The Cancer LncRNome Atlas



Bladder Urothelial Carcinoma (BLCA)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in BLCA

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000238121chr133091440730951282-
ENSG00000224743chr133145607031507983-
ENSG00000230633chr133287229132872849+
ENSG00000230490chr133392934334250905-
ENSG00000223685chr133862495438717369-
ENSG00000227258chr134471668244813010+
ENSG00000170919chr134591548045965872+
ENSG00000231817chr134702947247060641-
ENSG00000260388chr134850429048506757-
ENSG00000229111chr134865127348654127+
ENSG00000231473chr134887064948877797-
ENSG00000233610chr134915111049152224-
ENSG00000231607chr135060126950699856-
ENSG00000233672chr135145082251484848-
ENSG00000269965chr135193570151936371-
ENSG00000270101chr135193679551937579-
ENSG00000236778chr135202650352126500+
ENSG00000231856chr135237843352387356+
ENSG00000272281chr135274184452908412-
ENSG00000227674chr136456050464650144-
ENSG00000261553chr137612390976381256+
ENSG00000261105chr137617883676210130-
ENSG00000228444chr137620540776206271+
ENSG00000236051chr137764964977672677+
ENSG00000227354chr137998044479998463+
ENSG00000215417chr139200007492006833+
ENSG00000227640chr139536497095368500+
ENSG00000247400chr139630098796329179-
ENSG00000231194chr139908765999088094-
ENSG00000224418chr139922949899231084+
ENSG00000260992chr139974007399740879+
ENSG00000228889chr139984863199852964-
ENSG00000203441chr13100151981100153306-
ENSG00000272143chr13103046980103048053+
ENSG00000269942chr13103331776103332308+
ENSG00000233532chr13107028911107030565+
ENSG00000229152chr13111547406111551519-
ENSG00000225760chr13111635654111642911+
ENSG00000267868chr13113619149113620445-
ENSG00000235280chr13113621798113623138-
ENSG00000269356chr13113663092113663738+
ENSG00000269376chr13113663985113664633+
ENSG00000225083chr13114005988114016183+
ENSG00000233695chr13114518603114542321+
ENSG00000260910chr13114629487114631817-
ENSG00000258314chr141961176819643377+
ENSG00000225210chr141965001819718563+
ENSG00000258188chr141981217619859970+
ENSG00000244306chr141985409819925348-
ENSG00000215394chr141988938619904890+
ENSG00000257931chr141993201219972292-
ENSG00000258768chr142072863920732467-
ENSG00000259001chr142081120720811844-
ENSG00000258515chr142091946420920077+
ENSG00000259171chr142115274621168735+
ENSG00000258451chr142116163921175279-
ENSG00000258471chr142146399621467322-
ENSG00000258604chr142149233121497430+
ENSG00000258441chr142166823821675059-
ENSG00000260830chr142185245121853079+
ENSG00000251002chr142284908322951948-
ENSG00000259054chr142302520523025956-
ENSG00000258458chr142317182023235771-
ENSG00000237054chr142338866523396105+
ENSG00000257285chr142339881823424771+
ENSG00000258457chr142345190723468287+
ENSG00000157306chr142398096924029987+
ENSG00000258727chr142403030624037282+
ENSG00000215256chr142440794024458048-
ENSG00000259321chr142460865424609653+
ENSG00000260669chr142467885224685193-
ENSG00000257636chr143090719831042835-
ENSG00000258525chr143134538531359014-
ENSG00000250365chr143188949231922089+
ENSG00000258655chr143254462532545999-
ENSG00000258738chr143534354935345665+
ENSG00000258704chr143539006435451738-
ENSG00000258938chr143628843036295971-
ENSG00000258661chr143711628837128006-
ENSG00000259087chr143802536338036300-
ENSG00000258414chr143803325238048330+
ENSG00000259070chr143921854539417477-
ENSG00000258651chr143957234439573016+
ENSG00000259083chr143964408939645084-
ENSG00000258940chr143973490739736265-
ENSG00000251363chr144142410341445082+
ENSG00000258998chr144523236045252032-
ENSG00000258633chr144534607745366280-
ENSG00000258949chr144536811145381066-
ENSG00000257900chr144584647145858489+
ENSG00000259129chr144823415748264295-
ENSG00000258486chr145005329750053596+
ENSG00000258377chr145008753350090198-
ENSG00000258929chr145047403150507947-
ENSG00000259071chr145079324450794627-
ENSG00000269906chr145112922951129896-
ENSG00000270062chr145119049551190990-
ENSG00000258745chr145137894451380076+
ENSG00000258711chr145142297751428720-
ENSG00000258955chr145177113451795104-
ENSG00000258479chr145180011151832275+
ENSG00000259049chr145324195553244458+
ENSG00000258985chr145350347353504969+
ENSG00000237356chr145363577254153976+
ENSG00000186615chr145596599656046828-
ENSG00000258791chr145624786456263406-
ENSG00000258592chr145753297857579378-
ENSG00000259039chr145804535058048038+
ENSG00000259969chr145846026358461243-
ENSG00000257621chr145873208358764852-
ENSG00000247287chr146176488261789536-
ENSG00000250548chr146202303162037371-
ENSG00000258777chr146214775962162541-
ENSG00000258667chr146218227662217815-
ENSG00000259796chr146257759362579268+
ENSG00000186369chr146258419762596352+
ENSG00000259093chr146358975163594932-
ENSG00000261242chr146401028764011382+
ENSG00000214770chr146479614964805317-
ENSG00000258824chr146488965364915275-
ENSG00000272158chr146547004365470485-
ENSG00000258561chr146667952866976112-
ENSG00000258837chr146859172168596913-
ENSG00000259038chr146909388369095162-
ENSG00000259062chr146944639969454180+
ENSG00000258957chr146964973769680809-
ENSG00000258644chr147079306970883701-
ENSG00000257759chr147089252971014181-
ENSG00000259158chr147093559870950473-
ENSG00000258689chr147116541571178870+
ENSG00000259153chr147127692271282120+
ENSG00000269927chr147160784271609970-
ENSG00000259146chr147175944271788531-
ENSG00000266869chr147231532372375147+
ENSG00000258813chr147352513973526123-
ENSG00000258376chr147371072673712687-
ENSG00000258944chr147373889073740789-
ENSG00000255242chr147395766973960096+
ENSG00000258695chr147398958273997314+
ENSG00000258603chr147408341274100644-
ENSG00000258660chr147416480674167054-
ENSG00000259065chr147425406374269973+
ENSG00000258891chr147436286774404817-
ENSG00000258559chr147475583074761128-
ENSG00000270000chr147493863374939063-
ENSG00000259005chr147494071074941567-
ENSG00000259606chr147531072775322378+
ENSG00000258646chr147547142275475184-
ENSG00000259687chr147576110775763341+
ENSG00000259319chr147589038675894444-
ENSG00000258454chr147670216076729817+
ENSG00000259081chr147724062777247861-
ENSG00000258610chr147724529577248592+
ENSG00000258301chr147724808377253067-
ENSG00000258602chr147742598177432145+
ENSG00000258819chr147753552377542687-
ENSG00000258999chr148157337781636758-
ENSG00000205562chr148599147785996332-
ENSG00000258733chr148640105486596117+
ENSG00000258867chr148849089488563276+
ENSG00000258789chr148901794189018837+
ENSG00000258920chr148988369889886137+
ENSG00000258424chr149086886790871579-
ENSG00000258884chr149128870991294472-
ENSG00000260810chr149172464391725347+
ENSG00000260711chr149222310392226142-
ENSG00000261372chr149251111992516990-
ENSG00000259634chr149252489692525877-
ENSG00000235706chr149562398295646263+
ENSG00000229645chr149587360695876427-
ENSG00000247092chr149599863496001209-
ENSG00000187621chr149611683596146170+
ENSG00000260806chr149696714796968658-
ENSG00000258702chr149705907097062099+
ENSG00000225163chr149740991697411731+
ENSG00000258749chr149997883899979913+
ENSG00000247970chr14100070893100092077+
ENSG00000258982chr14100673744100704892-
ENSG00000258504chr14100757454100760993+
ENSG00000258521chr14100806169100806891+
ENSG00000214548chr14101245747101327368+
ENSG00000223403chr14101536248101539274+
ENSG00000259004chr14101587193101589879+
ENSG00000258498chr14102018558102026768-
ENSG00000259088chr14102262892102276658-
ENSG00000271780chr14102414684102415762+
ENSG00000272444chr14102418753102419400+
ENSG00000258959chr14102502652102532565-
ENSG00000259230chr14103011591103022163+
ENSG00000259515chr14103399911103403514+
ENSG00000251533chr14103653558103655365-
ENSG00000259775chr14103798011103798704-
ENSG00000260285chr14103991347103995409-
ENSG00000246451chr14104148699104150352-
ENSG00000270108chr14104153913104154464+
ENSG00000269910chr14104160853104161387-
ENSG00000269940chr14104160897104161507+
ENSG00000269958chr14104162690104163500+
ENSG00000269963chr14104179904104180586+
ENSG00000256050chr14105147483105151269+
ENSG00000258430chr14105235686105236608+
ENSG00000258701chr14105287538105290055+
ENSG00000258593chr14105324129105325173-
ENSG00000257556chr14105559946105565341+
ENSG00000251602chr14105883221105886076-
ENSG00000253701chr14106170301106170939-
ENSG00000260409chr152093507620961512-
ENSG00000247765chr152194114721968151-
ENSG00000224078chr152522470425664609+
ENSG00000257151chr152527702025281637+
ENSG00000270246chr152528706525287575+
ENSG00000261069chr152533280825334043+
ENSG00000256802chr152996719429973161+
ENSG00000259523chr153011483430116284+
ENSG00000270173chr153064996930650976-
ENSG00000270055chr153078016630782516+
ENSG00000260693chr153083229630838172+
ENSG00000270016chr153089989830900396-
ENSG00000269930chr153090916130909952+
ENSG00000247728chr153090920130917976-
ENSG00000269974chr153094100030941732+
ENSG00000270015chr153121871731220610+
ENSG00000259448chr153150822331516648+
ENSG00000259772chr153151420231523041-
ENSG00000261064chr153282824832879814+
ENSG00000262728chr153289861932907361-
ENSG00000244952chr153290593432907312+
ENSG00000259408chr153414710134149010-
ENSG00000259287chr153415091834157026-
ENSG00000248079chr153583839636151202+
ENSG00000259460chr153739154037392374+
ENSG00000259225chr153827696738354541+
ENSG00000236914chr153836168238365160-
ENSG00000259380chr153843179638519088-
ENSG00000259345chr153915752339719396-
ENSG00000259450chr153948063939486510-
ENSG00000261136chr154007477240077818+
ENSG00000248508chr154033151240359491+
ENSG00000259330chr154061741740618916+
ENSG00000259211chr154075639240758925-
ENSG00000259536chr154078024040850183+
ENSG00000245849chr154097892240987305-
ENSG00000261183chr154112800641136585-
ENSG00000251161chr154119900941201540+
ENSG00000247556chr154157618841601901+
ENSG00000260814chr154206295442064930-
ENSG00000174171chr154218499142190773+
ENSG00000272003chr154218813742189031-
ENSG00000259883chr154221361542221081+
ENSG00000246740chr154226496142291292+
ENSG00000258461chr154264030142704515+
ENSG00000261684chr154282406542825038-
ENSG00000261822chr154285922942862192-
ENSG00000246283chr154303131643035400+
ENSG00000261687chr154347627743477339-
ENSG00000179523chr154481945544829121-
ENSG00000259659chr154485002744851386+
ENSG00000259932chr154549071545491337-
ENSG00000259520chr154554388445571449-
ENSG00000259342chr154572285045734006-
ENSG00000259354chr154574062545805965+
ENSG00000259488chr154860455048624053-
ENSG00000261597chr154994433649948429+
ENSG00000244879chr155064752550659636+
ENSG00000259715chr155065164750652391-
ENSG00000259298chr155078939250790941-
ENSG00000259684chr155084979850852697+
ENSG00000259240chr155132968551586109+
ENSG00000259306chr155160803851614193+
ENSG00000259668chr155174948351752779+
ENSG00000259438chr155230319652311292-
ENSG00000259712chr155234887252392720-
ENSG00000259327chr155240877152414328+
ENSG00000259577chr155247229052498071+
ENSG00000260618chr155287003952890906+
ENSG00000225973chr155560938255611359-
ENSG00000261771chr155564744655790558-
ENSG00000247982chr155759256357599959+
ENSG00000259250chr155887970658883875+
ENSG00000245975chr155906027159063173-
ENSG00000259353chr155914903059157262-
ENSG00000259732chr155941323359425449+
ENSG00000259238chr155998071659981617+
ENSG00000245534chr156077137760922836+
ENSG00000259251chr156235270262354633+
ENSG00000259727chr156318801163191742+
ENSG00000259498chr156333823363341586-
ENSG00000259627chr156336222463364110-
ENSG00000259248chr156383644663893788-
ENSG00000265967chr156498724064987793+
ENSG00000260773chr156660725266624041-
ENSG00000269999chr156678099666781427-
ENSG00000261351chr156678208666784447-
ENSG00000259673chr156769595767814182-
ENSG00000270964chr156783341067834942-
ENSG00000261425chr156859112868593343-
ENSG00000212766chr156936526669388160+
ENSG00000259426chr156968924369707368-
ENSG00000245750chr156975536569863775+
ENSG00000031544chr157208497772110600+
ENSG00000261460chr157257120872644135+
ENSG00000260729chr157257706872668322-
ENSG00000260339chr157266845472671129+
ENSG00000261423chr157270011972767509-
ENSG00000261187chr157275746972758603-
ENSG00000260534chr157288203272884186+
ENSG00000261801chr157420042474220589-
ENSG00000259264chr157449504674513896+
ENSG00000247240chr157475360674773643+
ENSG00000260274chr157566049675661925+
ENSG00000260269chr157581949175893546-
ENSG00000246877chr157602001176030964-
ENSG00000260288chr157603016176055662+
ENSG00000260787chr157733417877335533-
ENSG00000269951chr157735999677360667-
ENSG00000259420chr157786131277901023+
ENSG00000261762chr157888146578883618-
ENSG00000177699chr157927123179278268+
ENSG00000261712chr157970570079706228+
ENSG00000261229chr158013588980136646-
ENSG00000259417chr158048782680544555-
ENSG00000270919chr158087237080872907-
ENSG00000271983chr158098555780986048-
ENSG00000271725chr158159555681601732-
ENSG00000259343chr158161671881654378+
ENSG00000259692chr158195282382163466-
ENSG00000259445chr158224564482288007-
ENSG00000259206chr158271085682726435+
ENSG00000259310chr158308738183102960+
ENSG00000259442chr158341297583419041+
ENSG00000250988chr158341931683425958+
ENSG00000252690chr158342163683425960+
ENSG00000260579chr158378236983783318-
ENSG00000259774chr158497731684980581+
ENSG00000259244chr158505647285070180-
ENSG00000254414chr158517512985177218-
ENSG00000259367chr158616285486214179-
ENSG00000259407chr158628734086293512-
ENSG00000173867chr158900294889055760-
ENSG00000271997chr158904517589049018-
ENSG00000261407chr158963030989631498-
ENSG00000261441chr158987828489879392+
ENSG00000255571chr158990481089939471+
ENSG00000259291chr159061774790625439-
ENSG00000259894chr159078864590789043+
ENSG00000259736chr159116323991260372-
ENSG00000259704chr159138295491384608+
ENSG00000259661chr159146344891464416-
ENSG00000258384chr159149546991498455-
ENSG00000258725chr159150957591531854+
ENSG00000214432chr159156584991579841+
ENSG00000258761chr159270602892715666-
ENSG00000258647chr159311104893115272-
ENSG00000260361chr159332298793324722-
ENSG00000258754chr159426177194614049-
ENSG00000258476chr159440633894421585+
ENSG00000260359chr159502404095027181+
ENSG00000270017chr159539881595400240-
ENSG00000248441chr159581969095870358-
ENSG00000259134chr159597632496051076+
ENSG00000247809chr159667059896870590-
ENSG00000259485chr159783911197975324+
ENSG00000261054chr159966903799672011-
ENSG00000261616chr159967952299685575+
ENSG00000189419chr15100884662100890438-
ENSG00000270127chr15101087972101090358-
ENSG00000232386chr15101389766101404501+
ENSG00000259583chr15101433945101459488-
ENSG00000259182chr15101708735101711026+
ENSG00000259172chr15101835624101845942+
ENSG00000231439chr167291075123+
ENSG00000268836chr16235747236293-
ENSG00000236829chr16432097442960+
ENSG00000228201chr16698473699200-
ENSG00000262528chr16705034706194-
ENSG00000261659chr16739001742554+
ENSG00000259840chr16760746761277-
ENSG00000260022chr16933780935090+
ENSG00000260439chr16971033984495+
ENSG00000260807chr1610257611031596-
ENSG00000261505chr1613678921372846-
ENSG00000260132chr1614588351462249+
ENSG00000261641chr1614953441496520+
ENSG00000260051chr1615017611502654+
ENSG00000260646chr1615629801564676+
ENSG00000260954chr1616292431630309-
ENSG00000261207chr1618015601802263-
ENSG00000255198chr1620149602015510+
ENSG00000259933chr1621414372145426+
ENSG00000261123chr1621448312147027-
ENSG00000260260chr1622047982205359-
ENSG00000259780chr1622856902286914-
ENSG00000261663chr1622904882291819+
ENSG00000260778chr1623181562323419+
ENSG00000260095chr1625025822502978-
ENSG00000260874chr1625062532509980-
ENSG00000261613chr1626040612606061-
ENSG00000269937chr1626114722615097-
ENSG00000261140chr1626190442621937-
ENSG00000260436chr1626215712622354-
ENSG00000260565chr1627103502723445-
ENSG00000205913chr1627870772802601-
ENSG00000263280chr1629163492917619-
ENSG00000262482chr1629897153004277-
ENSG00000262152chr1630389623044510+
ENSG00000272079chr1630561213057386+
ENSG00000205890chr1630824823089134+
ENSG00000261971chr1631019923109371-
ENSG00000262370chr1631269123137101-
ENSG00000263214chr1631604613165599-
ENSG00000263072chr1631660433184883-
ENSG00000261889chr1632067373207484-
ENSG00000262621chr1634150993536953+
ENSG00000263235chr1637006373701704-
ENSG00000262185chr1639976104000445-
ENSG00000263105chr1642301184233516-
ENSG00000262468chr1642958264303790-
ENSG00000262712chr1643858714387819-
ENSG00000267077chr1648452664846533-
ENSG00000260411chr1652898036826015+
ENSG00000260350chr1689415078942581-
ENSG00000260276chr1689419628954274+
ENSG00000261481chr1689631088963889+
ENSG00000260979chr1690565639060847+
ENSG00000262944chr1691987059200618+
ENSG00000260349chr1691996919201031-
ENSG00000263244chr1692010989207038+
ENSG00000263013chr161103274311033901-
ENSG00000262222chr161103457611036878+
ENSG00000263080chr161143566611439068-
ENSG00000262703chr161144200011443178-
ENSG00000263307chr161194550611989468+
ENSG00000261560chr161197493211976426-
ENSG00000262097chr161410313714109873-
ENSG00000262454chr161439614514420210+
ENSG00000257264chr161499535614996031+
ENSG00000258354chr161500374415005202-
ENSG00000260872chr161511196315114345-
ENSG00000260735chr161518826815203054+
ENSG00000270580chr161519858015225458-
ENSG00000257391chr161524876015250877+
ENSG00000261422chr161550657715507125+
ENSG00000263335chr161582053115826850+
ENSG00000263065chr161583500815835648+
ENSG00000262848chr161638399216386099-
ENSG00000263198chr161638603516388663-
ENSG00000257381chr161639400716394683+
ENSG00000261448chr161722836117232593+
ENSG00000257527chr161850516618505708-
ENSG00000260352chr161893818518948365+
ENSG00000261465chr161907382119079013-
ENSG00000261357chr161907731319078016+
ENSG00000260430chr161909817819109432+
ENSG00000261759chr161913129819132951-
ENSG00000259925chr161935496919413015-
ENSG00000260592chr161948823819499221-
ENSG00000260934chr161951301119513608+
ENSG00000261312chr161971767319726705+
ENSG00000189149chr162131217021329912+
ENSG00000261596chr162163806321638723+
ENSG00000260306chr162180541621807080-
ENSG00000260277chr162209457722103552-
ENSG00000261113chr162229802922300059-
ENSG00000260905chr162262386422624804-
ENSG00000260136chr162346407923468927+
ENSG00000260751chr162357999423581017+
ENSG00000260482chr162368133223684448+
ENSG00000259806chr162368345323686820+
ENSG00000261266chr162369837023699665-
ENSG00000262155chr162507825825080264+
ENSG00000260448chr162509691325122876-
ENSG00000236481chr162659607626606134-
ENSG00000259940chr162722463127226314-
ENSG00000246465chr162829620628303385-
ENSG00000251417chr162881409728829149+
ENSG00000261766chr162887348728874661-
ENSG00000260442chr162889027828891241-
ENSG00000260853chr162896800828978204-
ENSG00000261067chr162898612529002096+
ENSG00000260367chr162898629428990145-
ENSG00000260517chr162912744829229181+
ENSG00000259807chr162922849129231352-
ENSG00000198106chr162926282929519817+
ENSG00000260280chr162946641229476283+
ENSG00000260043chr162967976329681839+
ENSG00000238045chr162981996629823306-
ENSG00000261962chr162982025029831687-
ENSG00000261690chr162982930129832573-
ENSG00000214725chr162987491429879371+
ENSG00000260114chr162993095729933226-
ENSG00000247735chr162993815729940254+
ENSG00000250616chr163010775130115437+
ENSG00000261416chr163019482630196278-
ENSG00000213599chr163020521330215631+
ENSG00000260219chr163036676230367848+
ENSG00000260487chr163049190930492667-
ENSG00000261332chr163051008730510875-
ENSG00000235560chr163054607330548465+
ENSG00000239791chr163058357130595181+
ENSG00000261840chr163070903030710379-


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.