ENSG00000267010chr185641938056421709+
ENSG00000267279chr185925297959274149-
ENSG00000267560chr185996726959968231-
ENSG00000267701chr186098103560981315-
ENSG00000267390chr186103456161048862+
ENSG00000269989chr186115283461153251+
ENSG00000263424chr186517382665181267+
ENSG00000265579chr187041099170413196-
ENSG00000261780chr187099217671017113+
ENSG00000264247chr187225901072265744-
ENSG00000265778chr187420360874205487+
ENSG00000267655chr187687720776877920+
ENSG00000267015chr187710025877103972-
ENSG00000261126chr187779738777853362+
ENSG00000267251chr187794156377960875+
ENSG00000266933chr19490046507813-
ENSG00000267751chr19567212572215-
ENSG00000261204chr19637105637537-
ENSG00000267530chr19782755785080+
ENSG00000267020chr1910387261039063-
ENSG00000267493chr1912681651270240-
ENSG00000267372chr1913212241322863+
ENSG00000248015chr1913921691396466-
ENSG00000267317chr1914576641462764-
ENSG00000267092chr1915083811508962+
ENSG00000267161chr1915735951575474-
ENSG00000266926chr1915817891582322-
ENSG00000267007chr1918152481815872+
ENSG00000267244chr1918220881824544+
ENSG00000267125chr1918523981853621+
ENSG00000261526chr1918748811876168-
ENSG00000267283chr1919894001990369+
ENSG00000005206chr1923286172355099+
ENSG00000261342chr1927277412729325-
ENSG00000253392chr1929151442926805-
ENSG00000267688chr1931211143122126-
ENSG00000267436chr1935441973557567+
ENSG00000226800chr1936072453613928+
ENSG00000268670chr1940616134062747-
ENSG00000269425chr1943395744343488+
ENSG00000269318chr1943566344358445-
ENSG00000267980chr1943637864364637+
ENSG00000267255chr1944296864430931-
ENSG00000267769chr1944540114455283+
ENSG00000267011chr1944579594471490-
ENSG00000268565chr1946549764655536-
ENSG00000205790chr1946792944685960+
ENSG00000268536chr1947851324791219-
ENSG00000269604chr1947917574795571-
ENSG00000267484chr1948383444838919+
ENSG00000034063chr1949030924962165+
ENSG00000223573chr1955581785568045-
ENSG00000267709chr1958474785858250+
ENSG00000267571chr1959115895913910-
ENSG00000267427chr1962103906212492-
ENSG00000269680chr1967483046751478-
ENSG00000269163chr1970870637087979+
ENSG00000268204chr1976986527701876-
ENSG00000260500chr1979835377984042-
ENSG00000267939chr1980736138080909+
ENSG00000269386chr1984392578455569-
ENSG00000267510chr1994021919405158+
ENSG00000266912chr1994554609456574+
ENSG00000267612chr1998415299842619+
ENSG00000267289chr1999447559945689-
ENSG00000267387chr191019970810201053-
ENSG00000175898chr191033211110333870-
ENSG00000267607chr191039647710399695-
ENSG00000267197chr191060101510601676-
ENSG00000267100chr191076253810764520-
ENSG00000266936chr191112159311126687-
ENSG00000267082chr191131430411326844+
ENSG00000267576chr191143283211434871+
ENSG00000267277chr191147879911485611-
ENSG00000197332chr191175059111797382+
ENSG00000267274chr191205077412064196+
ENSG00000219665chr191209843212157090+
ENSG00000234773chr191230583012348582+
ENSG00000261280chr191245676312458752-
ENSG00000269560chr191264058212643787-
ENSG00000268945chr191279350712798093-
ENSG00000267512chr191325043113251961-
ENSG00000267519chr191394533013947173-
ENSG00000267169chr191424799114282079+
ENSG00000267147chr191444455514454725+
ENSG00000270143chr191534633015346819-
ENSG00000268189chr191548988715492004+
ENSG00000269589chr191550950715511167+
ENSG00000186526chr191572602915741448+
ENSG00000267308chr191593785515946663-
ENSG00000214049chr191593975715947130+
ENSG00000267453chr191596280315975734-
ENSG00000267164chr191601536616018044+
ENSG00000269243chr191623447116250702-
ENSG00000269399chr191665343416655625-
ENSG00000268087chr191672122216747342+
ENSG00000269427chr191674155416754753+
ENSG00000269044chr191674461416746080-
ENSG00000267904chr191675077816751479-
ENSG00000269815chr191740700517407504-
ENSG00000269720chr191750223817503093-
ENSG00000269640chr191751650317529713+
ENSG00000269481chr191752506617533133-
ENSG00000269439chr191759979917622698-
ENSG00000269145chr191825533218262498-
ENSG00000268650chr191831554018331346+
ENSG00000267959chr191839265918393560+
ENSG00000268199chr191855192018555242+
ENSG00000269191chr191864371818646998+
ENSG00000268030chr191866858518672370-
ENSG00000269019chr191905113119057640+
ENSG00000269131chr191910170219104419+
ENSG00000266904chr191986817519887232-
ENSG00000267581chr191987184719932525-
ENSG00000267419chr191988741119945736+
ENSG00000267481chr191989956419901340-
ENSG00000267565chr192000324220006656-
ENSG00000267383chr192023618620432114-
ENSG00000269110chr192073659820844389-
ENSG00000268416chr192092972920938056-
ENSG00000268119chr192162704321646710-
ENSG00000268658chr192166617621686040+
ENSG00000268081chr192173744221752039-
ENSG00000268555chr192175362421770124-
ENSG00000267886chr192325800323283163+
ENSG00000213971chr192344270823457053-
ENSG00000267934chr192350677023511903+
ENSG00000269416chr192358203523598877-
ENSG00000269289chr192410188324140732-
ENSG00000269397chr192411059024112089+
ENSG00000268362chr192421624724249711+
ENSG00000267696chr192812939128137391-
ENSG00000261824chr192817548828284848-
ENSG00000261770chr192824809228251757-
ENSG00000267575chr192828437128475892+
ENSG00000267498chr192970414229706722+
ENSG00000267213chr193288095632896445-
ENSG00000267475chr193317799533182656-
ENSG00000266930chr193336683133369327-
ENSG00000267580chr193379084033792074+
ENSG00000267296chr193379376333795960+
ENSG00000267130chr193379594233800293+
ENSG00000267219chr193483926134850317-
ENSG00000268751chr193506763835068606-
ENSG00000267767chr193528272435323773-
ENSG00000261754chr193530249335305249-
ENSG00000271109chr193534018235351480-
ENSG00000271032chr193550586535516239-
ENSG00000221857chr193562972835642239+
ENSG00000271366chr193574234335744542-
ENSG00000268947chr193575374935755707+
ENSG00000236144chr193603164036036931-
ENSG00000226510chr193615885036164193-
ENSG00000105663chr193620892136229779+
ENSG00000267439chr193623795836244316-
ENSG00000267328chr193624546736246391+
ENSG00000267049chr193626004636261930-
ENSG00000267388chr193645141436454965+
ENSG00000248101chr193649954036505137-
ENSG00000267698chr193650541036536874+
ENSG00000270760chr193663498336639250-
ENSG00000267053chr193679548236803570+
ENSG00000232677chr193680396936822620-
ENSG00000267309chr193698055136981942+
ENSG00000233527chr193706397237085610+
ENSG00000225975chr193717634237178351-
ENSG00000267254chr193728842037319017+
ENSG00000226686chr193774281437756437+
ENSG00000267605chr193775684137762420-
ENSG00000267381chr193797890137979554+
ENSG00000266916chr193798806337997948-
ENSG00000267470chr193803981638078249+
ENSG00000267152chr193821948738221544-
ENSG00000267640chr193830799938317278+
ENSG00000225868chr193831436238345855-
ENSG00000229481chr193832019138322797+
ENSG00000268913chr193882227438822716+
ENSG00000267473chr193888882138890521+
ENSG00000267892chr193922892439230503+
ENSG00000268756chr193931080639313863+
ENSG00000269688chr193933536939336139-
ENSG00000269486chr193942597639429272-
ENSG00000267992chr193952107639521963+
ENSG00000268262chr193980529139811498-
ENSG00000269246chr193983241339832585-
ENSG00000269410chr193991657539919055+
ENSG00000268166chr194052629240526948+
ENSG00000205041chr194077939640781386-
ENSG00000268366chr194094934340949994+
ENSG00000269843chr194133712641343115-
ENSG00000267107chr194196007442006559-
ENSG00000270164chr194204154542043266+
ENSG00000268027chr194205155442061832+
ENSG00000254887chr194263670742641251+
ENSG00000259436chr194265672142661675+
ENSG00000213904chr194290128043156507+
ENSG00000268601chr194429846144299810-
ENSG00000267058chr194439595644405957-
ENSG00000267191chr194440615344430697+
ENSG00000266921chr194450104844506988-
ENSG00000267163chr194459850344603864-
ENSG00000186019chr194460961644617298-
ENSG00000267242chr194497864544979403-
ENSG00000266903chr194513550045222031-
ENSG00000267282chr194538528445394133-
ENSG00000267348chr194557976845593649-
ENSG00000267176chr194558858745593632-
ENSG00000267045chr194574189045748628-
ENSG00000259605chr194626804346273064+
ENSG00000267395chr194627105446275762+
ENSG00000269148chr194633342246334366+
ENSG00000268401chr194653091246533419+
ENSG00000268621chr194669242346706340-
ENSG00000268460chr194670668346718094+
ENSG00000245598chr194716362147180704+
ENSG00000268061chr194798753948004854+
ENSG00000269656chr194826029348272097-
ENSG00000268001chr194875893248761456+
ENSG00000269423chr194896962348970237+
ENSG00000269751chr194898310448985571+
ENSG00000269814chr194901646449016917-
ENSG00000268093chr194912252949127389-
ENSG00000267898chr194946723249468415+
ENSG00000268655chr194952150449522741-
ENSG00000268108chr194956387049564389+
ENSG00000268287chr194956751649568113+
ENSG00000197813chr194983487449843865-
ENSG00000268686chr194987196249891338-
ENSG00000269194chr195031219050312995+
ENSG00000268006chr195034189650354933-
ENSG00000268047chr195035614450358224-
ENSG00000269352chr195036022750362546-
ENSG00000267896chr195036313950363771-
ENSG00000204666chr195055384650570050+
ENSG00000267890chr195057838050579159+
ENSG00000267815chr195081327950813796-
ENSG00000269392chr195086913750872588-
ENSG00000268518chr195099006750990895-
ENSG00000180279chr195132093751322134+
ENSG00000267984chr195184842351856547+
ENSG00000254760chr195191755251918219+
ENSG00000269483chr195234317752346577-
ENSG00000269235chr195245238752484620+
ENSG00000260160chr195256174352566956-
ENSG00000267827chr195263380152674786-
ENSG00000268015chr195272547852734547-
ENSG00000269834chr195289209552901019-
ENSG00000268970chr195310095253102140-
ENSG00000269825chr195315369053156537-
ENSG00000213793chr195341844953426723-
ENSG00000269646chr195342663553427328+
ENSG00000267943chr195351076553516433+
ENSG00000268613chr195363819053638575-
ENSG00000268842chr195366568153666816+
ENSG00000269051chr195370036453714268+
ENSG00000269758chr195377112353774185-
ENSG00000160336chr195393522753961515+
ENSG00000269842chr195426521554267453+
ENSG00000268816chr195469773154698394+
ENSG00000268164chr195475328954753907-
ENSG00000267649chr195572802855732984+
ENSG00000269275chr195588894755889493-
ENSG00000267093chr195591111355911787-
ENSG00000267730chr195608813656088780-
ENSG00000267523chr195617326756186081-
ENSG00000267096chr195618199856183435+
ENSG00000267117chr195620548456205924-
ENSG00000267183chr195620725156209196+
ENSG00000267018chr195620768156208795+
ENSG00000267865chr195622017656220486+
ENSG00000269574chr195622052956220899+
ENSG00000267549chr195682607256852656+
ENSG00000267776chr195688807356888653-
ENSG00000267454chr195690502556910541+
ENSG00000166770chr195698861957012035+
ENSG00000267421chr195704752557049944-
ENSG00000269696chr195705693557078780-
ENSG00000268568chr195718394257185269-
ENSG00000268713chr195777272257774106+
ENSG00000267871chr195777858857791702-
ENSG00000268205chr195781567357819930+
ENSG00000268678chr195786221657863380-
ENSG00000269867chr195837840658379540-
ENSG00000268516chr195876863958790174-
ENSG00000268201chr195877800158779051+
ENSG00000142396chr195881671558827023+
ENSG00000268230chr195885822058874117-
ENSG00000268895chr195885911758866549+
ENSG00000268049chr195886936558870969+
ENSG00000269054chr195887395158877958+
ENSG00000268307chr195891158858912046+
ENSG00000232098chr195891560558919851-
ENSG00000268543chr195892992758930677+
ENSG00000268912chr195893999958942515-
ENSG00000269473chr195895181558957216+
ENSG00000267858chr195907049659086164+
ENSG00000269600chr195910526359110722-
ENSG00000224885chr233021123305236-
ENSG00000225234chr234850133486180-
ENSG00000271868chr235007273501199+
ENSG00000235078chr235230463526968+
ENSG00000242282chr235794033584463-
ENSG00000234171chr236060823609324+
ENSG00000231532chr246758124703805-
ENSG00000205837chr268683096910442-
ENSG00000225964chr269686456980595-
ENSG00000271947chr270458557046432-
ENSG00000228203chr270524087058813-
ENSG00000272002chr274010027401635+
ENSG00000235576chr278659327870836+
ENSG00000236008chr286999638723922-
ENSG00000235092chr288067668821993-
ENSG00000260837chr288612648862816-
ENSG00000242136chr292435699245243+
ENSG00000261104chr292467229249994+
ENSG00000271855chr296960289696904+
ENSG00000243491chr298976259910470-
ENSG00000269973chr21007648910079719+
ENSG00000188525chr21014328610146158-
ENSG00000260476chr21016170510162952+
ENSG00000260077chr21017921910180790-
ENSG00000271787chr21019454810194993-
ENSG00000272524chr21026086110261192+
ENSG00000257135chr21058882010591453+
ENSG00000243819chr21083047010832225+
ENSG00000272275chr21090800110910184-
ENSG00000224184chr21198874812718474+
ENSG00000233718chr21606115916082371-
ENSG00000260331chr21872865218729470-
ENSG00000236204chr21916772919546509-
ENSG00000228784chr22006862120084808+
ENSG00000271991chr22010178620102330+
ENSG00000227210chr22018997820203971+
ENSG00000269976chr22078600820786446-
ENSG00000231948chr22079053520792308-
ENSG00000260396chr22087756920879005+
ENSG00000270100chr22087801420878692-
ENSG00000271936chr22504847925049586+
ENSG00000224165chr22519425925262563+
ENSG00000261452chr22538006325382006+
ENSG00000272048chr22545072425451090-
ENSG00000231636chr22727255127273132-
ENSG00000272056chr22727648627277144-
ENSG00000272148chr22728529627285775-
ENSG00000234945chr22755840927565466+
ENSG00000234072chr22757911327590489+
ENSG00000223522chr22853055828533326-
ENSG00000229951chr22860727628617539-
ENSG00000270640chr22861968228619977+
ENSG00000270210chr22864881228649586+
ENSG00000226833chr22893181928959071-
ENSG00000235997chr23056952530575297+
ENSG00000049319chr23174755031806136-
ENSG00000271228chr23223813032238437+
ENSG00000237133chr23378011433788614-
ENSG00000260025chr23658189236582257-
ENSG00000272054chr23743601837439820+
ENSG00000232973chr23830279138408997+
ENSG00000231367chr23863386138742882-
ENSG00000229692chr23921942039220998-
ENSG00000231312chr23966377839892483+
ENSG00000227028chr24001359340482349+
ENSG00000234362chr24215873942160863-
ENSG00000224875chr24237037842397441-
ENSG00000231826chr24325499243266686-
ENSG00000234936chr24345671243460533+
ENSG00000259439chr24514733245166338-
ENSG00000236502chr24516729345169012-
ENSG00000228925chr24712641447135817+
ENSG00000233845chr24726241847267663-
ENSG00000225187chr24729496147298343+
ENSG00000234690chr24741954447572213-
ENSG00000236824chr24755819947571656+
ENSG00000233230chr24813281748134949+
ENSG00000272156chr25430969154312203+
ENSG00000238018chr25488814854889929-
ENSG00000203327chr25544152355443262-
ENSG00000240401chr25553562855573185+
ENSG00000271894chr25637476556613306+
ENSG00000233251chr25640066956412905-
ENSG00000233723chr25865493459290901+
ENSG00000267520chr26115304461155287+
ENSG00000212978chr26136873261372104-
ENSG00000270820chr26169832361711265+
ENSG00000236498chr26209556762113217+
ENSG00000231609chr26327105763275775-
ENSG00000225889chr26437037364479993+
ENSG00000223935chr26462235464680932-
ENSG00000260101chr26474932164751227-
ENSG00000232613chr26525786165280151-
ENSG00000235725chr26581670065867311-
ENSG00000232164chr26661043866619582+
ENSG00000271954chr26968512969687230-
ENSG00000188971chr26968641469693664-
ENSG00000179818chr27018939570315978-
ENSG00000226505chr27032102670330352-
ENSG00000231327chr27035116870352449-
ENSG00000270348chr27088391670885457-
ENSG00000239322chr27116894771175740-
ENSG00000230002chr27368389173686611+
ENSG00000237883chr27417476974208568-
ENSG00000235499chr27421225974213470+
ENSG00000255989chr27421365374220867+
ENSG00000225439chr27437513674377188+
ENSG00000237737chr27461261374621009+
ENSG00000258821chr27472581574726494-
ENSG00000272183chr27472884474729492+
ENSG00000257702chr27472972274731805+
ENSG00000204792chr27514527575165545+
ENSG00000236209chr27514668275151973-
ENSG00000230836chr27516738575169797+
ENSG00000270571chr27538149275417075+
ENSG00000270696chr27588758875889334+
ENSG00000271452chr27589711575897580+
ENSG00000270996chr27594624675947144+
ENSG00000232504chr28611640386118103+
ENSG00000228363chr28678919386845889+
ENSG00000222041chr28775488787906324+
ENSG00000234028chr28892705788931339+
ENSG00000240040chr28910998489161075-
ENSG00000231486chr28913070089165653-
ENSG00000261600chr29176839391768920+
ENSG00000233757chr29587328395881351+
ENSG00000232931chr29647286696481963-
ENSG00000204685chr29687415496908359+
ENSG00000230747chr29697300196987469-
ENSG00000230606chr29808108398095220-
ENSG00000241481chr29808667898100408+
ENSG00000228486chr29828068098319527+
ENSG00000226791chr29937840199388543-
ENSG00000232034chr2101439123101463682+
ENSG00000223947chr2101610138101618706-
ENSG00000231851chr2105713510105719402-
ENSG00000226508chr2105760571105761882+
ENSG00000235319chr2105940667105946986+
ENSG00000238273chr2105979495105995296+
ENSG00000235522chr2106462990106473633-
ENSG00000214184chr2109123971109150652-
ENSG00000259863chr2109743783109745386-
ENSG00000186148chr2110690738110742667+
ENSG00000204588chr2110744640110753717+
ENSG00000175701chr2110969106111002997-
ENSG00000261760chr2110988683111043433+
ENSG00000175772chr2111132715111142019-
ENSG00000184115chr2111143988111192743-
ENSG00000231536chr2111368493111369981+
ENSG00000204581chr2111855922111873165-
ENSG00000230499chr2111953540111964071+
ENSG00000172965chr2111965353112252677-
ENSG00000240350chr2112248850112268567+
ENSG00000224959chr2112249520112252388-
ENSG00000248341chr2113089719113091836+
ENSG00000228251chr2113348373113349516+
ENSG00000237753chr2113399409113403267-
ENSG00000189223chr2113969099114024587+
ENSG00000231943chr2114285145114300249-
ENSG00000227359chr2114435279114461655-
ENSG00000228857chr2114588626114600933-
ENSG00000270019chr2114645780114647327-
ENSG00000236255chr2118591513118599234+
ENSG00000226856chr2118889704118943962-
ENSG00000229867chr2120001998120006647-
ENSG00000237614chr2121300485121301902-
ENSG00000265451chr2122287998122290281+
ENSG00000236859chr2122407226122485784+
ENSG00000236682chr2128146706128158156+
ENSG00000270081chr2128601127128603261-
ENSG00000233221chr2131588551131594567-
ENSG00000224043chr2135493034135676280-
ENSG00000231890chr2136742746136779888+
ENSG00000228043chr2139175854139259268-
ENSG00000238057chr2145275664145279058+
ENSG00000226674chr2145425534145940216+
ENSG00000231969chr2150443710150704747+
ENSG00000226383chr2156868129156881125-
ENSG00000234584chr2158582220158592517-
ENSG00000270557chr2158734195158735077+
ENSG00000271320chr2158774224158774883+
ENSG00000204380chr2159514849159591514-
ENSG00000224152chr2160471807160473593+
ENSG00000226266chr2160527219160568946-
ENSG00000235724chr2162079296162111179-
ENSG00000227403chr2162101250162105561+


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.