The Cancer LncRNome Atlas



Bladder Urothelial Carcinoma (BLCA)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in BLCA

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000260899chr163075198830762702+
ENSG00000262026chr163078977030791473+
ENSG00000260083chr163088654330906541+
ENSG00000260852chr163093064030934590-
ENSG00000261487chr163095970730967832+
ENSG00000260911chr163105447131061201+
ENSG00000262766chr163112939931130068+
ENSG00000261385chr163114275431143198+
ENSG00000260304chr163119383231194606-
ENSG00000260060chr163120745231208284+
ENSG00000261925chr163123728131238481+
ENSG00000260757chr163141388631416020+
ENSG00000261474chr163146085631464814-
ENSG00000260267chr163146803231471057-
ENSG00000260740chr163149869131499813-
ENSG00000260625chr163151979231520569+
ENSG00000261731chr163172043431723305-
ENSG00000260141chr163305493033106752-
ENSG00000261512chr164665677346658363-
ENSG00000261131chr164669460846695503-
ENSG00000261788chr164673728146737937-
ENSG00000261173chr164700790047012894+
ENSG00000260086chr164865734748778553+
ENSG00000260052chr164867105448672630+
ENSG00000261092chr165042482750429044-
ENSG00000261685chr165067972050683160+
ENSG00000260249chr165070012250705550+
ENSG00000270120chr165074675550747500+
ENSG00000261644chr165076962450774627-
ENSG00000261550chr165306960253086785-
ENSG00000261804chr165340740553418657+
ENSG00000262714chr165342085653422997+
ENSG00000262557chr165352495253527880-
ENSG00000260936chr165407330554074638+
ENSG00000245694chr165495277554963101-
ENSG00000261997chr165557211255575939+
ENSG00000261270chr165697419056975254+
ENSG00000261114chr165697494056975638+
ENSG00000260115chr166195222561974601+
ENSG00000262394chr166309069063163558-
ENSG00000261502chr166309112263093812-
ENSG00000269986chr166310043063100894-
ENSG00000260658chr166334816863651950-
ENSG00000261742chr166531840265610203-
ENSG00000246898chr166644242766446038+
ENSG00000261656chr166650369966515133-
ENSG00000260465chr166675480066765688+
ENSG00000246777chr166678565566788643+
ENSG00000261705chr166692191866922834+
ENSG00000261088chr166692307266924996+
ENSG00000262691chr166729501167297687+
ENSG00000270049chr166751521767521153+
ENSG00000261386chr166758311767597861-
ENSG00000259804chr166759531467596212-
ENSG00000237718chr166764828467649245-
ENSG00000266937chr166790386367906470+
ENSG00000263126chr166791636467920270+
ENSG00000263276chr166825861668261637+
ENSG00000262160chr166825987268263048-
ENSG00000261469chr166827074868271570-
ENSG00000262820chr166859596468601032+
ENSG00000260084chr166860768568623415-
ENSG00000260577chr166867928368680071-
ENSG00000266801chr166896772368971628+
ENSG00000260772chr166973696869738555+
ENSG00000262136chr166976091669776466+
ENSG00000196696chr167001020070099851-
ENSG00000247228chr167019024370207351-
ENSG00000261777chr167034954370380650-
ENSG00000260023chr167061020470611571+
ENSG00000214353chr167078900170807154+
ENSG00000262086chr167148150071486552-
ENSG00000260886chr167159969271612090+
ENSG00000260593chr167165761171660719-
ENSG00000261337chr167195281571959638-
ENSG00000263320chr167196391471965102+
ENSG00000261008chr167245938472698908-
ENSG00000259768chr167269906972821143+
ENSG00000259901chr167282314272825522+
ENSG00000272250chr167309414473094658+
ENSG00000271009chr167309436973096215+
ENSG00000259972chr167433910074369244-
ENSG00000260884chr167434723574349532+
ENSG00000261079chr167440136074403724+
ENSG00000260539chr167448132574483790-
ENSG00000261783chr167541371675415158-
ENSG00000203472chr167550979475529305+
ENSG00000261707chr167777536577776897-
ENSG00000261390chr167975062279804460-
ENSG00000259867chr168018895080597032-
ENSG00000261128chr168063180380636416-
ENSG00000260896chr168086263280926492-
ENSG00000260213chr168105039781069364-
ENSG00000261061chr168106437581065090+
ENSG00000260643chr168108727081121256-
ENSG00000260495chr168134433681347028-
ENSG00000261609chr168141687481424489+
ENSG00000261235chr168207794182173236-
ENSG00000260228chr168382357283841439-
ENSG00000260300chr168394173883985058+
ENSG00000260018chr168415065684151176+
ENSG00000250685chr168422616484230659-
ENSG00000261286chr168449286584500967-
ENSG00000261243chr168452920584531101+
ENSG00000270184chr168581798885821223+
ENSG00000268505chr168622639986232519-
ENSG00000269186chr168622978786233326+
ENSG00000270058chr168625502986256335-
ENSG00000268388chr168650813586542705-
ENSG00000270006chr168735111587351643+
ENSG00000270082chr168736059387361190+
ENSG00000261327chr168821090488219696-
ENSG00000260630chr168872970688753594+
ENSG00000260121chr168878502388786867+
ENSG00000224888chr168879758888807826+
ENSG00000259881chr168894744688953544+
ENSG00000259877chr168928163889284061-
ENSG00000260279chr168936391689364724+
ENSG00000261253chr168938754189391518+
ENSG00000261118chr168955842589570868-
ENSG00000261373chr168977826489784573+
ENSG00000259006chr168998623589989070-
ENSG00000261317chr169003619990038952+
ENSG00000260528chr169016867990244752+
ENSG00000260923chr169025240590289086+
ENSG00000262061chr17180996183279+
ENSG00000262294chr17202429207372+
ENSG00000262905chr17455806456657+
ENSG00000262228chr17666805668559-
ENSG00000262133chr17781142783333+
ENSG00000262777chr1713277671329778+
ENSG00000236618chr1714202251421390+
ENSG00000186594chr1716148051620468-
ENSG00000263050chr1719467691948262-
ENSG00000263345chr1722783552282600-
ENSG00000261903chr1722925602295372-
ENSG00000205821chr1723088562319379-
ENSG00000262050chr1726156032616127+
ENSG00000262884chr1728655422869189-
ENSG00000262903chr1735589153561386-
ENSG00000262194chr1737054593706676-
ENSG00000262758chr1737100423712148-
ENSG00000263165chr1740672044068007+
ENSG00000262823chr1743852614389648-
ENSG00000244184chr1746075254608824+
ENSG00000262165chr1747044544710308-
ENSG00000262429chr1748712904872117+
ENSG00000234203chr1748761464877976+
ENSG00000262678chr1748897614890619+
ENSG00000262227chr1748910014891741+
ENSG00000227495chr1749225094923388-
ENSG00000234327chr1750147635017674+
ENSG00000261879chr1750953795151364+
ENSG00000263164chr1751438035144838-
ENSG00000263272chr1753284595336196-
ENSG00000261996chr1765567836558328-
ENSG00000262089chr1768979616898508-
ENSG00000267532chr1769191376922978-
ENSG00000263171chr1772560067258263-
ENSG00000262880chr1773234227347400+
ENSG00000265500chr1774666047482033+
ENSG00000264772chr1774761447485342+
ENSG00000233223chr1774852827487390-
ENSG00000262251chr1775885787589689-
ENSG00000179859chr1778166427819271-
ENSG00000178977chr1781239608127361-
ENSG00000269928chr1781281398128798-
ENSG00000269947chr1781810818181754+
ENSG00000265749chr1782688818284646+
ENSG00000265975chr1788708408880312+
ENSG00000271851chr1794566409459013-
ENSG00000264067chr171022370910244775+
ENSG00000261433chr171056185910562399-
ENSG00000263400chr171063309410672323+
ENSG00000264016chr171064458410672333-
ENSG00000263429chr171069823010707416-
ENSG00000263508chr171075285810784212+
ENSG00000254652chr171146447311467380+
ENSG00000236088chr171365979513972812-
ENSG00000231595chr171411380514121239+
ENSG00000266709chr171420717114208822+
ENSG00000266261chr171555490415557803+
ENSG00000265519chr171569110115691519-
ENSG00000175061chr171634213616381992+
ENSG00000260328chr171691522816918304-
ENSG00000263624chr171707126017088868-
ENSG00000265511chr171741066517411622+
ENSG00000264666chr171749474217513799+
ENSG00000223979chr171757734017581002-
ENSG00000260647chr171817139418172142+
ENSG00000267350chr171822753618229211+
ENSG00000264177chr171828316918292298-
ENSG00000220161chr171831447318317694+
ENSG00000264885chr171857094218572774-
ENSG00000265478chr171871326918714253-
ENSG00000265185chr171896522518965807+
ENSG00000262074chr171896676218967449-
ENSG00000230197chr171898108818991191+
ENSG00000263394chr171899438218995138-
ENSG00000262202chr171901531319015949-
ENSG00000262319chr171904433019047002-
ENSG00000262292chr171906410219065587+
ENSG00000263934chr171909132919092027+
ENSG00000264940chr171909297819093558-
ENSG00000236022chr171910713819117358+
ENSG00000265263chr171923762119239440-
ENSG00000266079chr171946052419461224+
ENSG00000262681chr171962237219625741+
ENSG00000270091chr171979990319800600-
ENSG00000266126chr171983268519833050-
ENSG00000260907chr172043335520434194-
ENSG00000233098chr172077174620905589+
ENSG00000263986chr172090306020903636+
ENSG00000235530chr172111764421133348+
ENSG00000265246chr172556488525568687-
ENSG00000264469chr172564166925642952+
ENSG00000266872chr172595251025953464-
ENSG00000267259chr172655961626562307-
ENSG00000266830chr172657348026575032-
ENSG00000260777chr172659066026593395-
ENSG00000264098chr172672912826731067+
ENSG00000265254chr172673225826733814+
ENSG00000227543chr172692580826944393+
ENSG00000264608chr172692884526929302-
ENSG00000265287chr172693498126936748+
ENSG00000264044chr172696022426962968+
ENSG00000265205chr172699707226999822-
ENSG00000264577chr172704850527049895-
ENSG00000265474chr172707258727074670-
ENSG00000264304chr172721948727220360+
ENSG00000266642chr172722475627226412+
ENSG00000264808chr172769673527717795-
ENSG00000264290chr172789659827897537+
ENSG00000264007chr172794863527949272-
ENSG00000265625chr172797181427972865-
ENSG00000214719chr172890348228964482+
ENSG00000263603chr172905648729058220+
ENSG00000265791chr172910851129109239-
ENSG00000266490chr172911939029119851+
ENSG00000265743chr172929195329292518-
ENSG00000264456chr172929867029300330+
ENSG00000266340chr172930562829307268-
ENSG00000264107chr172941780529422468-
ENSG00000263990chr173020094530213685+
ENSG00000265139chr173065546030656414+
ENSG00000266718chr173082255430826351+
ENSG00000265222chr173083697230850442-
ENSG00000226377chr173120377731205655+
ENSG00000236377chr173123268031233602+
ENSG00000224113chr173333210733336762+
ENSG00000267457chr173340085033401393-
ENSG00000266947chr173355846933569982-
ENSG00000267364chr173364052133651919+
ENSG00000267547chr173373085633731392-
ENSG00000267745chr173373370333736787-
ENSG00000267074chr173382670933837289-
ENSG00000267321chr173389513933901811+
ENSG00000266911chr173408421834085344-
ENSG00000267025chr173414372134157297-
ENSG00000266999chr173422071134238027-
ENSG00000224298chr173440022634417480+
ENSG00000267488chr173451061534523870+
ENSG00000255509chr173521893535293960-
ENSG00000267798chr173535589735357333+
ENSG00000267542chr173596978735973886+
ENSG00000260833chr173660663836608688-
ENSG00000261005chr173685870536861000+
ENSG00000266040chr173685973336862514-
ENSG00000263874chr173708142137084310+
ENSG00000266753chr173740889737410550-
ENSG00000266469chr173755804637562486+
ENSG00000214546chr173777586637778766+
ENSG00000264198chr173791397437920089-
ENSG00000264968chr173808399538095854+
ENSG00000270145chr173845945738460909+
ENSG00000265666chr173849711938499388-
ENSG00000266088chr173867327838683254+
ENSG00000234477chr173907768239132178+
ENSG00000259623chr174000477040007699-
ENSG00000204815chr174008688840117648+
ENSG00000267548chr174012718240129749+
ENSG00000270010chr174019025040190752-
ENSG00000267221chr174019273140195135-
ENSG00000236194chr174042253540424701-
ENSG00000267632chr174066180240663537+
ENSG00000266962chr174070445640706766-
ENSG00000267765chr174083520540851484-
ENSG00000197291chr174090593240913275-
ENSG00000267002chr174131620041322420-
ENSG00000236383chr174136896041383338-
ENSG00000188825chr174144721341466567-
ENSG00000267151chr174152207541528568+
ENSG00000267166chr174199180142000369-
ENSG00000267080chr174225334142264085-
ENSG00000267394chr174227625042293933+
ENSG00000260793chr174229876942301078+
ENSG00000267750chr174237694242392683-
ENSG00000267160chr174275105742753625-
ENSG00000267505chr174287056742871842+
ENSG00000267405chr174287211542875151-
ENSG00000267288chr174324617243248951-
ENSG00000267121chr174326829843299589-
ENSG00000233175chr174331539543319101-
ENSG00000233483chr174332255343326203-
ENSG00000267278chr174332529243345997+
ENSG00000006062chr174334048843394414-
ENSG00000267344chr174347429843474843+
ENSG00000131484chr174358062643612076+
ENSG00000266918chr174360894343611204+
ENSG00000267198chr174362317043640596+
ENSG00000262372chr174411267944113136+
ENSG00000214401chr174427094244274089+
ENSG00000232300chr174463619644640161-
ENSG00000262879chr174506141145177689-
ENSG00000263293chr174538083245400979-
ENSG00000263766chr174568122645726786-
ENSG00000264920chr174596862145973178-
ENSG00000234494chr174597469646018776-
ENSG00000266601chr174600704846010472-
ENSG00000264019chr174602416846025641-
ENSG00000263412chr174612250346125435-
ENSG00000230148chr174662091346628610+
ENSG00000233101chr174662699246683776+
ENSG00000239552chr174663462446637695+
ENSG00000262745chr174676072946781844+
ENSG00000244649chr174678256546784708+
ENSG00000229637chr174680053046802819+
ENSG00000262837chr174791160147913816+
ENSG00000204584chr174792327247926199+
ENSG00000246640chr174812771348133103-
ENSG00000251179chr174835893848365216-
ENSG00000250286chr174861465548616115-
ENSG00000262967chr174877080948772810+
ENSG00000229980chr174894404048987098+
ENSG00000247011chr174901235049022074-
ENSG00000261589chr175324618453250993+
ENSG00000262951chr175494630854946925+
ENSG00000263004chr175515565955162385-
ENSG00000264112chr175606640056072211-
ENSG00000264364chr175616890956172897+
ENSG00000265148chr175640281156493127+
ENSG00000265206chr175640824556409869-
ENSG00000264672chr175659719856634338+
ENSG00000224738chr175718395957195628+
ENSG00000265415chr175728003857281190-
ENSG00000267302chr175804219358074333+
ENSG00000267416chr175815667058166056+
ENSG00000261040chr175816092758169246-
ENSG00000267248chr175820389658213005-
ENSG00000259349chr175860365458628159+
ENSG00000267449chr175914721759147717-
ENSG00000266934chr175946014659462041+
ENSG00000267280chr175947081759488916-
ENSG00000265702chr176077660560815283+
ENSG00000266411chr176104417861045910-
ENSG00000263899chr176211651062119203-
ENSG00000266402chr176222333062223836+
ENSG00000215769chr176274578162778117-
ENSG00000265218chr176288884762906298+
ENSG00000266644chr176289588462896834+
ENSG00000263470chr176309693063107176+
ENSG00000266473chr176524095365241922+
ENSG00000267009chr176640978366489811+
ENSG00000267194chr176754749967550002+
ENSG00000267365chr176816310268165543-
ENSG00000234899chr177003345570217977-
ENSG00000227036chr177031926470636611-
ENSG00000263893chr177063887070640152+
ENSG00000260248chr177117162271172772+
ENSG00000246731chr177220611972209481-
ENSG00000264272chr177225303572258159-
ENSG00000261222chr177259597972603368+
ENSG00000266036chr177274345872745051-
ENSG00000263586chr177296679972971823+
ENSG00000265800chr177313451173137445-
ENSG00000263786chr177314135673142641-
ENSG00000265242chr177316168173163344-
ENSG00000263843chr177326745073269976+
ENSG00000266980chr177381489673816136-
ENSG00000267801chr177387245373875627+
ENSG00000267342chr177389314173896229+
ENSG00000261408chr177397531274002080+
ENSG00000267128chr177413663774150731+
ENSG00000267546chr177454175074553765-
ENSG00000267543chr177454603374546908+
ENSG00000272386chr177454743474547832+
ENSG00000163597chr177455384874561430+
ENSG00000267078chr177456587474567322+
ENSG00000261335chr177466802474669740+
ENSG00000234912chr177508279875091068+
ENSG00000263718chr177525381975277979-
ENSG00000265121chr177526026275260858-
ENSG00000267506chr177554302275559325+
ENSG00000204282chr177610347976107880-
ENSG00000267737chr177631181076343879+
ENSG00000266970chr177635653476369992+
ENSG00000267432chr177648096476495428+
ENSG00000267123chr177661347176628139-
ENSG00000262768chr177777439777776326+
ENSG00000262772chr177779725177801503+
ENSG00000262585chr177788905177900524-
ENSG00000262188chr177789315677899261+
ENSG00000262580chr177817447278179748-
ENSG00000262979chr177828945178290433+
ENSG00000263069chr177832562878388968-
ENSG00000226137chr177900293379008501-
ENSG00000262115chr177917119379174088+
ENSG00000260005chr177920250779207783+
ENSG00000185168chr177927757179283048-
ENSG00000262877chr177936193079364056-
ENSG00000229848chr177948107379494802+
ENSG00000262049chr177966835479670330-
ENSG00000263731chr177983630179838982-
ENSG00000263859chr177983654379837433+
ENSG00000264769chr177988077579882387+
ENSG00000265688chr177988570579888629+
ENSG00000264569chr177999578179997256+
ENSG00000265678chr178011130680112691+
ENSG00000264548chr178017210380175228+
ENSG00000265692chr178024792280250690-
ENSG00000260563chr178025159280252786+
ENSG00000264812chr178035857980359258-
ENSG00000265458chr178041214980416397-
ENSG00000266236chr178043997480441264+
ENSG00000262652chr178053589980536492+
ENSG00000262147chr178054518980546287-
ENSG00000263063chr178067178480674131-
ENSG00000263321chr178068704080692019-
ENSG00000262410chr178070294480703585+
ENSG00000262663chr178087615880876661+
ENSG00000261888chr178106120581063860+
ENSG00000262094chr178116829681175490-
ENSG00000263884chr18268148270278+
ENSG00000264514chr18316737319165+
ENSG00000264433chr18316740317366-
ENSG00000266171chr18735746737459+
ENSG00000264635chr18738058739662-
ENSG00000263551chr189765901174824+
ENSG00000132204chr1812543841408345-
ENSG00000263745chr1818835252240847-
ENSG00000266783chr1825611712562219-
ENSG00000265399chr1831903953247275+
ENSG00000264235chr1832554343261848-
ENSG00000266578chr1832841433327290+
ENSG00000266835chr1834662483478976+
ENSG00000177337chr1835937303598350+
ENSG00000262001chr1836029983608334+
ENSG00000266401chr1836534103656282+
ENSG00000263753chr1852328755246507+
ENSG00000264575chr1852367235238597-
ENSG00000264707chr1862567466260933+
ENSG00000266441chr1867288206729861-
ENSG00000265933chr1869194956929965-
ENSG00000265413chr1884028458405159+
ENSG00000263970chr1884067598406951-
ENSG00000266708chr1886351778636345-
ENSG00000265962chr1886958548707619-
ENSG00000265257chr1891027349254344+
ENSG00000263847chr1891124029115875-
ENSG00000266053chr1891212639136643-
ENSG00000264964chr1893151929334439-
ENSG00000266805chr1895062409509724+
ENSG00000263627chr1896152629619361+
ENSG00000267143chr181162071611621157-
ENSG00000267165chr181185141311852750-
ENSG00000267480chr181203117712032180-
ENSG00000267069chr181228830712291487+
ENSG00000267199chr181243888912448204+
ENSG00000267411chr181265870912725739+
ENSG00000267249chr181267042512671144-
ENSG00000267654chr181273948912749420-
ENSG00000260302chr181277465012775922-
ENSG00000266969chr181298469312991172-
ENSG00000267150chr181408993414091018+
ENSG00000267356chr181410454114105225+
ENSG00000265787chr181433742214342524+
ENSG00000265766chr181447795414499277-
ENSG00000260263chr181852686718528428-
ENSG00000263350chr181921009919213485+
ENSG00000266010chr181974685919748929-
ENSG00000265943chr182027944420513727-
ENSG00000266850chr182030345420487684-
ENSG00000266495chr182083712820840318-
ENSG00000265752chr182153806021562520-
ENSG00000264924chr182169360121700967-
ENSG00000265750chr182173947321742175-
ENSG00000265485chr182220814622242162+
ENSG00000265369chr182426758524283602-
ENSG00000261521chr182863880628639359-
ENSG00000266729chr182892333129006951-
ENSG00000264859chr182912210929136874-
ENSG00000259985chr182926561829266786+
ENSG00000263823chr182952253829524119+
ENSG00000263393chr182970236329704441-
ENSG00000262477chr182999214529993199+
ENSG00000268573chr183286083132870165-
ENSG00000267583chr183302383333047052-
ENSG00000267397chr183329633433297942+
ENSG00000260552chr183375995933767411-
ENSG00000267707chr183482373934827179+


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.