The Cancer LncRNome Atlas



Glioblastoma Multiforme (GBM)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in GBM

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000204091chr64030269340347624+
ENSG00000204092chr64031208340313890-
ENSG00000234753chr64146259141516359-
ENSG00000231113chr64290810242916098+
ENSG00000272223chr64300163543002143-
ENSG00000272170chr64304206943042477-
ENSG00000271754chr64348691843487462-
ENSG00000271970chr64352960943530156+
ENSG00000203362chr64355596743559099-
ENSG00000237686chr64396346044042389-
ENSG00000262179chr64418467644185973+
ENSG00000271857chr64538881645389742-
ENSG00000231769chr64606483046097443-
ENSG00000270761chr64744497947445308-
ENSG00000225791chr65244210552448783+
ENSG00000271367chr65321495653215503+
ENSG00000249379chr65336798353371717+
ENSG00000227885chr65360554753611820-
ENSG00000271218chr65378377253785586-
ENSG00000236740chr65379482053862465+
ENSG00000231441chr65670880056728876+
ENSG00000226803chr65697969257039034-
ENSG00000272541chr65818216958182746-
ENSG00000272316chr65823483858240189-
ENSG00000215190chr65827235258287779-
ENSG00000225096chr65829190858298496+
ENSG00000266680chr66428091064282313-
ENSG00000230910chr66933985469344919-
ENSG00000224349chr67112253171123653-
ENSG00000271967chr67130614171306683+
ENSG00000232295chr67193116072037931-
ENSG00000233237chr67205404772130472-
ENSG00000229852chr67397293874011124+
ENSG00000223821chr67420174874202465-
ENSG00000231652chr67440362674405854-
ENSG00000225793chr67599473076006719+
ENSG00000270362chr67994343579946514+
ENSG00000231533chr68013001480131022+
ENSG00000272137chr68027084980271319+
ENSG00000272129chr68106514181066576+
ENSG00000233967chr68115306181175644+
ENSG00000260645chr68117667581178797+
ENSG00000226453chr68255490282643197-
ENSG00000203875chr68637071086388451-
ENSG00000272008chr68786087787865003-
ENSG00000226524chr68808131188102519+
ENSG00000224345chr68841022888411243+
ENSG00000271931chr68978988389790386-
ENSG00000228124chr69038318890385502+
ENSG00000118412chr69053961390584155+
ENSG00000224944chr69233963392400146-
ENSG00000261366chr69602305996025326-
ENSG00000226684chr69773117997757924+
ENSG00000224849chr69815015798155979+
ENSG00000226207chr69815882998165073-
ENSG00000271860chr69826458598847748+
ENSG00000228506chr69987279899879249+
ENSG00000228439chr69996856999979794+
ENSG00000272017chr6100015973100016972+
ENSG00000260000chr6101329347101330863+
ENSG00000203808chr6105584183105617820+
ENSG00000272102chr6105721095105721635-
ENSG00000231628chr6105726891105729630+
ENSG00000272476chr6108278617108281190+
ENSG00000271734chr6108351453108351922-
ENSG00000225174chr6108444719108480596+
ENSG00000271730chr6109319685109320328+
ENSG00000260273chr6109703998109704869+
ENSG00000232311chr6110147725110149988+
ENSG00000230177chr6111599135111599945+
ENSG00000271789chr6111618329111619713+
ENSG00000272356chr6111630406111634720+
ENSG00000231889chr6111804714111919505+
ENSG00000255389chr6111921078111923498+
ENSG00000237234chr6112475967112487670+
ENSG00000230943chr6113944737113971276-
ENSG00000227502chr6114189178114194516-
ENSG00000228624chr6114290865114792869+
ENSG00000240050chr6116601362116691436+
ENSG00000272403chr6116765323116766023+
ENSG00000253194chr6119255950119352706+
ENSG00000225504chr6123391444123394072+
ENSG00000237742chr6125899704126070336-
ENSG00000233351chr6129800760129802555-
ENSG00000226149chr6129847771129873732-
ENSG00000227220chr6132272086132398533+
ENSG00000236166chr6132406224132420419+
ENSG00000228495chr6132453055132490514+
ENSG00000272428chr6133861922133862312+
ENSG00000232310chr6134846452134980974-
ENSG00000232876chr6135376171135381688+
ENSG00000231028chr6135818489136037193+
ENSG00000260418chr6136656852136657225-
ENSG00000272189chr6136871799136873692+
ENSG00000237499chr6138144810138189370-
ENSG00000225177chr6139013685139018425+
ENSG00000238099chr6139791301139794192-
ENSG00000231426chr6140175987140181288+
ENSG00000236013chr6140388572140414858+
ENSG00000234147chr6141167095141174061-
ENSG00000259828chr6141768148141772143+
ENSG00000227192chr6143360562143363461-
ENSG00000229036chr6143806116143828464+
ENSG00000270638chr6146056706146058354+
ENSG00000270828chr6146058047146058309-
ENSG00000235652chr6146136048146207721+
ENSG00000233452chr6147163037147525750-
ENSG00000225135chr6147708800147711601+
ENSG00000228408chr6149539062149565208+
ENSG00000225924chr6149564435149565137-
ENSG00000233330chr6149912891149913799-
ENSG00000231760chr6150117711150119308-
ENSG00000268592chr6150183733150240643+
ENSG00000223701chr6150205567150240644+
ENSG00000234577chr6152701681152702699+
ENSG00000227627chr6153304885153310358+
ENSG00000235381chr6155574273155577858-
ENSG00000271265chr6157095351157095796-
ENSG00000271551chr6157097494157098211-
ENSG00000271040chr6157744996157745509+
ENSG00000236537chr6158703295158733390+
ENSG00000271913chr6159409210159485957+
ENSG00000237927chr6160007987160010201-
ENSG00000224073chr6160060339160061133-
ENSG00000270949chr6160529406160532536+
ENSG00000231863chr6161352112161390803+
ENSG00000270419chr6163834097163834992-
ENSG00000228692chr6164007615164009197+
ENSG00000260422chr6164505055164506693-
ENSG00000227455chr6165241239165245119+
ENSG00000223414chr6166322290166401536-
ENSG00000261420chr6166796677166798312+
ENSG00000203688chr6168080306168084467-
ENSG00000198221chr6168224556168227389-
ENSG00000235994chr6168376604168380456-
ENSG00000229921chr6168393502168397757-
ENSG00000237987chr6168625959168627197-
ENSG00000223485chr6169558187169563019-
ENSG00000226445chr6169613349169639660+
ENSG00000226194chr6169770093169788480-
ENSG00000232640chr6170125187170125950-
ENSG00000266896chr6170170509170172138+
ENSG00000229214chr6170188886170198921-
ENSG00000231690chr6170190417170202969+
ENSG00000236173chr6170209414170210198-
ENSG00000271234chr6170606964170607463-
ENSG00000230423chr6171044839171045633+
ENSG00000242611chr77703880418+
ENSG00000242474chr7135853149466-
ENSG00000240859chr7149597155465+
ENSG00000261795chr7161765164972-
ENSG00000223855chr7560028564869+
ENSG00000237181chr7642822648119+
ENSG00000225146chr710686611083527+
ENSG00000257607chr710949961098897-
ENSG00000229043chr712000101204903+
ENSG00000225981chr714995731503644+
ENSG00000230487chr716097091629262+
ENSG00000175873chr724773982487485+
ENSG00000236708chr733036643342084-
ENSG00000241269chr754594585460398+
ENSG00000188365chr754594775462753+
ENSG00000230733chr755154355519442+
ENSG00000260054chr766944956696063+
ENSG00000228010chr767036056748532+
ENSG00000230825chr772947857317410+
ENSG00000234141chr779894847990340-
ENSG00000227719chr781536558156191+
ENSG00000244239chr783018638302451+
ENSG00000229970chr783018948384146+
ENSG00000230333chr71122135911559802+
ENSG00000226690chr71253605512581536+
ENSG00000229233chr71269380412694610+
ENSG00000229108chr71572800315735116+
ENSG00000272361chr71663325316633849-
ENSG00000235837chr71673549616759523-
ENSG00000237773chr71731945817338981-
ENSG00000260214chr71903746619042039+
ENSG00000232821chr71915209719153894+
ENSG00000236536chr71915955619161539+
ENSG00000243004chr71995860420180076-
ENSG00000233834chr72025720020261323+
ENSG00000271133chr72036792220371370-
ENSG00000232759chr72260295622613615+
ENSG00000225541chr72261122622701411-
ENSG00000232949chr72262932422631241+
ENSG00000179428chr72276501422767239-
ENSG00000228649chr72289387522901021+
ENSG00000230658chr72314084723145322-
ENSG00000226816chr72324563223247664+
ENSG00000223561chr72563297125790614-
ENSG00000270933chr72598827725989023-
ENSG00000225792chr72641176426416321-
ENSG00000214870chr72643821326538594+
ENSG00000233429chr72713526627139884+
ENSG00000253552chr72714739627173921+
ENSG00000254369chr72716959627195542+
ENSG00000253187chr72720823827211534+
ENSG00000240990chr72722413727228912+
ENSG00000243766chr72723819427246878+
ENSG00000234336chr72821994128283536+
ENSG00000176734chr72899297428997934-
ENSG00000228421chr72899728328998961+
ENSG00000223813chr72955438529603286-
ENSG00000225264chr72963841129724871-
ENSG00000227014chr73002821630065276+
ENSG00000227017chr73021600330218630-
ENSG00000196295chr73055592530634425-
ENSG00000263683chr73058983330591185+
ENSG00000236455chr73061712830625588-
ENSG00000236494chr73383278033842768-
ENSG00000271122chr73573482435739023+
ENSG00000227544chr73575605535774497+
ENSG00000228878chr73579457435840226-
ENSG00000232930chr73606922136095041+
ENSG00000260070chr73635938436360088+
ENSG00000188185chr73977323139832691+
ENSG00000259826chr73998712139989354-
ENSG00000203446chr74057772640586527-
ENSG00000224116chr74173351441818986+
ENSG00000261019chr74294087142942238-
ENSG00000228434chr74404364544047465-
ENSG00000235314chr74407877044081905+
ENSG00000239775chr74410450744105678+
ENSG00000260997chr74499859845000508-
ENSG00000232956chr74502262245026560-
ENSG00000223829chr74700930047067079+
ENSG00000236078chr74766153747669491+
ENSG00000228204chr75093444451090687+
ENSG00000229403chr75168194751698566+
ENSG00000231427chr75439839054417542+
ENSG00000224223chr75462466354639419+
ENSG00000234707chr75482711854872621+
ENSG00000224057chr75524744355256627-
ENSG00000233977chr75565976755660886+
ENSG00000231394chr75566147055662699+
ENSG00000236299chr76334857863361113-
ENSG00000244117chr76353916763545179+
ENSG00000189316chr76434890564350478-
ENSG00000179406chr76584103165866325-
ENSG00000223473chr76595608365958553-
ENSG00000237310chr76595869365960461+
ENSG00000229180chr76599291866007536-
ENSG00000226824chr76611952566134842+
ENSG00000235475chr76680096366805011+
ENSG00000234215chr76906094469062434-
ENSG00000225969chr77314936873150384+
ENSG00000232415chr77347390673476614-
ENSG00000232729chr77410327374143339-
ENSG00000265479chr77661026676673092+
ENSG00000250990chr77687565776887440-
ENSG00000214293chr77728697777325582-
ENSG00000234456chr77908219879100524+
ENSG00000232019chr78456866584569561-
ENSG00000224046chr78678073986781736-
ENSG00000182165chr78695454186974831-
ENSG00000254003chr78784597587848541+
ENSG00000228113chr78784867487921781+
ENSG00000264868chr78790020787903065-
ENSG00000238358chr78974861389752204-
ENSG00000223969chr79021993390226667-
ENSG00000242870chr79132132391510004-
ENSG00000188693chr79176391891810039+
ENSG00000243107chr79182932891836171-
ENSG00000244055chr79208687892120924+
ENSG00000237819chr79246579792546501+
ENSG00000236453chr79365214593695973+
ENSG00000236197chr79478402594843644-
ENSG00000231170chr79522599495243031+
ENSG00000272377chr79625131896293650-
ENSG00000231764chr79659483996643377-
ENSG00000242687chr79861078898645863+
ENSG00000244219chr79919568999208436+
ENSG00000242798chr79971283799724762-
ENSG00000235077chr79972858799738062+
ENSG00000241357chr7100032880100034133+
ENSG00000225807chr7100107340100117549+
ENSG00000224729chr7100187025100201829-
ENSG00000236305chr7100434936100450238-
ENSG00000227053chr7100657601100660889-
ENSG00000260336chr7100737328100741248+
ENSG00000232445chr7100951627100954266+
ENSG00000272544chr7101676303101677447+
ENSG00000226869chr7104379044104444554-
ENSG00000237513chr7104581510104602781+
ENSG00000228393chr7104590762104653491-
ENSG00000239569chr7104653872104654768-
ENSG00000272072chr7106833004106833745-
ENSG00000233705chr7107294421107302596-
ENSG00000241764chr7107383262107385026-
ENSG00000225647chr7108238819108254711+
ENSG00000227199chr7116592500116594388-
ENSG00000226367chr7116712126116786534-
ENSG00000234418chr7121856401121858491+
ENSG00000230316chr7121943712121950131+
ENSG00000241345chr7123634676123667713+
ENSG00000224897chr7124569927124819369+
ENSG00000227869chr7125071401125106455+
ENSG00000224138chr7126990182126991577+
ENSG00000271553chr7128307097128308210+
ENSG00000270810chr7128327342128327926+
ENSG00000271344chr7128330505128331771+
ENSG00000242902chr7128490216128502680-
ENSG00000135253chr7128502505128550773-
ENSG00000239815chr7128506633128508898+
ENSG00000240685chr7128808053128809538+
ENSG00000243230chr7128849616128853386-
ENSG00000229196chr7129781571129782455+
ENSG00000259920chr7130121332130124233-
ENSG00000270823chr7130135635130138268-
ENSG00000270953chr7130147501130148123+
ENSG00000271522chr7130474967130476483+
ENSG00000233559chr7130538479130613408+
ENSG00000226380chr7130565751130598069-
ENSG00000231721chr7130626519130794935-
ENSG00000236753chr7130994503131012981-
ENSG00000223436chr7132037093132052735+
ENSG00000224746chr7135611203135617629+
ENSG00000232053chr7135777673136122174+
ENSG00000228031chr7137029676137039229-
ENSG00000225559chr7137848186137849383+
ENSG00000260231chr7139877061139879440+
ENSG00000240889chr7140395136140396877-
ENSG00000261797chr7141212498141212983-
ENSG00000261570chr7141229003141251104-
ENSG00000244701chr7141352181141356610-
ENSG00000270157chr7141362722141363646-
ENSG00000228775chr7141404138141438146-
ENSG00000231840chr7142952357142984473-
ENSG00000232533chr7143076785143077588-
ENSG00000229153chr7143104906143220542+
ENSG00000244198chr7143891951143977640+
ENSG00000244479chr7143948357144053274-
ENSG00000197558chr7149473131149531068+
ENSG00000204934chr7149564786149577699-
ENSG00000261305chr7150038860150039696+
ENSG00000240449chr7150060866150069679-
ENSG00000239377chr7150076943150080973-
ENSG00000243433chr7150725868150726841-
ENSG00000244151chr7150771829150773617-
ENSG00000243836chr7151106247151110440+
ENSG00000239911chr7151574127151576299+
ENSG00000229591chr7151817086151818802-
ENSG00000261455chr7152160871152162634+
ENSG00000260426chr7155192617155194477+
ENSG00000182648chr7156264890156433286-
ENSG00000241558chr7156376854156398461-
ENSG00000224903chr7156446879156450387-
ENSG00000225666chr7156461646156469257-
ENSG00000235029chr7156799001156799826+
ENSG00000243479chr7156803499156809120+
ENSG00000233038chr7157647221157658784+
ENSG00000225365chr7158330187158332571+
ENSG00000231419chr7158799213158822886+
ENSG00000272240chr8184347184887-
ENSG00000249868chr8255306281026-
ENSG00000182366chr8325931333174-
ENSG00000272293chr8400714401343-
ENSG00000272005chr8424455427966+
ENSG00000253982chr817101561712668-
ENSG00000253696chr819195631924644+
ENSG00000253764chr819207361922803-
ENSG00000270988chr819229841923480+
ENSG00000254319chr825235912585991-
ENSG00000253853chr825848582680004+
ENSG00000246089chr862610726264663-
ENSG00000271743chr864731256474719-
ENSG00000249898chr864759966565730-
ENSG00000271927chr865035766506025+
ENSG00000186530chr866660386693166-
ENSG00000245857chr866930766742798+
ENSG00000215374chr871591337212876-
ENSG00000225725chr878125367866277+
ENSG00000253893chr880253418084136-
ENSG00000254340chr889989349002945+
ENSG00000248538chr890465219060364+
ENSG00000272267chr894126569414030-
ENSG00000253230chr897575749762876-
ENSG00000261451chr81029118210295822+
ENSG00000253641chr81033207510339484+
ENSG00000253649chr81034038810405095-
ENSG00000272505chr81034431710347176+
ENSG00000248896chr81058682410628902+
ENSG00000253695chr81069808610704011+
ENSG00000269918chr81096220110964214-
ENSG00000255310chr81096529810967236-
ENSG00000270076chr81106047411061180+
ENSG00000255020chr81120325711205011-
ENSG00000269899chr81170366311703900-
ENSG00000255052chr81197329112008698+
ENSG00000255495chr81205197612053789+
ENSG00000227888chr81221952712268510+
ENSG00000270074chr81227033612271882+
ENSG00000270154chr81233397112334631+
ENSG00000271948chr81708247317082978-
ENSG00000253944chr81765885417718578+
ENSG00000253671chr81766645017678377+
ENSG00000254054chr81776326517765396+
ENSG00000245281chr81794237717953903+
ENSG00000253557chr81894250219116979-
ENSG00000254040chr82088080720886569+
ENSG00000254064chr82211208922132675-
ENSG00000251034chr82239835822402918-
ENSG00000253200chr82247142122474170-
ENSG00000245025chr82284210922876848-
ENSG00000253616chr82292889022932001-
ENSG00000253930chr82304679223048188+
ENSG00000246582chr82308198423088439+
ENSG00000253837chr82319368423223638+
ENSG00000253390chr82331611423342484+
ENSG00000253986chr82335052223351711-
ENSG00000272163chr82476967824772230-
ENSG00000104725chr82480846824814624-
ENSG00000253476chr82528303725284096-
ENSG00000253875chr82759085527613943+
ENSG00000253690chr82810758028196772-
ENSG00000254370chr82827304128277572-
ENSG00000246339chr82855371828558981-
ENSG00000259366chr82891345228914202+
ENSG00000259607chr82892479628925971+
ENSG00000254129chr82896809028998246+
ENSG00000260253chr82920993729210687-
ENSG00000272256chr82994027429940983+
ENSG00000271869chr83001334630013748-
ENSG00000272375chr83005492030055564+
ENSG00000254109chr83023963530242917-
ENSG00000104691chr83058976430624522+
ENSG00000272327chr83262364332625477+
ENSG00000247134chr83285369632902373+
ENSG00000272338chr83321836133218933-
ENSG00000253642chr83346237433896526+
ENSG00000253123chr83718819037189502-
ENSG00000253746chr83726295737264242-
ENSG00000253161chr83727885937411701-
ENSG00000253414chr83737392837374539-
ENSG00000253181chr83757509737591274+
ENSG00000260949chr83792039937921309+
ENSG00000272128chr83795698937957449+
ENSG00000272092chr83823988238240979+
ENSG00000254981chr83825805438259201-
ENSG00000272159chr83826556638266260-
ENSG00000255201chr83827940738283614+
ENSG00000253645chr83882787938830530-
ENSG00000272479chr84037708440377677-
ENSG00000253133chr84139167441435887-
ENSG00000253174chr84139790041402563-
ENSG00000264578chr84146721141479021-
ENSG00000253389chr84151850941523084+
ENSG00000260588chr84168568341687452-
ENSG00000271938chr84199697941997270-
ENSG00000253408chr84209119342128715-
ENSG00000254165chr84239267242393447-
ENSG00000272233chr84240993342410336+
ENSG00000255366chr84810239548104885+
ENSG00000269924chr84843995948440710+
ENSG00000253688chr84946457549469001-
ENSG00000253484chr85073014650733504-
ENSG00000271148chr85081942350820006-
ENSG00000228801chr85281188552859733+
ENSG00000272024chr85286284452863250+
ENSG00000253844chr85287401852935534+
ENSG00000253369chr85430777154308506-
ENSG00000237807chr85442773154436491-
ENSG00000272457chr85478871054789209-
ENSG00000254142chr85546692155474487+
ENSG00000253151chr85643874556446511+
ENSG00000270907chr85644943156454613+
ENSG00000271722chr85692604656926727+
ENSG00000272343chr85713524757135732+
ENSG00000246430chr85740880557472382-
ENSG00000253821chr85840544358504118+
ENSG00000254139chr85865870858662758+
ENSG00000167912chr86003159960033905+
ENSG00000251396chr86129714761429354-
ENSG00000254777chr86182261261879116+
ENSG00000254802chr86187836161880334-
ENSG00000270673chr86408028464081001-
ENSG00000261542chr86412853964130592+
ENSG00000254377chr86528588565296344+
ENSG00000272010chr86650408566504707-
ENSG00000272155chr86662656966627013-
ENSG00000272192chr86675498766755566+
ENSG00000245910chr86783391967838633-
ENSG00000271966chr86825621068257322+
ENSG00000261658chr87057928470582549-
ENSG00000246528chr87074634670767206+
ENSG00000253143chr87138334771392858-
ENSG00000260838chr87385938573862680+
ENSG00000253636chr87396441373975296+
ENSG00000250295chr87420994674268696-
ENSG00000253302chr87433223974353761+
ENSG00000254288chr87496457575012088+
ENSG00000253983chr87511163175120676+
ENSG00000253596chr87525999275262285-
ENSG00000249395chr87613563976236976-
ENSG00000270866chr87731623377317326+
ENSG00000271167chr87731629377319373+
ENSG00000254300chr87731888977436591+
ENSG00000253661chr87740343577595513-
ENSG00000260398chr87951818779521940+


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.