The Cancer LncRNome Atlas



Bladder Urothelial Carcinoma (BLCA)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in BLCA

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000238009chr189295133566-
ENSG00000241860chr1141474173862-
ENSG00000228463chr1227615267253-
ENSG00000237094chr1317720453948+
ENSG00000236601chr1453633460480-
ENSG00000231709chr1521369523833-
ENSG00000235146chr1523009530148+
ENSG00000230021chr1536816741274-
ENSG00000235373chr1677193685396-
ENSG00000240618chr1694412700305-
ENSG00000228327chr1700237714006-
ENSG00000237491chr1714162745440+
ENSG00000240453chr1745489753092-
ENSG00000177757chr1752751755214+
ENSG00000225880chr1761586762902-
ENSG00000228794chr1762988794826+
ENSG00000230368chr1803451812283-
ENSG00000230699chr1846815850328+
ENSG00000223764chr1852250855072-
ENSG00000272512chr1931346933431-
ENSG00000223823chr110723971079436+
ENSG00000272141chr111047371105723+
ENSG00000260179chr111851571186714-
ENSG00000230415chr112106031215800+
ENSG00000240731chr112529611254069-
ENSG00000272455chr113444761345998+
ENSG00000225905chr113556251358071+
ENSG00000225285chr113659191369953-
ENSG00000272106chr115491381551175-
ENSG00000272004chr115907861594063+
ENSG00000269737chr116034291604850+
ENSG00000268575chr116341751669127-
ENSG00000231050chr118229101824097+
ENSG00000233542chr119446521946969-
ENSG00000182873chr121132332115828-
ENSG00000243558chr121436102144013-
ENSG00000269896chr122818532284259-
ENSG00000272420chr122945002295067-
ENSG00000271921chr123062922306792-
ENSG00000271847chr123090562309799-
ENSG00000224387chr124237392424697-
ENSG00000229393chr124248762425918-
ENSG00000272449chr124779042478899+
ENSG00000238164chr124813592488470-
ENSG00000228037chr125129992515972+
ENSG00000177133chr129761792985001-
ENSG00000272088chr134038103404191+
ENSG00000238260chr135397543541307-
ENSG00000227372chr136525483663900-
ENSG00000272153chr137015723702102+
ENSG00000236423chr138169363833789+
ENSG00000226944chr162649006265840-
ENSG00000225077chr162963006299504+
ENSG00000237436chr168439526844903-
ENSG00000270035chr177583637758932-
ENSG00000269925chr178364437836835+
ENSG00000236266chr178703027887402-
ENSG00000236269chr189358478938066-
ENSG00000230679chr189388948939953+
ENSG00000228526chr192283279262678-
ENSG00000234546chr192422639252148+
ENSG00000231789chr197324849747613-
ENSG00000271989chr11048993810490734-
ENSG00000272078chr11069929810714390+
ENSG00000271895chr11108971611090585+
ENSG00000226849chr11112852811133154+
ENSG00000230337chr11115973211162157+
ENSG00000242349chr11190107411908136+
ENSG00000272482chr11267890612679250-
ENSG00000175147chr11544244815478960-
ENSG00000233485chr11565317615670372-
ENSG00000236045chr11566066215661960-
ENSG00000272510chr11589210615892451-
ENSG00000237301chr11591263115930121-
ENSG00000237938chr11604921416063391-
ENSG00000224459chr11606654616076391-
ENSG00000179743chr11616056016174642-
ENSG00000227959chr11648170616483824+
ENSG00000224621chr11648576116488378+
ENSG00000226029chr11678744316794976+
ENSG00000261135chr11684114016842249+
ENSG00000233421chr11686038116862144-
ENSG00000215908chr11694475116971178-
ENSG00000238142chr11721503317216144-
ENSG00000272426chr11723083417231271-
ENSG00000204362chr11751627817524112+
ENSG00000272084chr11939860419402005-
ENSG00000230424chr11953699519567198+
ENSG00000227066chr12048083120487061+
ENSG00000225986chr12051073520512979-
ENSG00000117242chr12096915020978686-
ENSG00000231105chr12161978321626267+
ENSG00000228397chr12235048722351461-
ENSG00000218510chr12235168122357716+
ENSG00000271840chr12242710622427853+
ENSG00000261326chr12360780223613245-
ENSG00000271420chr12370487323705522-
ENSG00000235052chr12387563023877406-
ENSG00000236810chr12408687224104777-
ENSG00000230023chr12452673024538183+
ENSG00000272432chr12557432825574812+
ENSG00000225643chr12590796925916847+
ENSG00000233478chr12597103525985602-
ENSG00000228172chr12614324026146263-
ENSG00000236782chr12649643826498312-
ENSG00000260063chr12701862327020622-
ENSG00000233975chr12798683927989233-
ENSG00000225886chr12799597927996787+
ENSG00000270031chr12814649428146852+
ENSG00000270605chr12856602028567964-
ENSG00000242125chr12883249228837404+
ENSG00000197989chr12890505028909495-
ENSG00000229388chr12896974028975093+
ENSG00000186056chr13119135131199674+
ENSG00000223382chr13129707531307131+
ENSG00000229167chr13203718632041174-
ENSG00000254545chr13225473132256923+
ENSG00000269967chr13231751432387442-
ENSG00000224066chr13267037032672415-
ENSG00000224409chr13318333533190838-
ENSG00000270115chr13372681333727281+
ENSG00000225313chr13377296733791644+
ENSG00000255811chr13522702735253698-
ENSG00000230163chr13531629535317156+
ENSG00000241014chr13543995735450914-
ENSG00000239636chr13603541436043330-
ENSG00000271914chr13639532136395716-
ENSG00000233621chr13792048037940012-
ENSG00000230955chr13832636938327252+
ENSG00000224592chr13851298638584697+
ENSG00000228436chr13932567239385068+
ENSG00000270040chr13967218439672629+
ENSG00000182109chr13998795240011859-
ENSG00000228060chr14003083240038875+
ENSG00000261798chr14025464840255843+
ENSG00000236546chr14036341740364770+
ENSG00000259943chr14072209940723639-
ENSG00000260920chr14092999140932436+
ENSG00000238287chr14095882940974333-
ENSG00000238186chr14098142640982846-
ENSG00000272145chr14115605241157738-
ENSG00000227527chr14280105742804047-
ENSG00000234917chr14314440643147325+
ENSG00000228452chr14324148443242461-
ENSG00000243153chr14330035243312093-
ENSG00000228192chr14330756943312058-
ENSG00000227533chr14342472043449029+
ENSG00000234694chr14382035543824329-
ENSG00000229431chr14385078443854826+
ENSG00000229372chr14391344743914315-
ENSG00000229348chr14391959843922666+
ENSG00000236200chr14416543644173809-
ENSG00000237950chr14441004244412223-
ENSG00000230615chr14450960044570647+
ENSG00000225721chr14522470945241482-
ENSG00000230896chr14616035646162747-
ENSG00000227857chr14660020346604753+
ENSG00000225667chr14692149546948147+
ENSG00000225506chr14756232547644943-
ENSG00000224805chr14764492247646011+
ENSG00000237424chr14789780547900313-
ENSG00000269113chr14822620048230668-
ENSG00000223814chr14822680448231219-
ENSG00000272491chr14869356048695233-
ENSG00000271782chr15090270050902978-
ENSG00000261664chr15179532651800996+
ENSG00000227070chr15198398152027301+
ENSG00000266993chr15225963752264824+
ENSG00000272100chr15281915952819549+
ENSG00000232993chr15353561053551174-
ENSG00000226754chr15370428253708455+
ENSG00000270172chr15370803653710212-
ENSG00000272091chr15449235654494172-
ENSG00000235741chr15498208554982932-
ENSG00000242396chr15535254855353674+
ENSG00000233203chr15535323655354523+
ENSG00000233271chr15544662355457947-
ENSG00000260971chr15671396656724243-
ENSG00000223956chr15688063556881638+
ENSG00000272226chr15927848059279014-
ENSG00000232453chr15934854059362375-
ENSG00000230812chr15948605959510286+
ENSG00000231816chr16023846760254520+
ENSG00000226476chr16100592161106163-
ENSG00000271200chr16220767062208096-
ENSG00000230798chr16378655563790112-
ENSG00000237852chr16595208965959871+
ENSG00000232284chr16829798668668670+
ENSG00000233589chr16894481268949222+
ENSG00000234264chr16896235969004310+
ENSG00000271992chr17091075470911219+
ENSG00000229956chr17154700771955652+
ENSG00000225087chr17321460473364823-
ENSG00000235927chr17834703378355224-
ENSG00000236268chr18343956583451891-
ENSG00000271576chr18454201484543614-
ENSG00000223653chr18574239885913807+
ENSG00000261737chr18716918587170145-
ENSG00000267272chr18759544887634881+
ENSG00000237505chr18900319689150887-
ENSG00000231999chr19004880090098453-
ENSG00000233593chr19124854391317207-
ENSG00000261311chr19286453192867613+
ENSG00000223745chr19372774393811582-
ENSG00000224093chr19405775694071130+
ENSG00000230439chr19421848094241000-
ENSG00000260464chr19431273094314495+
ENSG00000235565chr19508670795089740-
ENSG00000224081chr19510401795285837-
ENSG00000235501chr19539312295428826+
ENSG00000226026chr19562877595699538-
ENSG00000228852chr19570878195729610-
ENSG00000228084chr1100433939100435420-
ENSG00000261254chr1100496122100501188+
ENSG00000224616chr1100729565100731676-
ENSG00000235795chr1101461029101461816+
ENSG00000233184chr1101491434101552821+
ENSG00000225938chr1101701239101702084-
ENSG00000260940chr1101708714101709305+
ENSG00000215869chr1104615645104619709+
ENSG00000260879chr1108742548108744113+
ENSG00000238122chr1108803818108816311-
ENSG00000224698chr1108963311108975806+
ENSG00000270066chr1109642815109643241+
ENSG00000225113chr1110138847110140403+
ENSG00000228703chr1110171039110172927-
ENSG00000260246chr1110235739110236364-
ENSG00000258634chr1110600962110605177+
ENSG00000224965chr1110751456110752609-
ENSG00000224699chr1110925441110974982+
ENSG00000259834chr1111196182111199662-
ENSG00000261654chr1111478991111484975-
ENSG00000232811chr1111486089111495470+
ENSG00000260948chr1111973668111975690-
ENSG00000243960chr1111981260111983986-
ENSG00000231346chr1112142277112151345-
ENSG00000227811chr1112282463112290420+
ENSG00000231437chr1112532392112541464+
ENSG00000248201chr1112999440113006078+
ENSG00000215866chr1113362792113393265-
ENSG00000224167chr1113392650113420493+
ENSG00000226419chr1113499037113542118+
ENSG00000238198chr1113554309113615727-
ENSG00000226167chr1114399257114443859+
ENSG00000235527chr1114466622114472114-
ENSG00000203865chr1116941622116961197-
ENSG00000224950chr1117035645117041834-
ENSG00000236137chr1117568104117602112-
ENSG00000271427chr1117907521117908095-
ENSG00000224238chr1119590028119607408+
ENSG00000231365chr1119683019119818596+
ENSG00000260941chr1120140325120141894-
ENSG00000261662chr1120451878120453236-
ENSG00000236933chr1120835810120838343-
ENSG00000269996chr1121133256121134581+
ENSG00000230880chr1142618769142729975+
ENSG00000203849chr1142620645142714605-
ENSG00000234978chr1142803224142816004-
ENSG00000232274chr1143118704143211070-
ENSG00000230850chr1143119061143233417+
ENSG00000232336chr1143188828143189695+
ENSG00000225278chr1143211628143240439-
ENSG00000242569chr1143347958143379903+
ENSG00000185044chr1143354963143467658-
ENSG00000238261chr1143377281143404415+
ENSG00000223804chr1143647638143745417-
ENSG00000231734chr1143687097143720401+
ENSG00000226637chr1143719663143721171-
ENSG00000235398chr1144275918144341756-
ENSG00000236943chr1144456138144521970-
ENSG00000254539chr1144833168144835867-
ENSG00000223380chr1145096220145116922+
ENSG00000227280chr1145373054145375672-
ENSG00000233396chr1145376125145382397-
ENSG00000234222chr1145475982145508503-
ENSG00000234245chr1145952372145956451+
ENSG00000227733chr1146093234146159103-
ENSG00000234225chr1146473490146475177-
ENSG00000237188chr1146644350146724314+
ENSG00000271721chr1146647181146649319+
ENSG00000229952chr1147494090147498172+
ENSG00000231196chr1147762996147767966-
ENSG00000215863chr1147835127147931933-
ENSG00000237343chr1148760504148761583+
ENSG00000232527chr1148928322148951595+
ENSG00000268544chr1149575345149575767+
ENSG00000233368chr1149576594149577296-
ENSG00000269614chr1149587502149587988-
ENSG00000229801chr1149590752149591762-
ENSG00000223759chr1149672997149677289+
ENSG00000233030chr1149757215149764576-
ENSG00000264207chr1149802876149804109-
ENSG00000261716chr1149816065149820591-
ENSG00000228126chr1150488233150490508+
ENSG00000237781chr1150521040150530200-
ENSG00000259357chr1150937736150938734+
ENSG00000261168chr1151102551151104086-
ENSG00000237976chr1151319443151320503+
ENSG00000232536chr1151512992151534331+
ENSG00000269621chr1151728017151732387+
ENSG00000268288chr1151738962151739476-
ENSG00000203288chr1151763280151766878+
ENSG00000269489chr1151770530151771078+
ENSG00000234614chr1151814353151822861+
ENSG00000237975chr1152140601152339163+
ENSG00000236427chr1152178334152179533+
ENSG00000224308chr1152902516152921686-
ENSG00000238279chr1153506079153507591+
ENSG00000271853chr1153598808153606816-
ENSG00000272030chr1153603914153606873-
ENSG00000228013chr1154374804154379040-
ENSG00000270361chr1154909846154910535+
ENSG00000271380chr1154934301154935099+
ENSG00000232093chr1155017667155018594-
ENSG00000231064chr1155166659155175286+
ENSG00000229691chr1155279829155280381-
ENSG00000225855chr1155286654155293967-
ENSG00000235919chr1155531821155533775+
ENSG00000232519chr1155579339155580171-
ENSG00000236947chr1156416204156426369-
ENSG00000272068chr1156607575156610796-
ENSG00000272405chr1156611458156614679-
ENSG00000229953chr1156616299156631216-
ENSG00000223356chr1156682004156682966-
ENSG00000231666chr1158101834158110429-
ENSG00000225670chr1159165775159172302-
ENSG00000224259chr1159931008159948851+
ENSG00000260766chr1159994743159996584-
ENSG00000227741chr1160171989160178659-
ENSG00000228606chr1160231534160232568+
ENSG00000228917chr1161054255161057361+
ENSG00000235477chr1161337812161341754+
ENSG00000232995chr1163214295163291684-
ENSG00000269887chr1164649322164650036+
ENSG00000224358chr1165738166165744413+
ENSG00000272205chr1167189068167189749-
ENSG00000233411chr1167426620167427898-
ENSG00000232194chr1167789644167790462+
ENSG00000231407chr1170429594170501788-
ENSG00000271811chr1170636522170638566+
ENSG00000230630chr1172109461172113934-
ENSG00000203739chr1173386932173430501-
ENSG00000270084chr1173832386173833079+
ENSG00000234741chr1173833038173838020-
ENSG00000227373chr1174084438174129142-
ENSG00000227740chr1175873898175889649-
ENSG00000228686chr1175986413175987896+
ENSG00000236021chr1176176784176198466+
ENSG00000224687chr1178060643178063119-
ENSG00000260938chr1178449742178450341+
ENSG00000271783chr1179890139179894128+
ENSG00000260360chr1179922319179923575-
ENSG00000230124chr1180238788180245359-
ENSG00000243155chr1180913178180945618-
ENSG00000232586chr1180918835180924023-
ENSG00000272198chr1181060245181062035+
ENSG00000225982chr1182055686182059247+
ENSG00000261504chr1182584389182585764+
ENSG00000232860chr1183430009183440881-
ENSG00000270009chr1183589981183590626-
ENSG00000271387chr1184354887184355838-
ENSG00000260976chr1184970659184977815+
ENSG00000260088chr1200638635200663378+
ENSG00000224818chr1201433511201434274-
ENSG00000224536chr1201476369201502736+
ENSG00000223396chr1201487831201499602+
ENSG00000231871chr1201657387201798687-
ENSG00000223774chr1201862970201869106+
ENSG00000234678chr1201969222201979481-
ENSG00000249007chr1201980498201984785+
ENSG00000260800chr1202099159202100553+
ENSG00000226862chr1202573396202574421+
ENSG00000228288chr1202780082202781284+
ENSG00000234996chr1202830882202844369+
ENSG00000231507chr1203256280203257929+
ENSG00000233791chr1203267886203274437-
ENSG00000240219chr1204595903204598840+
ENSG00000229874chr1206135293206137984-
ENSG00000240754chr1206288156206306131-
ENSG00000261000chr1206677281206677789+
ENSG00000230937chr1209602165209606183+
ENSG00000227591chr1209834709209897470-
ENSG00000203706chr1210404801210407392-
ENSG00000153363chr1211556145211605878+
ENSG00000261252chr1211608414211608675+
ENSG00000260805chr1212731175212733073+
ENSG00000198468chr1213025450213031430-
ENSG00000229841chr1217665317217667625+
ENSG00000238042chr1222054323222151865-
ENSG00000232679chr1222215047222238105-
ENSG00000225265chr1222763167222766374+
ENSG00000228106chr1222988364223010726+
ENSG00000185495chr1224183659224198309+
ENSG00000263182chr1224196429224198314+
ENSG00000232628chr1224396449224400981-
ENSG00000237101chr1224407315224415745+
ENSG00000234476chr1225634945225653045-
ENSG00000272441chr1225674537225678899-
ENSG00000227496chr1225888306225939945+
ENSG00000242861chr1226028584226034223-
ENSG00000225518chr1226271340226277993+
ENSG00000234478chr1226335704226342772+
ENSG00000269890chr1228458144228462098-
ENSG00000269934chr1228462285228463767-
ENSG00000236975chr1229228562229230652-
ENSG00000177788chr1229394028229406775-
ENSG00000237481chr1229455150229458834+
ENSG00000226920chr1229576031229576767-
ENSG00000244137chr1230846444230931238-
ENSG00000223393chr1231010592231014761+
ENSG00000233461chr1231658134231664302-
ENSG00000229228chr1231727038231747836-
ENSG00000231663chr1234508553234509339-
ENSG00000231768chr1234663637234667525-
ENSG00000228830chr1234742754234745229+
ENSG00000228044chr1234782035234818922+
ENSG00000241475chr1234796017234802850+
ENSG00000227630chr1234859789234867390+
ENSG00000238005chr1235093089235105809-
ENSG00000232686chr1235333435235334206-
ENSG00000223776chr1236686369236687808-
ENSG00000230325chr1236703394236713580-
ENSG00000215808chr1238643684238649323-
ENSG00000233355chr1239866684239893765-
ENSG00000214837chr1243242159243265035-
ENSG00000227230chr1243299200243303890+
ENSG00000188206chr1245003940245018799-
ENSG00000260698chr1246845410246848377+
ENSG00000235021chr1246853349246855123+
ENSG00000260855chr1246935603246939074+
ENSG00000227953chr1246939315246955687+
ENSG00000259865chr1247350583247351828-
ENSG00000225140chr10674578677195+
ENSG00000232656chr1010686061090138+
ENSG00000237399chr1031838243210164+
ENSG00000226005chr1039767113978005+
ENSG00000233117chr1042777524285981-
ENSG00000231298chr1046923774720346-
ENSG00000224251chr1050376805039572+
ENSG00000205488chr1055562075568209-
ENSG00000242147chr1056369545638081-
ENSG00000231483chr1056504385652756-
ENSG00000228951chr1056588255660124-
ENSG00000232807chr1059790795987863-
ENSG00000237943chr1066223816627641+
ENSG00000259812chr1066281866628882+
ENSG00000223784chr1067793446780988+
ENSG00000238266chr1068215606884868+
ENSG00000197308chr1080924138095447-
ENSG00000232638chr1080935048095047+
ENSG00000243350chr1080942058095412-
ENSG00000225383chr101082640010836943-
ENSG00000225778chr101189161211936699-
ENSG00000228302chr101228675012289844-
ENSG00000268549chr101372452113726874+
ENSG00000229124chr101725623817271984-
ENSG00000234961chr101727532417276832-
ENSG00000260589chr101768328317685877-
ENSG00000240291chr101880204418834580-
ENSG00000152487chr101894019518948214-
ENSG00000233968chr101999925720017479-
ENSG00000231920chr102146294321463977+
ENSG00000261671chr102254671522547477+
ENSG00000272516chr102262133322621916+
ENSG00000271981chr102262151622621910-
ENSG00000224215chr102363288623634110+
ENSG00000232224chr102722013527230930-
ENSG00000254635chr102881158128821672-
ENSG00000224597chr102969833129776674+
ENSG00000259994chr103059175530594995-
ENSG00000237036chr103149520731609376-
ENSG00000237797chr103198201231996316-
ENSG00000227253chr103255521732558402+
ENSG00000229656chr103324777333371030+
ENSG00000238258chr103350020533502732+
ENSG00000226386chr103510469535105314+
ENSG00000269952chr103549934435499678+
ENSG00000271335chr103560348035625329-
ENSG00000237002chr103672754436731320+
ENSG00000226578chr103806429938073059-
ENSG00000236514chr103814666838148038+
ENSG00000185904chr104297099142990784+
ENSG00000272373chr104306963343134016-
ENSG00000259869chr104324662643247593-
ENSG00000230555chr104391618643917548+
ENSG00000226245chr104413932044140495+
ENSG00000230565chr104414139044143467+
ENSG00000204187chr104434075444346070+
ENSG00000226808chr104435485944390881+
ENSG00000229116chr104478770644789157-
ENSG00000231964chr104594001845948569-
ENSG00000272430chr104691414546917230-
ENSG00000229227chr104693746346951699-
ENSG00000231187chr104695147246966835+
ENSG00000223477chr104701175347174018-
ENSG00000254929chr104720780547243502-
ENSG00000244393chr105125314651371338-
ENSG00000272225chr105125378751262426-
ENSG00000226200chr105238891052391396+
ENSG00000236671chr105399050254073888-


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.