The Cancer LncRNome Atlas



Skin Cutaneous Melanoma (SKCM)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in SKCM

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000268894chr109603903496046828-
ENSG00000226688chr109751296397849995-
ENSG00000177853chr109788947297965044+
ENSG00000231025chr109875220798755716+
ENSG00000231970chr109916087299179281+
ENSG00000230928chr10100011780100016332+
ENSG00000224934chr10101190948101195542+
ENSG00000260475chr10101380812101381675+
ENSG00000229278chr10101411746101413662-
ENSG00000236308chr10101949793101950504+
ENSG00000235823chr10102133372102143125+
ENSG00000226009chr10103578835103588536+
ENSG00000269609chr10104209574104220863+
ENSG00000203886chr10104592478104594273+
ENSG00000234699chr10105212603105222452+
ENSG00000260461chr10105637132105639519-
ENSG00000231233chr10106111349106113333-
ENSG00000225768chr10106234697106240032-
ENSG00000232470chr10112629501112631352+
ENSG00000203497chr10112629626112631991-
ENSG00000270589chr10112670354112672002+
ENSG00000260917chr10114583249114587485+
ENSG00000233547chr10114710405114711634-
ENSG00000232767chr10118429614118432250+
ENSG00000225302chr10118592512118609716-
ENSG00000229847chr10119232726119304579-
ENSG00000177640chr10119805790119969663+
ENSG00000226864chr10123687827123711480+
ENSG00000233334chr10126392194126402786+
ENSG00000249456chr10126605712126631450+
ENSG00000224023chr10127389005127408135-
ENSG00000236991chr10127433296127440679-
ENSG00000235180chr10128102438128110448-
ENSG00000237489chr10131864638131909081-
ENSG00000235245chr10135108691135109481-
ENSG00000230724chr11127115139612-
ENSG00000255026chr11287305288987+
ENSG00000254910chr11310139311141-
ENSG00000251661chr11318640325631+
ENSG00000255089chr11321991322426+
ENSG00000270105chr11322186322727-
ENSG00000270030chr11325703326294-
ENSG00000255328chr11327171330122+
ENSG00000270972chr11333192333688+
ENSG00000255237chr11462930463899-
ENSG00000254739chr11528907529659+
ENSG00000254815chr11557595560107+
ENSG00000247095chr11565660568457-
ENSG00000255108chr11823634832883-
ENSG00000250397chr11856880859795-
ENSG00000255153chr1113309991331937+
ENSG00000233930chr1115925831620414+
ENSG00000235027chr1117815781783716+
ENSG00000229671chr1119238771929145+
ENSG00000226416chr1120044672011150-
ENSG00000130600chr1120164062022700-
ENSG00000240801chr1121503512151194-
ENSG00000238184chr1123499792399222-
ENSG00000269821chr1126295582721224-
ENSG00000250404chr1138379823843130+
ENSG00000228661chr1138755483876739-
ENSG00000229368chr1138758423876629+
ENSG00000254480chr1142083704223885+
ENSG00000267940chr1162231316224483-
ENSG00000254400chr1166248726625650-
ENSG00000255680chr1166400216640995+
ENSG00000255390chr1166426826643553+
ENSG00000251364chr1174484977533746-
ENSG00000254665chr1187149048718154+
ENSG00000254860chr1189862228999074+
ENSG00000245522chr1197763179781080-
ENSG00000246273chr1197798399832866+
ENSG00000177112chr111056281910621479+
ENSG00000246308chr111083084410844478+
ENSG00000247271chr111087980610928349+
ENSG00000250041chr111090643210920869-
ENSG00000255462chr111159163111595329+
ENSG00000254680chr111228297312284720-
ENSG00000254847chr111255963012562514-
ENSG00000251381chr111298405713011095-
ENSG00000254438chr111394299713946410-
ENSG00000152268chr111398391414289646+
ENSG00000254645chr111572350915780444-
ENSG00000260196chr111740219617405078+
ENSG00000247595chr111862133418631802+
ENSG00000254966chr111872808418762115+
ENSG00000270607chr111973248019734165-
ENSG00000254453chr112006539220070849-
ENSG00000246225chr112285092622966939+
ENSG00000254560chr112706873327241660-
ENSG00000245573chr112752838527719721+
ENSG00000255322chr112837365428548588+
ENSG00000255480chr113044709930450815+
ENSG00000183242chr113245706432480315+
ENSG00000255521chr113515420235159579-
ENSG00000255443chr113523189035236532-
ENSG00000251194chr113523409735235554+
ENSG00000261355chr113583588235839557+
ENSG00000244926chr114393084243942494-
ENSG00000244953chr114396533743968756-
ENSG00000254427chr114537692245387672+
ENSG00000247675chr114686796346895947+
ENSG00000270060chr114718983247191114-
ENSG00000256897chr114724176947243302-
ENSG00000255197chr114740469947430741-
ENSG00000254662chr115709307757095432+
ENSG00000255301chr115724396657245007-
ENSG00000254602chr115740549757420263+
ENSG00000245571chr115889760658910488-
ENSG00000255139chr115938390259407334+
ENSG00000255355chr115943678559443514+
ENSG00000254477chr115952048859522448-
ENSG00000257052chr116067426160677214+
ENSG00000267811chr116253859262539078-
ENSG00000269176chr116255349862554257-
ENSG00000269463chr116257515462575535-
ENSG00000256690chr116259970662601515+
ENSG00000255717chr116261946062623386-
ENSG00000188070chr116352736463536113-
ENSG00000256824chr116380344263871125+
ENSG00000256481chr116384916263854647+
ENSG00000256116chr116399668664001824-
ENSG00000256940chr116401343664015689+
ENSG00000257086chr116401441164016966-
ENSG00000236935chr116409252264096976-
ENSG00000231680chr116416181464163303-
ENSG00000269038chr116454642664546877+
ENSG00000269290chr116455239364553092-
ENSG00000254501chr116487818664879167-
ENSG00000245532chr116519024565213011+
ENSG00000251562chr116526523365273940+
ENSG00000260233chr116533713165337744-
ENSG00000175513chr116571291665727434+
ENSG00000255320chr116601231166013710-
ENSG00000254461chr116602703866029305-
ENSG00000254855chr116603224866033137-
ENSG00000245156chr116603730366045996-
ENSG00000255517chr116624096166247704-
ENSG00000269990chr116630336966305407-
ENSG00000258297chr116643350766435845+
ENSG00000256514chr116711904367141055-
ENSG00000269913chr116722733967227784+
ENSG00000255318chr116738575067394775-
ENSG00000255031chr116781820767821229+
ENSG00000255236chr116788952067897985+
ENSG00000260808chr116838036768384179-
ENSG00000250508chr116863813268642010+
ENSG00000261625chr116876823368769516-
ENSG00000259799chr116892337868927220+
ENSG00000260877chr116918623169187279+
ENSG00000254721chr117005239770053496-
ENSG00000254604chr117012847370209474-
ENSG00000246889chr117021835270244594-
ENSG00000254682chr117115972071163203+
ENSG00000248671chr117150540971524905-
ENSG00000251143chr117172533771731956+
ENSG00000255843chr117201318372014009+
ENSG00000227467chr117228170472284273+
ENSG00000256633chr117229561672299023+
ENSG00000245148chr117241151972416652+
ENSG00000260401chr117295002072953380+
ENSG00000257038chr117301828073020406-
ENSG00000256360chr117363957873641417+
ENSG00000254837chr117420441174209578+
ENSG00000254429chr117497117174972069+
ENSG00000255326chr117529424175305710+
ENSG00000255434chr117530718975308315-
ENSG00000255507chr117551447675526451-
ENSG00000255362chr117592200075927069-
ENSG00000272301chr117610069276101172+
ENSG00000271757chr117610324076103949+
ENSG00000255135chr117615238276155700-
ENSG00000254810chr117636521376367756-
ENSG00000255100chr117649362576494106-
ENSG00000261578chr117651140876515599+
ENSG00000255449chr117757745877581137-
ENSG00000246174chr117785081777886369+
ENSG00000254420chr117803580478155095+
ENSG00000251323chr117813502878140882-
ENSG00000255345chr117880389378809048+
ENSG00000246067chr118278310882817761+
ENSG00000254676chr118289118682895562+
ENSG00000247137chr118289553382904836-
ENSG00000254551chr118292047382924421-
ENSG00000255471chr118660325686636079-
ENSG00000246523chr118666666186712001+
ENSG00000254911chr119345467993455032+
ENSG00000250519chr119397131694012372+
ENSG00000255893chr119420607494206736-
ENSG00000245552chr119488370394967268+
ENSG00000250390chr119521557095230717+
ENSG00000248027chr11100554893100558686-
ENSG00000255337chr11102323650102332739+
ENSG00000110347chr11102733467102745764-
ENSG00000260966chr11102921416102926528-
ENSG00000256422chr11104316596104480049-
ENSG00000260512chr11106544738106550066-
ENSG00000261098chr11107182858107186997-
ENSG00000254416chr11110225855110277124+
ENSG00000271390chr11110960594110961092-
ENSG00000271584chr11110962656110968081-
ENSG00000250303chr11112141472112233257+
ENSG00000254626chr11112658027112666577+
ENSG00000247416chr11112830002112834182-
ENSG00000255129chr11113149159113185159-
ENSG00000270179chr11113239200113239839+
ENSG00000256603chr11113641115113642413-
ENSG00000246100chr11115624966115631345-
ENSG00000226645chr11116644105116644921+
ENSG00000231611chr11116645826116646592-
ENSG00000254528chr11117704434117709657+
ENSG00000255435chr11118382626118401809-
ENSG00000255422chr11118575316118620973+
ENSG00000255121chr11118865534118868714-
ENSG00000254428chr11118874452118875603-
ENSG00000255114chr11118914899118916205+
ENSG00000245248chr11119252488119397374+
ENSG00000263873chr11119288661119289824+
ENSG00000254854chr11119600293119610333+
ENSG00000255248chr11121899063121987031-
ENSG00000255090chr11122026130122293579-
ENSG00000245498chr11124670346124704383+
ENSG00000254932chr11125128522125136694-
ENSG00000260209chr11125742926125744423-
ENSG00000264299chr11125827795125828547+
ENSG00000254905chr11126162817126164149-
ENSG00000254703chr11128561575128565918-
ENSG00000255455chr11130736149130740142-
ENSG00000204241chr11133902167133916744+
ENSG00000254648chr11133905727133907002-
ENSG00000251226chr11134605490134633704+
ENSG00000249054chr126760769138+
ENSG00000261799chr12383120386289-
ENSG00000177406chr12740057772872+
ENSG00000250132chr1210832991100356-
ENSG00000256271chr1227776662781386-
ENSG00000246627chr1227851672800366-
ENSG00000258325chr1229060432922068-
ENSG00000250899chr1231506033154116+
ENSG00000256164chr1243579314385350-
ENSG00000256417chr1253996465492819+
ENSG00000256433chr1265030716504235+
ENSG00000215039chr1265481676560733-
ENSG00000239002chr1266193886619717+
ENSG00000255966chr1266414566642664-
ENSG00000269968chr1266469606647536-
ENSG00000247853chr1266877886693905+
ENSG00000219410chr1267724266781235+
ENSG00000269892chr1268521516852807+
ENSG00000272173chr1270526717053767-
ENSG00000272062chr1270724087085165+
ENSG00000126749chr1270800567085781+
ENSG00000255896chr1270800847105520+
ENSG00000272201chr1270876837089103+
ENSG00000205885chr1272606487275097+
ENSG00000256967chr1272816757283794-
ENSG00000226711chr1283328058368747+
ENSG00000215241chr1283880118395160+
ENSG00000226091chr1284485828549399-
ENSG00000249790chr1289408538948385+
ENSG00000245105chr1292177739220651+
ENSG00000237248chr1293925999395635+
ENSG00000260423chr1295200609550213+
ENSG00000257027chr1298111639814681+
ENSG00000231560chr121010073610105935-
ENSG00000245648chr121051636810551105+
ENSG00000256039chr121070596210710648+
ENSG00000247157chr121170096411743303+
ENSG00000247498chr121308066013137579+
ENSG00000256084chr121436952414374231+
ENSG00000256751chr121472068414772689+
ENSG00000261324chr121491543814920865-
ENSG00000255644chr122191291421919639+
ENSG00000256973chr122261345322616848-
ENSG00000256995chr122285279323327057+
ENSG00000256321chr122325230223344521+
ENSG00000255864chr122436619024715524-
ENSG00000246695chr122609226226112698-
ENSG00000256894chr122627808826279550-
ENSG00000256234chr122636409726488789-
ENSG00000255750chr122638375226472653-
ENSG00000247903chr122712451927132515+
ENSG00000256377chr122784932127863703-
ENSG00000257042chr122811145028122746+
ENSG00000247934chr122831623128343299-
ENSG00000257176chr122943335129470781-
ENSG00000235884chr123094797730955645+
ENSG00000245614chr123117369731226781-
ENSG00000255867chr123174285731768600+
ENSG00000255760chr123203001332040137-
ENSG00000257718chr123930025339303394+
ENSG00000257742chr124411279644117803-
ENSG00000257261chr124677746246850051+
ENSG00000272369chr124693128547046333+
ENSG00000247774chr124759968147610239-
ENSG00000257924chr124774753747763718+
ENSG00000257433chr124809986848136077+
ENSG00000257660chr124918293049184318+
ENSG00000257913chr124939215049412988+
ENSG00000257346chr124948399149487095+
ENSG00000258017chr124952156549541652+
ENSG00000258101chr124962735249658539-
ENSG00000258232chr124965893949667089-
ENSG00000258057chr125022232550234926+
ENSG00000272368chr125050598050559203+
ENSG00000260122chr125220348952204384-
ENSG00000260415chr125220378952206648+
ENSG00000261586chr125221168352213934+
ENSG00000259884chr125245224352453287-
ENSG00000257663chr125247062552475868-
ENSG00000257337chr125340838053448222-
ENSG00000257605chr125369244953694098-
ENSG00000257379chr125383552553861312+
ENSG00000270175chr125389394653894720-
ENSG00000249641chr125432911254333427-
ENSG00000271090chr125435031854352745+
ENSG00000228630chr125435609254368740-
ENSG00000251151chr125437529354379303-
ENSG00000250133chr125438759454390569-
ENSG00000250451chr125439280654393794-
ENSG00000260597chr125441369454416373+
ENSG00000248265chr125445203854516018+
ENSG00000250432chr125447891654519776-
ENSG00000250742chr125451988254526627+
ENSG00000260470chr125453885354541009-
ENSG00000257596chr125465639954672847+
ENSG00000258056chr125612288856124467+
ENSG00000257509chr125615533456156412-
ENSG00000257553chr125649839856507689-
ENSG00000258317chr125651381756523403-
ENSG00000258199chr125655614356584068-
ENSG00000257303chr125669392656708592+
ENSG00000257740chr125670265256703233+
ENSG00000224713chr125800590158013421-
ENSG00000257499chr125811754458119448-
ENSG00000270039chr125819762158198198+
ENSG00000269903chr125820827758208709+
ENSG00000257953chr125823087558236528+
ENSG00000245651chr125826361858290265-
ENSG00000257698chr125832531158329958-
ENSG00000257354chr126299653263007855+
ENSG00000249753chr126401756864189498-
ENSG00000255629chr126454016864541637-
ENSG00000250748chr126586060066036152-
ENSG00000256268chr126599664966006777+
ENSG00000256083chr126632855766342259-
ENSG00000239335chr126652453166528229+
ENSG00000255733chr126838322568628466+
ENSG00000251301chr126872666868845443-
ENSG00000247363chr126906815169081535-
ENSG00000257181chr126923506869237017-
ENSG00000257815chr127029781370637140-
ENSG00000257613chr127061291270615642-
ENSG00000258168chr127086186070932859+
ENSG00000257410chr127218763572193407-
ENSG00000236333chr127264728872668687-
ENSG00000257497chr127587790475883600-
ENSG00000258077chr127595698276377795-
ENSG00000258088chr127608779076092596-
ENSG00000257453chr127642427476425158+
ENSG00000257839chr127642643876427677+
ENSG00000257219chr127665361976698911+
ENSG00000231121chr127771842177966055+
ENSG00000258066chr127816956378177356+
ENSG00000257894chr127973498579897176-
ENSG00000257557chr128032868180334448+
ENSG00000269916chr128565732285658235+
ENSG00000246363chr128940445889413456-
ENSG00000271327chr128976158489763078+
ENSG00000271259chr128976559789766136+
ENSG00000270344chr128991943189934079+
ENSG00000258302chr128995490689987798+
ENSG00000271614chr129010273690106367+
ENSG00000245904chr129253934992583436+
ENSG00000266923chr129281530792877456+
ENSG00000257322chr129339719193609455-
ENSG00000258171chr129356814293575608+
ENSG00000257252chr129371091193771512-
ENSG00000246985chr129393623993965544-
ENSG00000258303chr129422994394231814+
ENSG00000257283chr129428874194337379-
ENSG00000257167chr129890675198910200-
ENSG00000257681chr12104140093104162636-
ENSG00000257918chr12107108702107126844-
ENSG00000260329chr12107347807107349275-
ENSG00000257221chr12109022463109035094+
ENSG00000256262chr12109490155109491757-
ENSG00000256139chr12109549023109563399+
ENSG00000255650chr12110171971110211313-
ENSG00000258210chr12110825268110883353-
ENSG00000258099chr12112037302112038060+
ENSG00000234608chr12112277571112280706-
ENSG00000270018chr12112335140112335710+
ENSG00000249550chr12114117264114211488-
ENSG00000255399chr12114845996114850636+
ENSG00000271579chr12115737393115738513-
ENSG00000196668chr12116971227116974323+
ENSG00000258102chr12116985911116992186+
ENSG00000270482chr12118813155118814080-
ENSG00000248636chr12119825792120105884-
ENSG00000255857chr12120639094120650941+
ENSG00000248008chr12120928131120933743-
ENSG00000271769chr12121438289121439071-
ENSG00000261827chr12121625359121625835+
ENSG00000256392chr12122217514122241309-
ENSG00000212694chr12122233173122241812-
ENSG00000256546chr12122501212122506522+
ENSG00000270134chr12123210623123211051-
ENSG00000256028chr12123459867123467454+
ENSG00000235423chr12123736577123746030-
ENSG00000270113chr12123773656123774230-
ENSG00000256092chr12123848415123850660+
ENSG00000247373chr12124066767124069662-
ENSG00000270028chr12124410008124410630-
ENSG00000270005chr12124420169124420753-
ENSG00000269997chr12124450624124451176-
ENSG00000269938chr12124452570124453126-
ENSG00000270061chr12124454537124454891-
ENSG00000269923chr12124570308124573142+
ENSG00000214650chr12124997768124999359+
ENSG00000189238chr12127210816127230798+
ENSG00000256128chr12127214333127256957-
ENSG00000249345chr12127399766127544946-
ENSG00000256001chr12127629617127631077-
ENSG00000249196chr12129594174129597839+
ENSG00000250208chr12130634894130646801-
ENSG00000255933chr12132241511132242592-
ENSG00000255992chr12132409281132413896-
ENSG00000256576chr12132671287132674240-
ENSG00000204583chr12133179736133187037-
ENSG00000236617chr12133464428133465169+
ENSG00000250790chr12133488056133489173+
ENSG00000226352chr132024876420250024+
ENSG00000224429chr132187765121922860-
ENSG00000232977chr132404071024061603+
ENSG00000205861chr132446302824471402+
ENSG00000228741chr132455394924609166+
ENSG00000205822chr132514101125171814+
ENSG00000260509chr132587426225875576-
ENSG00000260704chr132852766328529507+
ENSG00000261485chr132871098028712330-
ENSG00000238121chr133091440730951282-
ENSG00000225039chr133099365630996374-
ENSG00000237879chr133137734331384782+
ENSG00000230633chr133287229132872849+
ENSG00000236581chr133385169033855471+
ENSG00000230490chr133392934334250905-
ENSG00000234535chr133418510434185659+
ENSG00000230390chr133805560438058906-
ENSG00000223685chr133862495438717369-
ENSG00000230058chr134091809440924440-
ENSG00000271216chr134338450243386698-
ENSG00000233725chr134448285044604597+
ENSG00000227258chr134471668244813010+
ENSG00000170919chr134591548045965872+
ENSG00000251015chr134599229745994506+
ENSG00000235903chr134662694146687467+
ENSG00000231817chr134702947247060641-
ENSG00000260388chr134850429048506757-
ENSG00000227848chr134857552548576688+
ENSG00000229111chr134865127348654127+
ENSG00000231473chr134887064948877797-
ENSG00000233610chr134915111049152224-
ENSG00000231607chr135060126950699856-
ENSG00000237152chr135138199251423190+
ENSG00000233672chr135145082251484848-
ENSG00000269965chr135193570151936371-
ENSG00000270101chr135193679551937579-
ENSG00000236778chr135202650352126500+
ENSG00000231856chr135237843352387356+
ENSG00000272281chr135274184452908412-
ENSG00000237378chr136432213264325213+
ENSG00000219926chr136440298064418258-
ENSG00000227674chr136456050464650144-
ENSG00000235532chr137480559474834113+
ENSG00000261553chr137612390976381256+
ENSG00000261105chr137617883676210130-
ENSG00000228444chr137620540776206271+
ENSG00000236051chr137764964977672677+
ENSG00000234377chr137849382479191463+
ENSG00000233379chr137851329778519009-
ENSG00000227354chr137998044479998463+
ENSG00000215417chr139200007492006833+
ENSG00000223392chr139613169896186164-
ENSG00000247400chr139630098796329179-
ENSG00000233124chr139782472397831876-
ENSG00000224418chr139922949899231084+
ENSG00000260992chr139974007399740879+
ENSG00000228889chr139984863199852964-
ENSG00000203441chr13100151981100153306-
ENSG00000272143chr13103046980103048053+
ENSG00000269942chr13103331776103332308+
ENSG00000233532chr13107028911107030565+
ENSG00000229152chr13111547406111551519-
ENSG00000225760chr13111635654111642911+
ENSG00000267868chr13113619149113620445-
ENSG00000235280chr13113621798113623138-
ENSG00000233695chr13114518603114542321+
ENSG00000260910chr13114629487114631817-
ENSG00000258314chr141961176819643377+


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.