The Cancer LncRNome Atlas



Glioblastoma Multiforme (GBM)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in GBM

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000248265chr125445203854516018+
ENSG00000250432chr125447891654519776-
ENSG00000250742chr125451988254526627+
ENSG00000260470chr125453885354541009-
ENSG00000257596chr125465639954672847+
ENSG00000258056chr125612288856124467+
ENSG00000257509chr125615533456156412-
ENSG00000257553chr125649839856507689-
ENSG00000258317chr125651381756523403-
ENSG00000257809chr125654458056552004-
ENSG00000258199chr125655614356584068-
ENSG00000257303chr125669392656708592+
ENSG00000257740chr125670265256703233+
ENSG00000259125chr125753840357541402-
ENSG00000224713chr125800590158013421-
ENSG00000257342chr125808791558115293-
ENSG00000257499chr125811754458119448-
ENSG00000257152chr125815879458162769-
ENSG00000270039chr125819762158198198+
ENSG00000269903chr125820827758208709+
ENSG00000257953chr125823087558236528+
ENSG00000245651chr125826361858290265-
ENSG00000257698chr125832531158329958-
ENSG00000257354chr126299653263007855+
ENSG00000255850chr126420262564215936-
ENSG00000255629chr126454016864541637-
ENSG00000256268chr126599664966006777+
ENSG00000239335chr126652453166528229+
ENSG00000251301chr126872666868845443-
ENSG00000247363chr126906815169081535-
ENSG00000257181chr126923506869237017-
ENSG00000247131chr127010741370132348-
ENSG00000257815chr127029781370637140-
ENSG00000257139chr127057411870595784+
ENSG00000257613chr127061291270615642-
ENSG00000258168chr127086186070932859+
ENSG00000257410chr127218763572193407-
ENSG00000236333chr127264728872668687-
ENSG00000257434chr127541474975438573+
ENSG00000257497chr127587790475883600-
ENSG00000257219chr127665361976698911+
ENSG00000257526chr127695607477009211+
ENSG00000231121chr127771842177966055+
ENSG00000257894chr127973498579897176-
ENSG00000257557chr128032868180334448+
ENSG00000257467chr128166445481706201+
ENSG00000269916chr128565732285658235+
ENSG00000258178chr128635246586354725+
ENSG00000246363chr128940445889413456-
ENSG00000271327chr128976158489763078+
ENSG00000271259chr128976559789766136+
ENSG00000270344chr128991943189934079+
ENSG00000258302chr128995490689987798+
ENSG00000271614chr129010273690106367+
ENSG00000258100chr129175597391762383+
ENSG00000245904chr129253934992583436+
ENSG00000266923chr129281530792877456+
ENSG00000257322chr129339719193609455-
ENSG00000257252chr129371091193771512-
ENSG00000246985chr129393623993965544-
ENSG00000258274chr129410156794131599-
ENSG00000257283chr129428874194337379-
ENSG00000258035chr129456178294579820-
ENSG00000257715chr129641910196421749+
ENSG00000258177chr129661657596617751-
ENSG00000255794chr129782543197958813+
ENSG00000257167chr129890675198910200-
ENSG00000257543chr12101802150101802838-
ENSG00000257703chr12103474728103572453-
ENSG00000257681chr12104140093104162636-
ENSG00000257999chr12105496250105500957-
ENSG00000257859chr12106097981106137840+
ENSG00000257711chr12107074536107078478-
ENSG00000257918chr12107108702107126844-
ENSG00000260329chr12107347807107349275-
ENSG00000258136chr12108130332108153745+
ENSG00000260987chr12109301517109303778-
ENSG00000256262chr12109490155109491757-
ENSG00000256139chr12109549023109563399+
ENSG00000255650chr12110171971110211313-
ENSG00000258210chr12110825268110883353-
ENSG00000257595chr12111807086111841114+
ENSG00000258099chr12112037302112038060+
ENSG00000257877chr12112250597112251224+
ENSG00000234608chr12112277571112280706-
ENSG00000270018chr12112335140112335710+
ENSG00000249550chr12114117264114211488-
ENSG00000255399chr12114845996114850636+
ENSG00000271579chr12115737393115738513-
ENSG00000258034chr12116398992116400538+
ENSG00000196668chr12116971227116974323+
ENSG00000258102chr12116985911116992186+
ENSG00000258249chr12117037075117041390+
ENSG00000255686chr12117890817117894791+
ENSG00000270482chr12118813155118814080-
ENSG00000255618chr12119210837119212942-
ENSG00000256884chr12119611870119614289-
ENSG00000256609chr12119619853119621064-
ENSG00000248636chr12119825792120105884-
ENSG00000255857chr12120639094120650941+
ENSG00000248008chr12120928131120933743-
ENSG00000256008chr12121067908121079394-
ENSG00000271769chr12121438289121439071-
ENSG00000261827chr12121625359121625835+
ENSG00000258435chr12121829765121837662+
ENSG00000256742chr12122018697122031409+
ENSG00000256392chr12122217514122241309-
ENSG00000212694chr12122233173122241812-
ENSG00000256546chr12122501212122506522+
ENSG00000270134chr12123210623123211051-
ENSG00000256028chr12123459867123467454+
ENSG00000235423chr12123736577123746030-
ENSG00000269980chr12123746607123746949+
ENSG00000270113chr12123773656123774230-
ENSG00000256092chr12123848415123850660+
ENSG00000247373chr12124066767124069662-
ENSG00000255839chr12124192149124192933-
ENSG00000270028chr12124410008124410630-
ENSG00000270005chr12124420169124420753-
ENSG00000269997chr12124450624124451176-
ENSG00000269938chr12124452570124453126-
ENSG00000270061chr12124454537124454891-
ENSG00000255906chr12124457788124796476+
ENSG00000214650chr12124997768124999359+
ENSG00000189238chr12127210816127230798+
ENSG00000256128chr12127214333127256957-
ENSG00000256001chr12127629617127631077-
ENSG00000256193chr12128399917128436097+
ENSG00000250208chr12130634894130646801-
ENSG00000255992chr12132409281132413896-
ENSG00000257000chr12132562348132565005-
ENSG00000256576chr12132671287132674240-
ENSG00000204583chr12133179736133187037-
ENSG00000236617chr12133464428133465169+
ENSG00000250790chr12133488056133489173+
ENSG00000226352chr132024876420250024+
ENSG00000229137chr132186154521868998+
ENSG00000224429chr132187765121922860-
ENSG00000262619chr132346879523490508-
ENSG00000232977chr132404071024061603+
ENSG00000205861chr132446302824471402+
ENSG00000228741chr132455394924609166+
ENSG00000205822chr132514101125171814+
ENSG00000234056chr132574696625754217-
ENSG00000260509chr132587426225875576-
ENSG00000230641chr132774639627757135+
ENSG00000234772chr132781041927810948-
ENSG00000261485chr132871098028712330-
ENSG00000179141chr133005065230061887-
ENSG00000238121chr133091440730951282-
ENSG00000225039chr133099365630996374-
ENSG00000237879chr133137734331384782+
ENSG00000224743chr133145607031507983-
ENSG00000236094chr133145668831457532+
ENSG00000230633chr133287229132872849+
ENSG00000230490chr133392934334250905-
ENSG00000234535chr133418510434185659+
ENSG00000223685chr133862495438717369-
ENSG00000236354chr133910748039119436-
ENSG00000233725chr134448285044604597+
ENSG00000227258chr134471668244813010+
ENSG00000170919chr134591548045965872+
ENSG00000235903chr134662694146687467+
ENSG00000231817chr134702947247060641-
ENSG00000227848chr134857552548576688+
ENSG00000229111chr134865127348654127+
ENSG00000231473chr134887064948877797-
ENSG00000231607chr135060126950699856-
ENSG00000229323chr135109506951101585-
ENSG00000237152chr135138199251423190+
ENSG00000233672chr135145082251484848-
ENSG00000269965chr135193570151936371-
ENSG00000270101chr135193679551937579-
ENSG00000236778chr135202650352126500+
ENSG00000231856chr135237843352387356+
ENSG00000272281chr135274184452908412-
ENSG00000230040chr136794651967954108+
ENSG00000261553chr137612390976381256+
ENSG00000261105chr137617883676210130-
ENSG00000228444chr137620540776206271+
ENSG00000236051chr137764964977672677+
ENSG00000234377chr137849382479191463+
ENSG00000271776chr137917026479173754+
ENSG00000227354chr137998044479998463+
ENSG00000228824chr138807946988323514-
ENSG00000272515chr138826016288261489-
ENSG00000215417chr139200007492006833+
ENSG00000238230chr139535194895355116-
ENSG00000227640chr139536497095368500+
ENSG00000247400chr139630098796329179-
ENSG00000243300chr139759353597636426-
ENSG00000224418chr139922949899231084+
ENSG00000260992chr139974007399740879+
ENSG00000228889chr139984863199852964-
ENSG00000203441chr13100151981100153306-
ENSG00000233009chr13101360579101711638+
ENSG00000272349chr13102369198102369728-
ENSG00000272143chr13103046980103048053+
ENSG00000270581chr13103053821103054807-
ENSG00000269942chr13103331776103332308+
ENSG00000233532chr13107028911107030565+
ENSG00000272274chr13107270158107283707+
ENSG00000232814chr13111154922111160526-
ENSG00000229152chr13111547406111551519-
ENSG00000225760chr13111635654111642911+
ENSG00000235875chr13111766159111768025-
ENSG00000229520chr13112760409112761196-
ENSG00000224243chr13112761433112762329+
ENSG00000267868chr13113619149113620445-
ENSG00000235280chr13113621798113623138-
ENSG00000269356chr13113663092113663738+
ENSG00000269376chr13113663985113664633+
ENSG00000225083chr13114005988114016183+
ENSG00000233695chr13114518603114542321+
ENSG00000260910chr13114629487114631817-
ENSG00000225210chr141965001819718563+
ENSG00000244306chr141985409819925348-
ENSG00000215394chr141988938619904890+
ENSG00000258768chr142072863920732467-
ENSG00000259001chr142081120720811844-
ENSG00000258515chr142091946420920077+
ENSG00000259171chr142115274621168735+
ENSG00000258451chr142116163921175279-
ENSG00000136315chr142138750021388458+
ENSG00000258471chr142146399621467322-
ENSG00000258604chr142149233121497430+
ENSG00000258441chr142166823821675059-
ENSG00000260830chr142185245121853079+
ENSG00000251002chr142284908322951948-
ENSG00000259054chr142302520523025956-
ENSG00000258458chr142317182023235771-
ENSG00000237054chr142338866523396105+
ENSG00000257285chr142339881823424771+
ENSG00000258457chr142345190723468287+
ENSG00000157306chr142398096924029987+
ENSG00000258727chr142403030624037282+
ENSG00000215256chr142440794024458048-
ENSG00000259321chr142460865424609653+
ENSG00000260669chr142467885224685193-
ENSG00000262119chr142706195327063723-
ENSG00000257842chr142706761827275673+
ENSG00000257185chr142727862327305664+
ENSG00000258548chr142808179428108842+
ENSG00000257126chr142919828929234483-
ENSG00000257056chr142925269729254993-
ENSG00000258525chr143134538531359014-
ENSG00000250365chr143188949231922089+
ENSG00000258655chr143254462532545999-
ENSG00000258612chr143501370535015183-
ENSG00000258738chr143534354935345665+
ENSG00000258704chr143539006435451738-
ENSG00000258938chr143628843036295971-
ENSG00000257272chr143634306336344509+
ENSG00000258342chr143636718836532949+
ENSG00000257585chr143653963336634494+
ENSG00000258844chr143668381336704814+
ENSG00000258696chr143847231838474052-
ENSG00000259048chr143850349238663486-
ENSG00000259070chr143921854539417477-
ENSG00000259083chr143964408939645084-
ENSG00000258940chr143973490739736265-
ENSG00000257900chr144584647145858489+
ENSG00000259129chr144823415748264295-
ENSG00000258486chr145005329750053596+
ENSG00000258377chr145008753350090198-
ENSG00000258929chr145047403150507947-
ENSG00000259071chr145079324450794627-
ENSG00000258857chr145086373150865063+
ENSG00000269906chr145112922951129896-
ENSG00000270062chr145119049551190990-
ENSG00000258745chr145137894451380076+
ENSG00000258711chr145142297751428720-
ENSG00000258955chr145177113451795104-
ENSG00000258479chr145180011151832275+
ENSG00000259049chr145324195553244458+
ENSG00000258985chr145350347353504969+
ENSG00000237356chr145363577254153976+
ENSG00000186615chr145596599656046828-
ENSG00000258791chr145624786456263406-
ENSG00000259969chr145846026358461243-
ENSG00000258682chr145873138058736399+
ENSG00000257621chr145873208358764852-
ENSG00000254718chr146070683960715483-
ENSG00000258670chr146098183761021634+
ENSG00000247287chr146176488261789536-
ENSG00000258926chr146200422662012005-
ENSG00000250548chr146202303162037371-
ENSG00000258777chr146214775962162541-
ENSG00000258667chr146218227662217815-
ENSG00000258964chr146220085662242978+
ENSG00000258903chr146257009662583893-
ENSG00000259796chr146257759362579268+
ENSG00000258403chr146258107162584284+
ENSG00000186369chr146258419762596352+
ENSG00000259093chr146358975163594932-
ENSG00000258943chr146376484463766265-
ENSG00000261242chr146401028764011382+
ENSG00000214770chr146479614964805317-
ENSG00000258824chr146488965364915275-
ENSG00000272158chr146547004365470485-
ENSG00000259118chr146554875265560930+
ENSG00000258561chr146667952866976112-
ENSG00000259038chr146909388369095162-
ENSG00000258623chr146915012869152282-
ENSG00000259062chr146944639969454180+
ENSG00000258957chr146964973769680809-
ENSG00000258520chr146970588369727284-
ENSG00000258644chr147079306970883701-
ENSG00000259158chr147093559870950473-
ENSG00000259153chr147127692271282120+
ENSG00000259146chr147175944271788531-
ENSG00000258813chr147352513973526123-
ENSG00000258376chr147371072673712687-
ENSG00000258944chr147373889073740789-
ENSG00000251393chr147392912973943880+
ENSG00000255242chr147395766973960096+
ENSG00000258603chr147408341274100644-
ENSG00000258660chr147416480674167054-
ENSG00000259065chr147425406374269973+
ENSG00000258586chr147428926274296838-
ENSG00000258891chr147436286774404817-
ENSG00000258559chr147475583074761128-
ENSG00000270000chr147493863374939063-
ENSG00000259005chr147494071074941567-
ENSG00000258425chr147501888475026751+
ENSG00000259606chr147531072775322378+
ENSG00000258646chr147547142275475184-
ENSG00000259138chr147559385675603633+
ENSG00000259687chr147576110775763341+
ENSG00000259319chr147589038675894444-
ENSG00000258454chr147670216076729817+
ENSG00000259124chr147696170677193055-
ENSG00000258569chr147717700177227731-
ENSG00000259081chr147724062777247861-
ENSG00000258610chr147724529577248592+
ENSG00000258301chr147724808377253067-
ENSG00000258819chr147753552377542687-
ENSG00000258999chr148157337781636758-
ENSG00000258675chr148190833181916501-
ENSG00000205562chr148599147785996332-
ENSG00000258733chr148640105486596117+
ENSG00000258867chr148849089488563276+
ENSG00000258789chr148901794189018837+
ENSG00000258752chr148981662989831043+
ENSG00000258920chr148988369889886137+
ENSG00000258424chr149086886790871579-
ENSG00000233208chr149092157490925249+
ENSG00000258884chr149128870991294472-
ENSG00000260810chr149172464391725347+
ENSG00000260711chr149222310392226142-
ENSG00000261372chr149251111992516990-
ENSG00000259634chr149252489692525877-
ENSG00000258584chr149437107694393412-
ENSG00000258933chr149542661495429313-
ENSG00000235706chr149562398295646263+
ENSG00000229645chr149587360695876427-
ENSG00000247092chr149599863496001209-
ENSG00000250366chr149634272996391908+
ENSG00000260806chr149696714796968658-
ENSG00000258702chr149705907097062099+
ENSG00000225163chr149740991697411731+
ENSG00000258749chr149997883899979913+
ENSG00000247970chr14100070893100092077+
ENSG00000258982chr14100673744100704892-
ENSG00000258504chr14100757454100760993+
ENSG00000258521chr14100806169100806891+
ENSG00000259031chr14101005276101006746+
ENSG00000258717chr14101142267101146221-
ENSG00000214548chr14101245747101327368+
ENSG00000258399chr14101361107101402336+
ENSG00000225746chr14101403738101426536+
ENSG00000232018chr14101426846101433377+
ENSG00000271417chr14101433989101452987+
ENSG00000223403chr14101536248101539274+
ENSG00000230805chr14101540206101544247-
ENSG00000259004chr14101587193101589879+
ENSG00000258498chr14102018558102026768-
ENSG00000258919chr14102095321102098867-
ENSG00000259088chr14102262892102276658-
ENSG00000271780chr14102414684102415762+
ENSG00000272444chr14102418753102419400+
ENSG00000258959chr14102502652102532565-
ENSG00000259515chr14103399911103403514+
ENSG00000259775chr14103798011103798704-
ENSG00000260285chr14103991347103995409-
ENSG00000258851chr14104019758104028214+
ENSG00000246451chr14104148699104150352-
ENSG00000270108chr14104153913104154464+
ENSG00000269910chr14104160853104161387-
ENSG00000269940chr14104160897104161507+
ENSG00000269958chr14104162690104163500+
ENSG00000269963chr14104179904104180586+
ENSG00000256050chr14105147483105151269+
ENSG00000258430chr14105235686105236608+
ENSG00000258701chr14105287538105290055+
ENSG00000258811chr14105309000105312253+
ENSG00000257556chr14105559946105565341+
ENSG00000251602chr14105883221105886076-
ENSG00000257270chr14105934130105936954-
ENSG00000260409chr152093507620961512-
ENSG00000247765chr152194114721968151-
ENSG00000260978chr152381241123814804-
ENSG00000224078chr152522470425664609+
ENSG00000270704chr152523001125230320+
ENSG00000271347chr152523663325236900+
ENSG00000257647chr152527288325277194-
ENSG00000257151chr152527702025281637+
ENSG00000270246chr152528706525287575+
ENSG00000261069chr152533280825334043+
ENSG00000259168chr152772818127787137-
ENSG00000259277chr152926239929269667-
ENSG00000256802chr152996719429973161+
ENSG00000259523chr153011483430116284+
ENSG00000270173chr153064996930650976-
ENSG00000270055chr153078016630782516+
ENSG00000260693chr153083229630838172+
ENSG00000270016chr153089989830900396-
ENSG00000269930chr153090916130909952+
ENSG00000247728chr153090920130917976-
ENSG00000269974chr153094100030941732+
ENSG00000270015chr153121871731220610+
ENSG00000259448chr153150822331516648+
ENSG00000259772chr153151420231523041-
ENSG00000261064chr153282824832879814+
ENSG00000262728chr153289861932907361-
ENSG00000244952chr153290593432907312+
ENSG00000259446chr153359585833602860-
ENSG00000259408chr153414710134149010-
ENSG00000259287chr153415091834157026-
ENSG00000248079chr153583839636151202+
ENSG00000259460chr153739154037392374+
ENSG00000259225chr153827696738354541+
ENSG00000236914chr153836168238365160-
ENSG00000261136chr154007477240077818+
ENSG00000248508chr154033151240359491+
ENSG00000259584chr154036740540370905-
ENSG00000259330chr154061741740618916+
ENSG00000259714chr154066402640664677+
ENSG00000261374chr154066659940668192+
ENSG00000259536chr154078024040850183+
ENSG00000245849chr154097892240987305-
ENSG00000261183chr154112800641136585-
ENSG00000251161chr154119900941201540+
ENSG00000247556chr154157618841601901+
ENSG00000260926chr154190166441904925-
ENSG00000260814chr154206295442064930-
ENSG00000174171chr154218499142190773+
ENSG00000272003chr154218813742189031-
ENSG00000258461chr154264030142704515+
ENSG00000261822chr154285922942862192-
ENSG00000246283chr154303131643035400+
ENSG00000261687chr154347627743477339-
ENSG00000179523chr154481945544829121-
ENSG00000259659chr154485002744851386+
ENSG00000259539chr154544486245459724-
ENSG00000259519chr154546254245492156+
ENSG00000259932chr154549071545491337-
ENSG00000261709chr154550664645507242-
ENSG00000259520chr154554388445571449-
ENSG00000259385chr154848438848493881-
ENSG00000259488chr154860455048624053-
ENSG00000259705chr154893814848944213+
ENSG00000261597chr154994433649948429+
ENSG00000244879chr155064752550659636+
ENSG00000259715chr155065164750652391-
ENSG00000259298chr155078939250790941-
ENSG00000259684chr155084979850852697+
ENSG00000259668chr155174948351752779+
ENSG00000259438chr155230319652311292-
ENSG00000259712chr155234887252392720-
ENSG00000259327chr155240877152414328+
ENSG00000259577chr155247229052498071+
ENSG00000260618chr155287003952890906+
ENSG00000259203chr155309381153097139-
ENSG00000225973chr155560938255611359-
ENSG00000261771chr155564744655790558-
ENSG00000247982chr155759256357599959+
ENSG00000259250chr155887970658883875+
ENSG00000245975chr155906027159063173-
ENSG00000259732chr155941323359425449+
ENSG00000259223chr156036586760410519-
ENSG00000245534chr156077137760922836+
ENSG00000259616chr156159252561927648-
ENSG00000259251chr156235270262354633+
ENSG00000259498chr156333823363341586-
ENSG00000259627chr156336222463364110-
ENSG00000259248chr156383644663893788-
ENSG00000264937chr156498882164989060+
ENSG00000259635chr156499344765011801+
ENSG00000260773chr156660725266624041-
ENSG00000269999chr156678099666781427-
ENSG00000261351chr156678208666784447-
ENSG00000259347chr156727869967351591-
ENSG00000259673chr156769595767814182-
ENSG00000270964chr156783341067834942-
ENSG00000261425chr156859112868593343-
ENSG00000212766chr156936526669388160+
ENSG00000259426chr156968924369707368-
ENSG00000245750chr156975536569863775+
ENSG00000259744chr157114122271142109-


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.