Mutation

 

The putative cancer-causing HAMPs driven by somatic mutations were predicted by integration of five complementary methods to identify the genes with mutations that have significant signs of positive selection during tumor evolution.

 

Summary of mutation frequency of the HAMPs in each cancer type


 Show   entries each page
 Jump to page  

 Total Page: 4 Total entries: 73
 
 Showing page 3  first page | previous page | next page | last page 
 
 Symbol  Gene ID  ACC_Mut%  BLCA_Mut%  BRCA_Mut%  CESC_Mut%  CHOL_Mut%  COAD_Mut%  DLBC_Mut%  ESCA_Mut%  GBM_Mut%  HNSC_Mut%  KICH_Mut%  KIRC_Mut%  KIRP_Mut%  LAML_Mut%  LGG_Mut%  LIHC_Mut%  LUAD_Mut%  LUSC_Mut%  MESO_Mut%  OV_Mut%  PAAD_Mut%  PCPG_Mut%  PRAD_Mut%  READ_Mut%  SARC_Mut%  SKCM_Mut%  STAD_Mut%  TGCT_Mut%  THCA_Mut%  THYM_Mut%  UCEC_Mut%  UCS_Mut%  UVM_Mut% 
CECR2  ENSG00000099954    1.09    1.7    1.37    3.11    0    4.68    0    1.63    1.02    2.96    1.52    0.27    1.07    0    0.2    0.55    2.29    2.89    0    0.73    1.69    0    0.6    3.33    2.54    7.51    4.1    0.69    0.2    0    8.87    0    0  
KIAA2026  ENSG00000183354    0    3.65    1.18    3.46    0    4.93    0    2.17    1.27    1.78    0    0    0.71    0.71    0    1.38    2.82    2.68    0    1.46    0.56    0    0.8    4    0.42    1.93    2.73    0    0    0    10.19    1.75    0  
BRD1  ENSG00000100425    1.09    1.46    0.39    1.73    0    4.43    0    1.09    1.02    0.99    1.52    0.81    0.71    0    0.59    0.28    1.23    0.82    0    1.21    0.56    0.56    0.4    2.67    0    4.29    4.78    0    0    0.81    9.43    1.75    0  
BRPF3  ENSG00000096070    1.09    2.19    0.69    2.08    0    4.43    0    0.54    1.78    1.78    0    1.36    0.36    0    0.2    0.55    1.23    2.27    0    0.73    0.56    0    0.2    1.33    0    4.51    2.05    0    0    0    5.28    0    0  
BRPF1  ENSG00000156983    1.09    1.95    0.69    1.38    0    3.45    0    0.54    0.51    0.99    0    0.27    0.36    0    0.2    1.93    0.71    1.03    0    0.49    0.56    0    1.21    2    0    3.43    3.19    0.69    0    0    6.98    3.51    0  
BRD7  ENSG00000166164    1.09    2.43    0.69    1.73    2.78    2.22    0    0.54    0.51    0.2    0    1.08    0    0    0    2.75    0.53    1.24    1.22    0.24    0    0    0    1.33    0.42    3    1.59    0    0.2    0.81    4.72    1.75    0  
BRD9  ENSG00000028310    0    0.97    0.29    0.35    0    1.97    0    1.09    0.76    0.99    0    0    0    0    0    1.1    0.88    0.62    0    0.49    0    0    0.2    0.67    0    2.15    0.91    0    0    0    3.77    0    0  
BAZ2A  ENSG00000076108    1.09    3.89    1.27    2.08    0    3.94    2.7    2.72    1.02    0.99    0    0.27    1.42    0    0.39    1.65    0.88    2.27    1.22    0.24    0.56    0.56    0    2    0.85    4.29    3.64    0.69    0    0    7.36    0    1.25  
BAZ2B  ENSG00000123636    2.17    6.08    1.96    2.42    0    4.19    2.7    3.26    1.78    3.35    0    2.17    1.07    2.84    0.39    2.75    4.41    5.36    2.44    0.97    0.56    0    0.8    2    0.85    6.44    4.56    0    0    0    11.51    1.75    0  
ATAD2  ENSG00000156802    0    5.6    1.08    3.11    0    3.94    0    2.72    1.02    1.18    0    0.81    0    1.42    0.59    2.48    3    4.74    0    1.46    0.56    0    0.4    2.67    0.85    4.08    5.24    0.69    0.41    0    10.57    3.51    0  
ATAD2B  ENSG00000119778    1.09    1.46    1.76    1.73    2.78    3.69    0    1.09    0.51    1.78    0    0.81    1.07    0    0    1.38    1.06    2.06    0    0.49    1.69    0    0.2    4.67    1.27    3    1.82    0.69    0    0    10.75    1.75    1.25  
BRD8  ENSG00000112983    0    2.68    0.69    1.38    0    3.69    0    1.63    0.76    1.78    0    1.08    1.42    0    0.2    1.1    1.76    2.27    0    0.97    0    0    0    2    0.85    3.43    3.19    0    0    0    5.47    1.75    0  
BRWD3  ENSG00000165288    2.17    1.95    1.86    5.88    2.78    8.13    2.7    1.63    2.04    4.14    0    1.36    0.36    0    0.39    1.1    7.05    8.66    1.22    1.94    2.26    0.56    0.2    3.33    0.85    5.15    5.01    0.69    0.2    0.81    13.77    1.75    0  
BRWD1  ENSG00000185658    1.09    5.11    2.16    5.19    2.78    5.17    0    1.09    1.02    2.17    0    1.36    1.78    4.26    0.78    1.38    1.94    3.09    1.22    1.46    1.69    0    1.01    4    0.42    5.15    6.38    0    0.2    0    11.51    7.02    0  
PHIP  ENSG00000146247    0    2.19    1.27    1.38    2.78    4.68    0    1.63    0.76    2.56    1.52    0.27    1.07    1.42    0.78    1.93    1.94    3.09    0    0.73    1.69    0.56    0.6    5.33    0    3.86    3.87    0    0.2    0.81    10    3.51    0  
HDAC1  ENSG00000116478    1.09    0.97    0.88    0    0    1.23    0    0    0.76    0.2    0    0.27    0    0    0    0.28    0.71    0.62    1.22    0.73    0    0    0.2    1.33    0    0.64    1.14    0    0    0    2.26    0    0  
HDAC2  ENSG00000196591    0    0.73    0.29    0.69    0    1.97    2.7    0    0.76    0.59    0    0    0    0.71    0.78    0.83    1.23    0.41    0    0    0    0.56    0.4    1.33    0    0.43    0.91    0    0    0    3.4    0    0  
HDAC3  ENSG00000171720    0    0.24    0.39    1.73    0    0.99    0    1.09    0.51    0.79    0    0    0    0.71    0.2    0.28    0.53    0.41    0    0.49    0    0    0.4    0.67    0.42    1.93    1.82    0    0    0    5.28    0    0  
HDAC8  ENSG00000147099    0    0.73    0.59    1.73    0    1.23    2.7    0    0.51    0.2    0    0    0.71    0    0    0.28    0.18    0.41    0    0.73    0    0    0.2    1.33    0    1.07    0.68    0    0.2    0    3.58    1.75    0  
HDAC11  ENSG00000163517    0    1.22    0.2    0.69    0    1.48    0    0.54    0    0.59    1.52    0    0.36    0    0.2    0.28    0.71    0    0    0.73    0    0    0    0    0    1.72    2.05    0    0    0    3.58    0    0  

 Showing page 3 
first page | previous page | next page | last page 








Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.